В Хабаровске и Владивостоке Е.В. Золотов создал пять академических лабораторий математического профиля, привлёк перспективных учёных к руководству ими. Основу научного коллектива составили молодые выпускники дальневосточных и сибирских вузов, которые под руководством известных учёных из Москвы, Киева, Ленинграда, Новосибирска — Н.В. Кузнецова, И.П. Кузнецова, А.И. Кондратьева, О.И. Берёзкина, В.Д. Степанова и других — успешно развивали исследования по важнейшим теоретическим направлениям, не забывая о прикладных разработках.
Из молодых сотрудников института и учеников Е.В. Золотова, многие стали докторами и кандидатами наук. А нынешний директор Вычислительного центра ДВО РАН Сергей Иванович Смагин и заведующий отделом Владимир Дмитриевич Степанов избраны членами-корреспондентами Российской академии наук.
Е.В. Золотову во многом обязаны своим становлением Дальневосточные математические школы-семинары для молодых учёных. Эти школы не только сыграли важную роль в становлении вычислительного центра, но и стали катализатором развития математических исследований во всём Дальневосточном регионе. На этих школах молодые учёные Дальнего Востока получали уникальную возможность общения в неформальной обстановке с ведущими учёными нашей страны.
Евгений Васильевич активно занимался разработкой методов планирования и управления, осуществлял научное руководство по решению задач системного анализа, работал над проблемами диагностики в медицине, участвовал в работах по применению аэродирижаблей в дальневосточном транспорте.
Он был главным конструктором дальневосточной сети вычислительных центров СССР. В начале 1990-х годов Академсеть создавалась как вычислительная сеть многоцелевого назначения. Был сформирован опытный участок Владивосток—Хабаровск—Новосибирск; первую очередь рабочей зоны сети представили четыре института ДВО АН СССР, расположенные в Хабаровске, Владивостоке, Благовещенске и Магадане. Преждевременная смерть большого энтузиаста этого проекта, заместителя директора Вычислительного центра ДВО АН СССР В.В. Дробницы, помощника Е.В. Золотова, и прекращение финансирования не дали возможности закончить данный проект.
Самым оригинальным увлечением Евгения Васильевича была китайская медицина. Еще в Калинине в 1970-е годы, когда он был профессором политехнического института, у него имелись ассистенты, с которыми Е.В. Золотов занимался изучением древних методов исцеления. В Хабаровске же подобрался и вовсе уникальный коллектив исследователей в области медицины Востока: врачи, биофизики, системные аналитики, программисты. С 1986 года после организации им лаборатории медицинской информатики (её возглавил кандидат медицинских наук, почётный профессор Академии традиционной китайской медицины В.А. Ионичевский) учёные Вычислительного центра проводили исследования социокультурных, медико-экологических и историко-географических процессов на Дальнем Востоке. Оригинальные результаты были получены при исследовании феномена культуры Древнего Китая — метода чжэнь цзю (т.е акупунктуры, или иглоукалывания. — Авт.-сост.).
В 1988—1990 годах Евгений Васильевич Золотов был президентом Дальневосточного отделения Общества психологов СССР, а в 1990 году стал председателем Межведомственной комиссии Академии наук СССР и Академии медицинских наук СССР по применению вычислительной техники и информатики в медицинских исследованиях. Е.В. Золотов награжден орденом Дружбы народов и многими медалями.
С именем академика Е.В. Золотова, как подчёркивают его коллеги по Академии наук, связаны крупные достижения в области создания теории эффективности, анализа и синтеза специальных сложных систем. Его многочисленные теоретические работы способствовали развитию многих современных направлений информатики, вычислительной и прикладной математики, системных исследований и автоматизированных систем. Результаты этих исследований стали классическими и получили широкое признание в России и за рубежом. Многочисленные ученики и последователи Евгения Васильевича продолжают начатые по его инициативе работы в удивительно широком диапазоне: от фундаментальных математических исследований до широкого спектра прикладных работ.