Зам. по морск. части и нач. Морского отдела военинженер 2 ранга М.Ф. Дедух
Зам. начальника войск по снабжению врид полк. И.Н. Просвирин
Начальник 1-го отдела (служба войск) подполк. Г.И. Окоев (погиб)
Начальник санитарной службы военврач 1 ранга Н.Ф. Перфильев (погиб 1942)
Зам. начальника отдела политпропаганды полк. ком. Н.И. Пономарев
Окружное управление военного снабжения полк. А.П. Чечин
6-й Ракверский морской пограничн. отряд полк. А.Е. Булыга ст. политрук П.К. Сувалов майор В.Ф. Нестеров (погиб)
Зам. по разведке и нач. 5-го (разведыват.) отделения капитан И.З. Ральников
8-й Хаапсалуский пограничный отряд полк. С.М. Буньков бат. ком. Г.Г. Ланин капитан К.М. Шишков (умер от ран)
Начальник инженерной службы ст. лейтенант В.Д. Абрамов (пропал без вести)
10-й Куресаарский пограничный отряд майор С.М. Скородумов бат. ком. З.Ф. Браславец майор И.Х. Кочергин
Зам. по разведке и нач. 5-го (разведыват.) отделения майор В.А. Шитов
Начальник 2-го (боевой подготовки) отделения капитан А.Г. Лошманов (погиб)
Начальник физической подготовки 2-го отделения лейтенант К.В. Шерстнев (погиб)
12-й Лиепайский пограничный отряд майор В.И. Якушев бат. ком. М.М. Рудченко майор В.А. Черников (погиб)
Зам. по разведке и нач. 5-го (разведыват.) отделения капитан В.А. Соловьев
Начальник 2-го отделения (боевой подготовки) майор М.Ф. Гавриляк
Начальник 4-го (строевого) отделения майор М.И. Дудин (плен)
Начальник санитарной службы военврач 3 ранга Г.И. Вахлис (плен)
99-й отд. погранотряд береговой охраны (п-ов Ханко) майор А.Д. Губин полк. ком. С.И. Иванов капитан М.В. Киблик
Зам. по разведке и нач. 5-го (разведыват.) отделения майор Г.П. Гриднев (осужден на год условно 1943)
Зам. начальника отдела политпропаганды бат. ком. И.Д. Чувашев
2-й Балтийский отряд пограничных судов (Таллин) капитан 3 ранга А.Н. Перфилов полк. ком. Г.Т. Земляков капитан 3 ранга Е.В. Гуськов
Внутренние войска
9-я дивизия НКВД по ОЖДС (Вильнюс) полк. В.Н. Истомин полк. ком. П.М. Ефимов (погиб) подполк. П.А. Гладченко (погиб 1944)
Начальник 2-го (разведывательного) отделения майор С.Н. Котов
Зам. начальника 3-го отделения (контрразведка) мл. лейтенант ГБ П.М. Гандрабуров (пропал без вести)
22-я мсд оперативных войск НКВД (Рига, с 26.6) подполк. А.С. Головко полк. ком. М.П. Звонов майор П.М. Ветров
Начальника 1-го (оперативного) отделения майор П.М. Ветров
Начальник 3-го отделения (контрразведка) лейтенант ГБ И.Д. Вершинин (погиб)
Главное управление милиции НКВД СССР
Зам. начальника управления милиции Латвийской ССР капитан милиции(=подполк.) Н.А. Москов
Начальник дорожного отдела ж.-д. милиции НКВД Латвийской ж.д. (Рига) капитан милиции А.П. Эглит
КРАСНОЗНАМЕННЫЙ БАЛТИЙСКИЙ ФЛОТ (КБФ, Таллин) вице-адм. В.Ф. Трибуц див. ком. М.Г. Яковенко (снижен, 42 восстан.) контр-адм. Ю.А. Пантелеев
Начальник 1-го (оперативного) отдела капитан 1 ранга Г.Е. Пилиповский
Начальник 2-го отделения ОО капитан 2 ранга Н.Г. Богданов
Командир по оперативной подготовке ОО капитан 3 ранга В.И. Андреев
Начальник 2-го (боевой подготовки) отдела (ОБП) капитан 2 ранга С.В. Кудрявцев
Командир по боевой подготовке 1-го отделения ОБП капитан 3 ранга В.П. Лихолетов (погиб 1942)
Командир по боевой подготовке ОБП капитан 3 ранга М.Н. Батов
Нач. 3-го (организационно-мобилизационного) отдела полк. А.С. Ильин
Начальник 1-го отделения 3-го отдела капитан 1 ранга В.Ф. Черный
Начальник 4-го (разведывательного) отдела капитан 2 ранга А.А. Филипповский (до 6.41)
Заместитель начальника РО подполк. Н.С. Фрумкин
Командир по оперативной РО капитан 3 ранга С.Е. Иванов (врид нач. РО с 6.41)
Начальник 1-го отделения РО капитан-лейтенант Л.П. Подошкин
Начальник организационно-строевого управления (ОРСУ) капитан 2 ранга М.А. Смирнов (погиб)
Начальник минно-торпедного отдела (МТО) капитан 2 ранга П.А. Попик
Начальник 2-го (торпедного) отделения МТО капитан 3 ранга С.Т. Баришполец
Инженер мастерской по ремонту торпедных аппаратов склада минно-торпедного отдела инженер-капитан-лейтенант И.В. Богомолов
Начальник инженерного отдела военинженер 1 ранга Т.Т. Коновалов
Зам. начальника инженерного отдела по строительству военинженер 1 ранга П.А. Балуков
Начальник 1-го особого строительного отдела (ОСО) военинженер 1 ранга А.И. Евстигнеев
Главный инженер и заместитель начальника 1-го ОСО военинженер 1 ранга А.Н. Кузьмин
Начальник особ. линейного строительства 02 1-го ОСО военинженер 2 ранга Н.И. Патрикеев