Начальник штаба Генерал-майор Н.Н. Нагорный
Начальник управления боевой подготовки Полковник С.И. Макеев (до 7.41)
Старший помощник начальника 2-го (зенитной артиллерии) отдела Майор Г.Д. Десницкий
Начальник 2-го отделения 2-го отдела Полковник С.К. Леандров
Старший помощник начальника 3-го тдела Военный инженер 1-го ранга С.М. Ткачев (умер, паралич сердца 1946)
Старший инспектор Полковник М.Д. Родичев
Начальник инженерного отдела Военный инженер 1-го ранга З.Г. Лопатин
Начальник отдела кадров Подполковник К.М. Соловьев
Начальник научно-исследовательского отдела врид Майор П.Ф. Адашев
Начальник отдела Военный инженер 1-го ранга А.И. Бровальский
7. Главное военно-инженерное управление (ГВИУ)
Начальник Генерал-майор инженерных войск Л.3. Котляр
Заместитель по политчасти Полковой комиссар А.А. Спассков
Заместитель Генерал-майор инженерных войск И.П. Галицкий (ио начальника ГВИУ 3–7.41)
Заместитель по строевой части Полковник П.В. Афанасьев
Начальник управления снабжения и заказов Генерал-майор инженерных войск И.А. Петров
Районный инженер управления снабжения и заказов Комбриг А.Н. Кривенко (уволен по болезни 1944)
Начальник управления военно-инженерной подготовки Полковник М.А. Нагорный
Начальник 1-го отделения 2-го отдела управления военно-инженерной подготовки Майор Г.И. Гускин (уволен 8.45)
Начальник отдела заграждения и минирования Полковник И.Г. Старинов (до 28.6)
Начальник отдела Военный инженер 2-го ранга П.М. Семенюк
8. Главное интендантское управление
Начальник Генерал-лейтенант интендантской службы А.В. Хрулев
Заместитель по политчасти Корпусный комиссар Г.С. Шимановский
Заместитель Генерал-майор П.Д. Давыдов
Помощник Генерал-майор технических войск А.Е. Крюков (умер от болезни 1944)
Помощник начальника тыла Генерал-майор технических войск Ф.Н. Зеленцов
Начальник управления военного снабжения Генерал-майор интендантской службы В.Н. Власов
Начальник управления продснабжения Генерал-майор интендантской службы В.Ф. Белоусов
Начальник вещевого управления Генерал-майор интендантской службы П.И. Драчев
Заместитель начальника вещевого управления Бригадный инженер Б.С. Палеев (уволен 1949)
Начальник 6-го отдела вещевого управления Военный инженер 1-го ранга М.И. Ртищев
Начальник КЭУ (квартирно-эксплуатационного управления) Генерал-майор интендантской службы Н.И. Найденов
Заместитель начальника КЭУ Генерал-майор интендантской службы Л.С. Колядко
Начальник обозно-хозяйственного управления Генерал-майор интендантской службы М.И. Финогенов (умер от болезни 1943)
Заместитель начальника обозно-хозяйственного управления Бригадный инженер П.Н. Скрозников
9. 3-е (контрразведывательное) управление (на правах Главного управления, 08.02.1941 — 16.07.1941 вкл.)
Начальник Дивизионный комиссар А.Н. Михеев (погиб)
Заместитель Дивизионный комиссар Ф.Я. Тутушкин (исключен из партии 1952, восстановлен 1954)
Заместитель Капитан госбезопасности(=подполк.) А.Н. Клыков
Заместитель — начальник Следственной части Майор госбезопасности(=комбриг) Н.А. Осетров (уволен по служебному несоответствию 1955)
Заместитель начальника Следственной части Старший батальонный комиссар С.Н. Павловский (с 6.41)
Начальник секретариата Бригадный комиссар Ф.Г. Петров
Помощник начальника — начальник 1-го отдела (Генштаб, Военная прокуратура, Военные трибуналы, редакция газеты «Красная звезда», Центральеый Дом Красной армии, Центральный театр Красной армии, мобилизационные отделы) Полковник И.И. Москаленко (уволен «по фактам дискредитации» 1954)
Начальник отделения 1-го отдела Старший батальонный комиссар И.А. Чертов
Заместитель начальника 3-го отделения 1-го отдела Батальонный комиссар С.Н. Карташов
Начальник 2-го отдела (ВВС, военные представители) Бригадный комиссар А.А. Авсеевич (лишен звания 1957)
Начальник 1-го отделения Старший батальонный комиссар В.И. Масленников (под следствием 2–4.53)
Начальник 3-го отдела (автобронетанковые, технические войска, артиллерийское снабжение, оборонное строительство, снабжение горючим, военные представители) Бригадный комиссар Н.Г. Ханников (умер 1948)
Начальник отделения Старший лейтенант госбезопасности(=майор) П.И. Уткин
Начальник 4-го отдела (санитарно-ветеринарное управление, управление учебных заведений, управление кадров, Главное управление ПВО, основные рода войск, руководство работой 3-их отделов периферии) врио Бригадный комиссар Г.С. Болотин (Болотин-Балясный)