На других театрах военных действий флотские батальоны также зарекомендовали себя с самой лучшей стороны. 21 августа 1799 г. на помощь австрийцам, осаждавшим Геную, был направлен отряд русских кораблей под командованием вице-адмирала П.В. Пустошкина. 4 декабря австрийский генерал Кленау, имея 15-тысячную армию, решился на штурм. Для атаки Пустошкин высадил гренадерскую и фузелерную роты батальона Бриммера (7 офицеров и 210 нижних чинов) под командованием майора А.Ю. Гамена. Согласно диспозиции русский отряд, обстреливаемый засевшими в садах и постройках французами, пробился через двое ворот и ворвался в город. Но в это же время австрийцы потерпели полную неудачу и отступили. Французы зашли в тыл ротам Гамена, которые, оказавшись в окружении, вынуждены были штыками прокладывать себе обратную дорогу. Тем не менее, при отходе роты освободили 48 австрийских егерей, только что захваченных французами. Отбиваясь от наседающего врага, Гамен вывел своих людей к незнакомому побережью. Здесь он обнаружил полуразрушенный бриг, на котором вывез десант в море за линию огня. Бросив якорь, Гамен на рыбачьей лодке отправился искать свои баркасы. К утру он вернулся со шлюпками и перевез солдат на русские корабли. В этом неудачном штурме храбрый десант потерял 38 человек убитыми, 18 ранеными и 19 пленными.
В июле 1799 г. эскадра капитана 2 ранга Н.Д. Войновича (3 русских фрегата, турецкие фрегат и корвет) блокировала с моря крепость Анкону. 14 июля в порту Пезаро высадились 287 человек русских и 150 турок при 5 орудиях под общим командованием капитана А.С. Сытина из батальона Скипора. На рассвете 15 июля десант предпринял штурм близлежащей крепости Фано, но гарнизон не только отбил атаку, но и сделал ответную вылазку. Тогда Войнович высадил еще 150 человек под командованием подпоручика Жиженкова (из батальона Бриммера) и подверг Фано бомбардировке. Теперь атаку крепости вели 200 солдат флотских батальонов, 70 матросов, 150 турок и подоспевшие 40 австрийских кавалеристов. Утром 17 июля гарнизон крепости вывесил белый флаг и начал переговоры о капитуляции. Спешивший на помощь из Анконы крупный французский отряд генерала Моннье не успел дойти до Фано всего 4 мили. В итоге в плен сдались 555 человек. Кроме того, в ходе боев французы потеряли убитыми 4 офицеров и 120 рядовых, а также 25 солдат ранеными. Потери русских составили убитыми 2 морских офицера и 14 нижних чинов, ранеными 23 человека. Турки потеряли убитыми 7 человек и 15 ранеными.
22 июля десант под командованием капитана 2 ранга Ф.Ф. Мессера (5 офицеров и 207 нижних чинов черноморских батальонов, 155 матросов, 14 артиллеристов, 160 турок, 200 местных роялистов) занял другой опорный пункт Сенигаллия. 25 июля морские солдаты неожиданным ударом захватили мост через реку Патракт и, опрокинув защищавших переправу французов, загнали их в Анкону. Было убито 2 французских офицера и 40 солдат, 10 человек взято в плен. Потери десанта составили 2 солдата и 2 матроса убитыми, 6 солдат и 4 матроса ранеными. После этого 28 июля вместе с итальянскими роялистами десантники взяли редут на горе Монтаньола. Русские отразили вылазку сильной французской колонны (700 человек), опрокинули ее и на плечах отступавших ворвались в редут. Отличившиеся в боях офицеры флотских батальонов капитан Сытин, поручик Кейзер и прапорщик Карпов получили в награду ордена Св. Анны 3-й степени. После этого успеха отряды итальянского ополчения, насчитывавшие около 13 тысяч человек, и десант Мессера окружили Анкону. В помощь им Войнович высадил с кораблей еще 112 морских солдат и матросов под командованием лейтенанта М.И. Ратманова. 1 августа началась трехмесячная осада Анконы, за время которой 8 августа и 19 сентября десант отбил две сильные ночные вылазки французов.
Фрунтовой мастеровой гренадерской роты 4-го батальона Балтийского гребного флота. 1797 — январь 1798 гг. Рисунок художника А.В. Каращука. 1998 г. Согласно принятому в 1797 г. «Уставу военного флота» десантные войска при штурме крепостей должны были «иметь с собою слесарей с их инструментами для подпиления и разломания железных преград, каковые могут встретиться, как то рогаток и тому подобного». В соответствии с этим в каждой роте флотского батальона полагался один фрунтовой мастеровой.
3 октября к Анконе пришли 8 тысяч австрийцев. Не желая делить близкую победу, австрийский генерал Фрелих всячески старался устранить русских и турок от дальнейшей осады. Он долго выжидал, но когда, наконец, решился атаковать передовые укрепления, то был отражен, потеряв убитыми 300 человек Во время штурма десант Мессера, пробившийся до самых ворот крепости, держался у них целый день, несмотря на приказы Фрелиха об отступлении. Потерпев неудачу, Фрелих 2 ноября 1799 г. сепаратно договорился с комендантом крепости Моннье о выходе гарнизона Анконы во Францию. После этого он занял крепость своими войсками и запретил впускать в нее русских и турок Тогда Войнович послал в гавань десант, который на моле и на сдавшихся французских судах поднял русские и турецкие флаги. Но по приказу Фрелиха австрийцы силою согнали русские караулы и заменили флаги австрийскими.