Непосредственно при проведении активной фазы учения российские и белорусские летчики из состава совместной авиационной группировки с аэродромов Мачулищи и Барановичи осуществили перехват воздушных целей. В отражении воздушного удара были задействованы самолеты Су-27СМ, Су-27УБМ1, Су-30 и МиГ-29БМ. Наведение истребителей на цели осуществлялось с борта самолета радиолокационного дозора и наведения А-50 российских ВВС.
29 апреля 2006 г. на аэродроме Барановичи по случаю торжественных мероприятий, посвященных 55-летнему юбилею со дня формирования 61-й истребительной авиационной базы, прошел «День открытых дверей». Все желающие смогли ознакомиться с наземной экспозицией, на которой были представлены самолеты МиГ-29БМ, МиГ-29УБ, Су-27П, Су-27УБМ1, а также взятые со стоянки хранения 558 АРЗ истребители МиГ-23МЛД и МиГ-23УБ. В гости к белорусским друзьям на своих Су-27 прилетела пилотажная группа «Русские Витязи», устроившая в небе настоящее авиашоу.
Не менее насыщенным событиями стал 2007 г. Во-первых, в части произошли кадровые изменения руководящего состава. Командир 61 иаб, полковник А.Э. Марфицкий был назначен на должность начальника управления авиацией ВВС и Войск ПВО РБ. 61 иаб возглавил полковник Ю.А. Воробьев, начальником штаба был назначен подполковник А.Н. Потехин.
Во-вторых, впервые в истории военной авиации Республики Беларусь, экипажи авиабазы выполнили посадки на участке автодороги Е30/М1 Минск—Брест в Ивацевичском районе Брестской области.
Согласно замыслу, истребители МиГ-29УБ №65 и Су-27УБМ1 №62, взлетевшие 4 августа с барановичского аэродрома, первоначально обозначили заход на посадку, снизившись до предельно малой высоты, а со второго захода совершили посадку. Первым, в 10 часов 19 минут асфальта коснулись шасси МиГ-29УБ, через шесть минут на полосе уже встречали Су-27УБМ1. После дозаправки самолеты вылетели на аэродром базирования. Все это время воздушное пространство в районе проведения учений патрулировала пара вертолетов Ми-24 из состава 181-й боевой вертолетной базы (аэродром Пружаны Брестской области).
МиГ-29УБ пилотировали заместитель командующего — начальник отдела авиации Западного оперативно-тактического командования ВВС и Войск ПВО Беларуси летчик-снайпер полковник Альфред Кравченок и заместитель командира 61 иаб летчик первого класса полковник Юрий Осовцов. В кабине Су-27УБМ1 находились командир 61-й авиабазы полковник Юрий Воробьев и командир первой эскадрильи подполковник Анатолий Мороз. За выполнением экипажами поставленной задачи наблюдали министр обороны Леонид Мальцев, командующий ВВС и Войсками ПВО Игорь Азаренок.
С тех пор данное упражнение стало регулярно отрабатываться белорусскими летчиками и вошло в перечень боевой подготовки.
За последующие три года летчики из Барановичей принимали участие в учениях «Осень-2008» (включая тренировки и посадки на авиационный участок автодороги), «Запад-2009», выполняли практическое применение авиационных средств поражения по наземным целям на полигоне Ружаны.
...30 августа 2009 г. при выполнении демонстрационного полета на истребителе Су-27УБМ1 №63 на авиашоу в польском городе Радом погибли заместитель командующего Западным оперативно-тактическим командованием ВВС и Войск ПВО полковник Александр Марфицкий и заместитель командира 61 иаб по летной подготовке полковник Александр Журавлевич. Ценой собственной жизни летчики увели в сторону падающий на зрителей истребитель.
В результате организационно-штатных мероприятий в августе 2010 г. в состав 61 иаб влился личный состав и техника 927 истребительной авиационной базы, дислоцировавшейся ранее на военном аэродроме Осовцы (Береза) и переформированной в базу беспилотной авиации. После этого объединения, в качестве эксперимента, в организационно-штатную структуру 61 иаб был введен новый элемент — тактическая авиационная группа (ТАГ), в состав которой вошли 1-я авиационная эскадрилья (на Су-27), 2-я и 3-я авиационные эскадрильи (на МиГ-29). Формирование ТАГ было закончено 1 февраля 2011 г.
Объединение двух истребительных авиабаз потребовало решить массу технических вопросов, касающихся авиационной техники и выполнения полетов, а также вопросы социально-бытового характера. Главной задачей командования базы на тот момент стало сплочение двух коллективов. Для этого все лучшие традиции 927 й и 61 й истребительных авиабаз были объединены, открыв тем самым новую главу в истории обновленной воинской части.
Объединение двух авиабаз привело к увеличению численности личного состава и изменению организационно-штатной структуры. Была сформирована третья авиационная эскадрилья на самолетах МиГ-29. Начальником штаба авиационной базы назначен полковник Ю.М. Гвоздь, заместителем командира авиационной базы по тылу — подполковник Н.М. Мороз, заместителем командира по идеологической работе — начальником отделения — подполковник Н.Е. Широкий, заместителем командира базы по вооружению — начальником вооружения — подполковник В. А. Самойлюк, заместителем командира базы по летной подготовке — полковник В.В. Павленко.
К несчастью, 23 сентября 2010 г. в истории части случилось еще одно трагическое событие: разбился МиГ-29УБ №63 с экипажем в составе военного летчика 1-го класса командира авиационной эскадрильи подполковника Сергея Коваленко и летчика 2-го класса заместителя командира авиационного звена майора Александра Жигайло. Катастрофа произошла в одной из пилотажных зон в районе деревни Раздяловичи, при выполнении элементов сложного пилотажа на малых высотах.
После череды аварий и катастроф, случившихся с истребителями белорусских ВВС, авиаторы, как люди суеверные и до этого момента не очень жаловавшие черное цветовое исполнение тактических номеров, обратились к командованию с ходатайством о возвращении на свои самолеты прежних бортовых номеров красного цвета, что и было сделано с 2011 г Необходимо добавить, что с июня 2009 г. на всех летательных аппаратах ВВС Республики Беларусь был изменен тип опознавательных знаков, наносимых на вертикальные поверхности — кили самолетов и борта вертолетов. На месте пятиконечный краснвтх звезд появилось изображение развивающегося государственного флага Республики Беларусь. Не стали исключением и самолеты 61 иаб.
В 2010 г. в состав авиабазы влился не только коллектив расформированной 927 иаб, но и молодое поколение летчиков, окончивших авиационный факультет Военной академии РБ. К концу года они закончили теоретическое и практическое переучивание с Л-39 на истребители МиГ-29 и Су-27. По итогам 2011 г. их налет был ненамного меньше, чем у подготовленных летчиков, и приближался к 60 часам. Инструкторами и наставниками молодых летчиков стали полковник Павленко, подполковники Пыжик и Григорьев, у которых этот показатель составлял 110—120 часов. О высоком уровне подготовки белорусских авиаторов красноречиво говорят цифры количества военных летчиков 1-го класса и летчиков-снайперов, их на базе соответственно 25 и 4.
На следующий год после объединения двух частей произошла очередная смена руководящего состава: командиром авиационной базы был назначен военный летчик 1-го класса полковник Александр Потехин, командиром ТАГ — полковник Владимир Павленко, командирами эскадрилий — подполковники Алексей Сорокин и Павел Карпюк, заместителями командиров эскадрилий по ИАС — майоры Олег Телющенко и Руслан Постоялко.
В 2011 г. проводилась подготовка к участию и проведению воздушного парада в честь Дня независимости Республики Беларусь над Минском в составе звена Су-27 (ведущий — полковник А.Н. Потехин), и звена МиГ-29 (ведущий — подполковник О.Н. Беликов). Была создана «нештатная» пилотажная группа «Крылы Беларуси («Крылья Беларуси»), состоящая из пяти истребителей Су-27. 19—20 апреля 2011 г. авиационную часть посетила делегация представителей 27 государств — участников ОБСЕ в рамках Венского документа 1999 г.