Такие посадки стали серьезным испытанием и для летчиков, и для вертолетов. Избежать грубых касаний земли удавалось далеко не всегда, Ми-6 даже иногда «козлил», но в абсолютном большинстве случаев крепкие основные стойки шасси выдерживали столь беспардонное обращение. И все же аварии случались. Один из таких инцидентов произошел в начале 1985 г. при посадке в Бамиане. Заход на эту площадку строился по узкой ложбине, а перед полосой находились старая крепость, ущелье и минное поле. Чтобы минимизировать вероятность попадания под обстрел душманов, снижались на пониженных оборотах двигателей с вертикальной скоростью около 30 м/с и при выводе чуть-чуть запоздали с дачей РУДов. Крепость и ущелье проскочили, но минное поле!... Когда вертолет остановился, в кабине еще какое-то время не было ни звука - каждый в шоковом оцепенении ожидал взрыва. Но все обошлось, а прочная конструкция Ми-6 выручила и в этот раз: самым существенным повреждением оказалась вывернутая передняя опора шасси. Через несколько дней бригада ремонтников восстановила машину, и она своим ходом вернулась в Кандагар.
Василий Иванович Ильин в 1985 г. находился в Афганистане в качестве помощника командира вертолета, где выполнил 260 боевых вылетов.
В Афганистане тяжелые милевские машины привлекались к эвакуации поврежденных вертолетов, перевозке раненых и тел погибших. Имелись и специальные Ми-6-топливозаправщики, с помощью которых обеспечивались керосином вертолеты других типов на труднодоступных площадках. При участии в боевых операциях от одного такого «борта» одновременно заправлялись два Ми-8 или Ми-24, причем двигатели на вертолетах не выключались. В 1983 г. на Ми-6 стали перевозить грузы для местного населения. К загрузке таких бортов привлекались афганцы, что дало возможность душманам провести целый ряд диверсионных актов - верные им люди подкладывали в мешки с продуктами мины. Экипажам Ми-6 приходилось выполнять и весьма необычные задания. Так, в 1987 г. они перевезли более 2 тысяч пуштунских беженцев, возвращавшихся из Пакистана. Те были собраны в специальном лагере в Кандагаре, откуда уже на Ми-6 доставлялись в Лашкаргах. Брали их на борт со всем домашним скарбом и даже дровами, очень ценившимися в пустыне.
Сергей Васильевич Солодкий в 1984-85 гг. находился в Афганистане в качестве штурмана вертолета, где выполнил более 200 боевых вылетов с общим налетом свыше 600 часов. Награжден орденом «За службу Родине в Вооруженных Силах» III степени.
Для высадки десантов Ми-6 использовались редко. Очевидно, командование опасалось больших потерь в случае сбития такого вертолета, ведь на борт «шестого» брали в 2 раза больше личного состава, чем на Ми-8. Если все же Ми-6 привлекались к боевым операциям, то шли во второй волне и садились на уже захваченные площадки. Так было в 1982 г. в Панджшере, в 1985 г. в районе Мазари-Шарифа, когда, кроме личного состава, были доставлены артиллерийские орудия, автомобили ГАЗ-66 и УАЗ. Участвовали Ми-6 и в скандальноизвестной высадке в районе Рабати-Джали (1982 г.), когда по ошибке десантники оказались заброшены на территорию Ирана. Уже при возвращении с задания душманы подбили машину м-ра Рыжова, когда та пролетала над зеленой зоной. Экипажу удалось совершить вынужденную посадку. Сразу же пришлось занять круговую оборону - со всех сторон лезли «духи». Надежды на спасение таяли: возвращавшиеся с той же высадки Ми-8 проходили один за другим и не садились. Однако такое поведение объяснялось просто - последней в группе шла машина ПСС, которая и забрала экипаж Рыжова. Оставленный Ми-6 на следующий день был расстрелян парой «восьмерок».
Специфика применения Ми-6 сделала практически бесполезным бортовой пулемет А-12,7. Его углы горизонтальной наводки составляли всего 30° вправо-влево, а обстрелам вертолеты подвергались в основном из задней полусферы. Правда, иногда к помощи пулемета прибегали штурманы для определения направления ветра перед посадкой на необорудованную площадку. По земле давалась короткая очередь, ветер сносил поднимавшуюся пыль, направление движения которой позволяло сориентироваться. Среди тех, кому довелось использовать «главный калибр» Ми-6, оказался и Валерий Леонтьев: после одного из афганских концертов авиаторы дали ему пострелять для полноты ощущений.
Владимир Андреевич Омельчук в 1987-88 гг. находился в Афганистане в качестве командира отряда, где выполнил 246 боевых вылетов с общим налетом 278 ч (из них 240 ночью). Награжден двумя орденами Красной Звезды.