Особенным успехом отмечено открытие перспективных районов в результате освоения Южного океана в водах Антарктики. Судами Управления “Югрыбпромразведки”, переименованным в 1995 году в ППП “Югрыбпоиск” совместно с учеными ЮгНИРО (в 1988 г. приказом Минрыбхоза СССР АзЧерНИРО был переименован в Южный научно-исследовательский институт морского рыбного хозяйства и океанографии) с 1967 по 2002 года в указанном регионе было выполнено 140 рейсов в Индийском океане и 43 рейса в Атлантическом. Были открыты, а затем переданы рыбакам “Азчерыба” огромные запасы мраморной и серой нототении, ледяной рыбы, трематомы, серебрянки в морях Содружества, Космонавтов, Скотия, залива Прюдс, а также в водах островов Южная Георгия. В 1977 г. при проведении экспедиционных работ были обнаружены колоссальные скопления криля в районе моря Содружества, после чего началось его промысловое освоение. На основе работ научно-исследовательских экспедиций на скоплениях криля в заливе Прюдс работали десятки советских промысловых судов. В 1979-1980 г.г. советский вылов криля достиг 120-135 тыс. т. за сезон.
Первооткрыватели новых районов в Антарктическом секторе были номинированы МРХ СССР в 1990 на соискание государственной премии СССР. Советский Союз, как морская рыболовная держава, завоевала мировое лидерство.
К 1990 г. благодаря соответствующему научному обеспечению‚ в т. ч. многочисленным разработкам и рекомендациям “АзчерНИРО” и Управления “Югрыбпромразведки” рыбаки ВРПО Азчеррыба ежегодно добывали 700-800 тыс.т. рыбы и морепродуктов. Входили в строй транспортные суда для доставки рыбы в места потребления. С 1991 года нашими рыбаками велся промысел патагонского клыкача в водах островов Кергелен (Франция) и Южная Георгия (Англия). До настоящего времени актуальны результаты траловых работ института на шельфе Антарктиды, в ходе которых получены высокие уловы антарктического клыкача в море Космонавтов у земли Эндерби.
В 1990-е г.г., вследствие перехода рыбодобывающих предприятий Крыма и ЮгНИРО под юрисдикцию Украины и уменьшения финансирования рыбохозяйственной науки сократились все виды океанических исследований. Были также снижены объемы работ и прерваны экспедиционные исследования в Азово-Черноморском бассейне, стал сокращаться интеллектуальный потенциал института. Расформированы и переданы другим предприятиям экспериментальные базы ЮгНИРО “Аршинцевская коса” и “Сиваш”.
В новом государстве не оказалось возможности содержать крупный океанический отечественный рыболовный флот. Растащены в частные руки и проданы на металлолом или по цене металлолома современные поисковые и промысловые суда, как среднетоннажные, так и крупнотоннажные. В результате были выведены из эксплуатации практически все рыбопромысловые, поисковые, научно-исследовательские и приемно-транспортные суда, которые перешли в 1991 году под флаг Украины. Рыбопромышленные и поисковые организации “Керчьрыбпром” и “Югрыбпоиск” были расформированы.
Государственное финансирование ЮгНИРО сократилось более чем в два раза. Сотрудники ЮгНИРО вынуждены работать в качестве научных наблюдателей на зарубежных промысловых судах, главным образом - в Антарктике на промысле антарктического и патагонского клыкачей.
В столь сложное и тяжелое время, ЮгНИРО принимал и принимает активное участие в работе международных рыбохозяйственных организаций и комиссий, сотрудничая с ФАО, АНТКОМ, НАФО, НИАФК, ЕВРОФИШ, ИНФИШ, ТАСИС, ЮНЕП, БСЕП, РФАРЕ и другими.
Несмотря на вышеупомянутые проблемы, с целью разрешения вопросов повышения биологической и промысловой продуктивности прибрежных вод на экспериментальной базе “Заветное” (под Керчью), созданной еще в 1969 году, институт активно занимался созданием научных основ марикультуры. Ученые ЮгНИРО успешно разработали основы биотехнологии получения жизнестойкой молоди лобана и сингиля, а также акклиматизантов (дальневосточная кефаль пиленгас, стальноголовый лосось и полосатый окунь). Кроме рыб важнейшими объектами марикультуры были также двустворчатые моллюски и устрицы. На экспериментальной базе “Заветное” выполнялись и выполняются работы по пополнению запасов промысловых рыб Азово-Черноморского бассейна путем выпуска в водоем жизнестойкой молоди кефалей, пиленгаса и камбалы – калкан. Институт стал учебно-производственной базой для студентов КГМТУ и филиала КЭГИТУ (г. Керчь).
При ЮгНИРО работает экспозиция морской фауны и флоры, в фондах которой насчитывается более 4 тыс. экспонатов, дающих представление о разнообразии растительного и животного мира Мирового океана и Азово-Черноморского бассейна. Научно-техническая библиотека института насчитывает свыше 85 тыс. рукописных трудов в области морской биологии, океанографии и других мореведческих наук. Институт располагает уникальным банком биологических, гидрометеорологических, океанографических и промысловых данных собранных в Мировом океане и Азово-Черноморском бассейне.
С вхождением Крыма в состав России, институт обрел второе дыхание. В настоящее время в Азово-Черноморском бассейне ежегодно проводятся полевые экспедиционные исследования на научно-исследовательских судах ФГБНУ “АзНИИРХ”.
Не так быстро, как хотелось бы, но начал возрождаться рыбный промысел в Азовском и Черном морях. В Азовском море в 2017 году в частных компаниях зарегистрировано 14 судов СЧС (в Керчи -12). В Черном море, главным образом в Севастополе - 10 судов типа СРТМ –К, 9 ед.- СЧС, 3 ед.- МРТР и 2 ед.-ТХС.
Уже отмечена положительная динамика роста уловов ценных промысловых рыб как пиленгаса, барабули, ставриды, азово-черноморской сельди, а в Черном море – шпрота и камбалы-калкан.
Керченское отделение ФГБНУ “АзНИИРХ” ЮгНИРО располагает кадрами и значительным опытом проведения рыбохозяйственных исследований имеющих мировую известность, участвует в решении многих сложных задач общегосударственного значения для обеспечения развития научно-технического прогресса и нормального функционирования рыбной отрасли России.
Хочется надеяться на возрождение в родном государстве отечественного океанического научно-исследовательского, рыболовного и транспортного флота, чтобы опять наши суда с российским флагом и русскими моряками бороздили Мировой океан, и чтобы вновь океаническая рыба серебряной рекой потекла на прилавки наших магазинов.