Уход начальников отделов, с которыми его долгие годы связывали отношения доверия, особенно Пикенброка и Лахоузена, означал для Канариса, хорошо понимавшего, что кольцо вражды и подозрений, разжигаемых против него руководителями СД, смыкалось все теснее, — подлинное бедствие. Однако ему удалось еще раз подобрать на важные посты первого и второго отделов разведки офицеров, которые совмещали высокие деловые качества с родственным ему образом мыслей и установкой но отношению к режиму. Руководителем первого отдела стал полковник генерального штаба Георг Ганзен, необыкновенно одаренный офицер, который до этого руководил отделом иностранных армий Запада, то есть отделом, которому вменялись в обязанность анализ и оценка всех сообщений, касающихся сухопутных вооруженных сил противника на Западном фронте, поступавших как из разведки, так и из других источников информации. В связи с этим он уже много лет сотрудничал с абвером и пришел на новую должность с полным знанием и пониманием дела. Хотя он разделял политические убеждения Канариса и принимал активное участие в нелегальной деятельности против системы, ему долгое время удавалось вводить гестапо в заблуждение относительно своих подлинных взглядов. Это заблуждение было настолько полным, что, как мы еще увидим, после провала Канариса ему было доверено руководство военной разведкой, включенной в состав имперской службы безопасности. Похоже, Канарис после ухода из разведки был не согласен со многим, что делал Ганзен. У него создалось впечатление, что тот был слишком уступчив. Однако справедливость его суждения сегодня уже нельзя проверить, тем более что после покушения 20 июля 1944 г., в подготовке которого Ганзен активно участвовал, он сам стал жертвой мести Гитлера.
Из новых сотрудников ближе всех к Канарису был полковник Фрейтаг-Лорингхофен, которому в конце лета 1943 г. было поручено руководство вторым отделом абвера. Фрейтаг был балтиец; до начала Первой мировой войны он воспитывался в Санкт-Петербурге, затем весной и летом 1919 г. в составе прибалтийских войск боролся с большевиками, а после непродолжительной службы в латвийской армии был принят в немецкий рейхсвер. Один его товарищ говорил: «Фрейтаг унаследовал от своей русской родины (он говорил свободно не только по-русски и по-латышски, но и владел многими русскими диалектами) способность сочувствовать другим людям в их беде. Он сам страдал несказанно из-за ужасного несоответствия между солдатским долгом и собственной совестью. Весь он был отмечен богом». Канарис знал и ценил Фрейтага уже по его прежней деятельности в отделе 1-е группы армий «Юг» на Восточном фронте. Фрейтаг вскоре завоевал и его личные симпатии. Причиной этому было не в последнюю очередь определенное сходство их установок к проблемам жизни. Также Фрейтаг склонялся к метафизическому и фаталистическому образу мышления, подобному тому, который во все большей степени проявлялся у Канариса.
В связи с усилиями, которые Канарис прилагал, чтобы воспрепятствовать расширению войны, следует упомянуть также и Швейцарию. Нет никаких сомнений по поводу того, что Гитлер во время войны несколько раз обдумывал идею присоединить и Швейцарию к «новой, более прекрасной Европе» под его господством, хотя дело не дошло ни до конкретных военных приготовлений, ни до конкретных действий против Швейцарской Конфедерации. Осенью 1942 г. Риббентроп направил немецкой дипломатической миссии в Берне требование сообщить о том, на какой период времени Швейцария обеспечена продовольствием и сырьем. В подробном отчете посольство ответило, что Швейцария благодаря своей предусмотрительной экономической политике накопила столько сырья и продовольствия, что сможет продержаться в экстренной ситуации около двух лет. Какого типа планы немецкий посланник Кёхер разглядел за этим запросом Риббентропа, видно из того, что к своему отчету он приложил указание на то, что швейцарцы — упорный и крепкий горный народ, который в случае нападения окажет ожесточенное сопротивление. То, что швейцарцы отдадут жизненно важные пути через Готард и Симплон неразрушенными в руки завоевателя, совершенно исключено. Кроме того, в случае нападения на Швейцарию нельзя будет рассчитывать на улучшение положения с транспортными перевозками через Италию.
С согласия Кёхера советник посольства Тео Кордт, прикомандированный к дипломатической миссии в Швейцарии, сообщил Канарису о запросе Риббентропа и ответе миссии. Вслед за этим Канарис в своем отчете вышестоящим военным ведомствам в эффектной форме подчеркнул волю к сопротивлению, а также экономическую и оборонную мощь Швейцарии, сочетающуюся с ее благоприятным географическим положением. Общими усилиями дипломатической миссии и разведки, похоже, удалось отговорить Гитлера от планов нападения на Швейцарскую Конфедерацию. Незадолго до увольнения из разведки Канарис во время своей последней поездки в Берн опять с удовлетворением говорил об этом успехе совместных усилий, в результате которых было предотвращено нападение на Швейцарию.