Куда хуже обстояло дело с пополнением Черноморского флота. Достроить выведенные из Николаева и Севастополя корабли в портах Кавказа невозможно, а потери есть. Кроме того, как показал опыт первых месяцев войны и в особенности Керченско-Феодосийской десантной операции, на Черном море очень нужны малые корабли — катера, десантные суда. Их нехватка отрицательно сказывается на боевых действиях в районе Керченского пролива, у побережья Восточного Крыма. Между тем Крымскому фронту, образованному в конце января 1942 года, не удалось пока что вырваться с Керченского полуострова: до середины апреля его войска трижды переходили в наступление, но безрезультатно. Возможно, поэтому потребуется вновь высаживать десанты. Учитывая это, Л. М. Галлер приказал готовить переброску катеров различного назначения по железной дороге на побережье Кавказа. Таким же путем должны быть доставлены Черноморскому флоту баржи, разрезанные на секции. В Батуми и Поти баржи предстояло собрать, спустить на воду.
Конец весны 1942 года был отмечен нашими неудачами на фронтах. Немцы прорвали оборону Крымского фронта на Керченском полуострове, и к 19 мая вынудили его войска эвакуироваться на Тамань, 4 июля после ожесточенных боев был оставлен Севастополь. Потерпев поражение в Харьковском сражении, войска Юго-Западного фронта, а затем Брянского и Южного фронтов отступали на восток. В июле дивизии вермахта развернули наступление на Сталинград, продвигались в горах Кавказа и на Черноморском побережье…
С апреля в Крыму и на Северном Кавказе находился И. С. Исаков, назначенный заместителем главнокомандующего Северо-Кавказским направлением С. М. Буденного. 23 апреля из Москвы в Краснодар вылетел нарком ВМФ Н. Г. Кузнецов. И вновь Галлеру пришлось быть за наркома и заняться кругом дел первого замнаркома. Почти полгода пробыл И. С. Исаков на юге. К исполнению обязанностей начальника ГМШ он во время войны уже не возвратился. До осени 1942 года он на Северном Кавказе, координирует действия Черноморского флота, оперативно подчиненного поочередно Крымскому, Северо-Кавказскому и Закавказскому фронтам, с сухопутными войсками. 10 октября 1942 года И. С. Исаков был тяжело ранен близ Туапсе во время налета авиации противника. «Война вывела из строя начальника Главного морского штаба адмирала И. С. Исакова, — вспоминает Н. Г. Кузнецов. — После ранения в 1942 году он уже не мог вести эту работу, и эту должность фактически выполнял длительное время замещавший начальника ГМШ контр-адмирал В. А. Алафузов. Галлер стал выполнять функции не только по кругу своих прямых обязанностей, но и как первый заместитель наркома»[269].
Между тем и по должности замнаркома по кораблестроению и вооружению работы у Галлера было более чем достаточно. К лету 1942 года подошла к концу подготовка к переходу с Дальнего Востока в Баренцево море Северным морским путем «Экспедиции особого назначения — 18»: лидера «Баку», эсминцев «Разумный» и «Разъяренный». «Решением этого вопроса также занимался Л. М. Галлер»[270], — свидетельствует нарком Н. Г. Кузнецов.
С осени 1942 года в пути также находились подводные лодки тихоокеанцев. Они следовали на Северный флот через Панамский канал, пересекая Тихий океан и Атлантику. Л. М. Галлер, проанализировав все «за» и «против», убедил наркома в целесообразности этого маршрута — слишком рискованно было вести подводные лодки через арктические льды. Первыми вышли 25 сентября из Петропавловска-Камчатского подводные минные заградители «Л-15» и «Л-16». Лев Михайлович облегченно вздохнул, когда получил донесения, что они пришли в американскую базу Датч-Харбор на Алеутских островах. Несчастье, однако, было впереди: на пути к Сан-Франциско «Л-16» торпедировала неизвестная подводная лодка. «Л-15» продолжала переход уже одна… Галлер тяжело переживал гибель лодки. Может быть, следовало все же переводить Северным морским путем? Менять что-либо, однако, было уже поздно: в начале октября из Владивостока вышли тем же маршрутом четыре подводных лодки типа «С». В декабре они пришли в канадский порт Галифакс, где уже находилась «Л-15». Преодолевая штормы и обходя районы, где действовали немецкие субмарины, наши лодки двумя отрядами — в марте и в июне 1943 года — пересекли Атлантику и достигли берегов советского Заполярья.
Много внимания Галлер уделял и пополнению Северного флота кораблями, получаемыми от США по ленд-лизу. Еще в июле 1942 года, вспоминает контрадмирал Б. В. Никитин, его вызвал Л. М. Галлер. Замнаркома сообщил, что ему надлежит вместе с семьей, в числе других представителей Наркомата ВМФ, выехать через Владивосток в США. Цель командировки — принимать у американцев корабли и переправлять их на Северный флот. Б. В. Никитин рассказывал, что Л. М. Галлер, с которым он встречался по службе не раз, всегда все понимал с полуслова, легко ориентировался в самых сложных специфических вопросах катеростроения, боевого использования катеров. «Он чуток ко всему новому, прогрессивному — работать с ним удивительно хорошо»[271], — свидетельствует Б. В. Никитин. Вот и инструктируя его перед отъездом в США, Галлер со знанием дела охарактеризовал торпедные и противолодочные катера, тральщики, которые предстоит принять у американцев, особо остановился на необходимости быстро и полно освоить методологию противолодочной подготовки в ВМС США, изучить аппаратуру учебных центров, подумать, какие тренировочные комплексы следует закупить для нашего флота. Он говорил, что в противолодочной обороне, в борьбе с немецкими подводными лодками флоты США и Великобритании накопили громадный опыт. Его нужно освоить возможно лучше. Следует ожидать активизации действий немецких подводных лодок у нас на Севере. Поэтому необходимо организовать интенсивное обучение наших катерников в учебных центрах ВМС США…