11. Заместителю народного комиссара внутренних дел СССР тов. Масленникову выделить из войск Киевского и Белорусского пограничных округов в распоряжение начальников оперативно-чекистских групп для выполнения специальных заданий по одному батальону численностью 300 человек каждый. Тов. Масленникову к 22.00 9 сентября представить срок готовности и расчёт по формированию батальонов.
12. Тов. Круглову иметь резерв 300 человек из террит. органов НКВД. Список резервов закончить к 10 сентября.
13. Тов. Серову и тов. Цанава о ходе работы доносить ежедневно к 18.00 по телеграфу.
14. Для организации и проведения всех необходимых мероприятий, а также для соответствующего инструктажа командировать: на Украину — заместителя народного комиссара внутренних дел СССР тов. Меркулова, а в Белоруссию — начальника Особого отдела НКВД СССР тов. Бочкова.
Народный комиссар внутренних дел СССР Л. Берия».
Уже через сутки народный комиссар внутренних дел УССР Серов сообщил в Москву о выделении работников и ходе комплектования оперативных групп. Секретность и срочность комплектования оперативных групп объяснялась тем, что из их личного состава планировалось сформировать территориальные управления НКВД в областях Западной Украины. 12 сентября 1939 г. были сформированы и укомплектованы четыре оперативные такие группы, одна из которых оставалась в резерве.
По условиям «учебных сборов» территория вновь присоединённых областей разбивалась на районы (уезды), поэтому каждая из оперативно-чекистских групп разбивалась на подгруппы, включающие по 7-12 оперативных работников для «обслуживания» закреплённых районов.
15 сентября 1939 г., за два дня до вступления Красной армии на территорию Западной Украины и Западной Белоруссии, органам госбезопасности УССР и БССР была направлена директива НКВД СССР, разъясняющая порядок действий спецгрупп. Приведём выдержки из этой директивы: «…По продвижении наших войск и занятии тех или иных городов будут создаваться временные управления (временный орган власти), в состав которых войдут руководители опергрупп НКВД. Работники НКВД всю свою работу должны проводить в теснейшем контакте с военным командованием и под руководством временных управлений. При выполнении специальных задач по обеспечению порядка, пресечению подрывной работы и подавлению контрреволюции опергруппы НКВД по мере продвижения войсковых частей должны создавать на занятой территории во всех значительных городских пунктах аппарат НКВД за счёт выделения из состава основной опергруппы НКВД небольших групп (численность в зависимости от важности конкретного пункта) с небольшим отрядом красноармейцев-пограничников. Выделенные опергруппы работников должны стать ядром будущих органов НКВД.
«<…> Опергруппы НКВД должны провести следующие мероприятия.
1. Немедленно занять все учреждения связи: телеграф, телефон, радиостанции и радиоузлы, почты, поставив во главе органов связи надёжных людей.
2. Немедленно занять помещения государственных и частных помещений банков, казначейств и всех хранилищ государственных и общественных ценностей и взять на учёт все ценности, обеспечив их хранение.
3. Оказать всяческое содействие Политотделам армии и прикомандированным к ним работникам в немедленном занятии типографий, редакций газет, складов бумаги и в налаживании изданий газет.
4. Немедленно занять все государственные архивы, в первую очередь архив жандармерии и филиалов 2-го Отдела Генштаба (экс позитуры, пляцувок — органов разведки).
5. В целях предотвращения заговорщической предательской работы — арестуйте и объявите заложниками крупнейших представителей из помещиков, князей, дворян и капиталистов.
6. Арестуйте наиболее реакционных представителей правительственных администраций, руководителей местных полиций, жандармерии, пограничной охраны и филиалов 2-го Отдела Генштаба (воевод и их ближайших помощников, руководителей к/р партий — ППС — польской партии социалистов строжництво народове, национальной партии) бывших членов национал-демократической партии (стронництво праци христианской), демократической партии О.Н.Р. Аресты духовных лиц пока не производить, особенно католиков.
7. Занять тюрьмы, проверять весь состав заключённых. Всех арестованных за революционную и проч. антиправительственную работу освободить, использовав эти мероприятия для вербовки агентуры и проведения политработы среди населения. Организовать новую тюремную администрацию из надёжных людей, во главе с одним из работников НКВД, обеспечив строгий режим содержания арестованных.