26 августа 1879 года Исполнительный комитет «Народной воли» утвердил Липецкое постановление о цареубийстве.
Зная, что Александр II ежегодно ездит отдыхать в Крым, покушение планировали совершить путём подрыва царского поезда и приступили к организации нескольких засад на маршрутах вероятного его движения, а также организовали динамитную мастерскую в Басковом переулке в Петербурге. Её работой управляли Григорий Прокофьевич Исаев и Анна Васильевна Якимова.
В Одессе подготовкой теракта занимались В.Фигнер, Н.Кибальчич, Н.Колодкевич, М.Фроленко и Т.Лебедева. Они заминировали участок железной дороги около станции Гниляково. Но царь из Ливии не поехал в Одессу, и все работы в связи с этим были прекращены.
На участке между Курском и Белгородом в городе Александровске взрыв на железнодорожном пути подготовили Андрей Желябов, А.Якимова и Иван Окладский.[184] 18 ноября 1879 года в момент прохождения царского поезда мина не взорвалась по техническим причинам.
В Москве железнодорожное полотно заминировали путём подкопа из дома, специально для этой цели арендованного Львом Гертманом и Софьей Перовской. 19 ноября 1979 года царский поезд подорвали. Спасло Александра II то, что взрыв пришёлся на первый вагон, а Император ехал во втором. Пострадали сопровождающие царя лица.
Этот террористический акт очень сильно возмутил царя-батюшку и правительство. За ним последовали репрессии. Были арестованы члены Исполнительного комитета «Народной воли» А.Квятковский, С.Ширяев, а также разгромлена находящаяся в Петербурге типография народовольцев.
Но это не остановило конспираторов. Осенью 1879 года организатор «Северного союза русских рабочих» Степан
Николаевич Халтурин по паспорту Степана Батышкова трудоустроился в Зимнем дворце столяром. Натаскал туда аж два пуда динамита(!), который подорвал 5 февраля 1880 года в помещении, расположенном под столовой Императора. Но Александр II и члены его семьи не пострадали. В результате этого теракта погибли 11 солдат, нёсших службу во дворце. Все они были героями недавно закончившейся русско-турецкой войны, за своё отличие зачисленными на службу в императорский дворец. Кроме того, ранения различной степени тяжести получили 56 человек.[185]
В результате тщательной слежки за царем террористы установили, что из Зимнего дворца в Царское село Император ездит через Каменный мост. По предложению Александра Михайлова руководимая Желябовым группа в составе А.Преснякова, М.Грачевского, А.Баранникова и Макара Тетерки мост этот заминировала и стала поджидать царя.
17 августа 1880 г. все было готово, но когда Император подъезжал, Тетерка замешкался, и взрыв не был произведен.
Слежкой террористы также установили, что каждое воскресенье царь после торжественного развода караула в Михайловском манеже заезжал в Михайловский дворец к великой княгине Екатерине Михайловне, а затем отправлялся в Аничков дворец к старшему сыну великому князю Александру Александровичу и только после этого возвращался в Зимний дворец. Наблюдатели подметили, что на повороте от Михайловского театра на Екатерининский канал кучер придерживает лошадей, и карета едет почти шагом. Здесь и решено было организовать засаду.
В ноябре 1880 года Ю.Богданович и А.Якимова по документам супругов Кобозевых сняли помещение в первом этаже дома, стоящего на углу Малой Садовой и Невского проспекта. Подкоп попеременно рыли Желябов, Колодкевич, Суханов, Баранников, Саблин, Ланганс, Фроленко, Дегаев Сергей Петрович и Меркулов Василий Аполлонович. К февралю 1881 года подготовка к минированию дороги была завершена.
Было принято решение создать вспомогательную группу террористов, которые должны были добить царя в случае, если после взрыва мины он останется жив. В эту группу Желябов ввёл студентов Евгения Сидоренко, Игнатия Гриневицкого, Николая Рысакова, а также рабочих Тимофея Михайлова и Ивана Емельянова. Четыре бомбы для указанных террористов изготовил Кибальчич.
27 февраля 1881 года Желябова арестовали. Руководство терактом приняла Софья Перовская. На совещании Исполнительного комитета был уточнён план террористического акта и определены его исполнители. Метальщиками были назначены Гриневицкий, Михайлов, Рысаков и Емельянов.