Примерно в это время возникли беспорядки в Дакхине, вызванные Раджу Манна, и смутьяны поставили царём сына Али Шаха. Так как последний нашёл много последователей, Хан-ханану приказали выступить против него, а Абу-л Фазла послали в Насик; но спустя некоторое время повелели присоединиться к Хан-ханану. Акбар вернулся в Агру на 46-м году царствования, оставив принца Даниила в Бурханпуре. Жизнь Абу-л Фазла в Дакхине не была лёгкой. Хан-ханан в Ахмаднагаре бездействовал, у него не было охоты сражаться, и он оставил всё на Абу-л Фазла, который считал его предателем. Абу-л Фазл успешно проводил военные операции при умелой помощи своего сына Абд-ар-Рахмана. После примирения С iClb^HOJW Али I^Jaxa, он атаковал 1Рал>ку Манна, снова взял Джалнахпур и, окружив район, нанёс несколько поражений ему. Манна нашёл временное убежище в Давлатабаде, а в последующей стычке его чуть не схватили.
Во время осады Азира принц Салим, посланный против раны из Удайпура, восстал против отца и двинулся в Илахабад, где провозгласил себя царём. Хотя по возвращении Акбара из Бурханпура произошло примирение:, в 47-й год; правления Акбара принц снова проявил мятежность, а так как многие лучшие военные проявили благосклонность к Салиму, император вновь призвал Абу-л Фазла как единственного надёжного слугу. Поскольку его присутствие при Дворе было необходимым, Акбар послал ему приказ оставить войска в Дакхине. Возложив на сына Абд-ар-Рахмана командование войсками, Абу-л Фазл отправился в Агру в сопровождении небольшого количества людей. Салим, затаивший скрытую ненависть, подумал, что в этой поездке Абу-л Фазл окажется беззащитен, и у него есть прекрасная возможность избавиться от него. Он уговорил раджу Бир Сингха, главу клана Бундела в Орчхе (Ундчхха), через территорию которого Абу-л Фазлу предстояло проехать, подождать его в засаде и убить7. Бир Сингх был в немилости при Дворе и ухватился за эту возможность угодить принцу, который впоследствии вознаградил бы его. Он выставил большое количество всадников и пеших людей около Нарвара. Когда Абу-л Фазл прибыл в Уджжайн, его предупредили о намерении Салима и упрашивали ехать через Гхати Чанда. Но Абу-л Фазл сказал, что воры и разбойники не в силах остановить его на пути ко Двору, и продолжил лвигатъся к Нарвару. В пятницу, 4 раби-ал-аввала 1011 г.х. (12 августа 1602 г.), на расстоянии примерно половины коса от Сарайи Бар, что в 6 косах от Нарвара, в поле зрения появились люди Бир Сингха. Сопровождавшие Абу-л Фазла отговаривали его от сражения, а старый слуга Гадай-хан Афга посоветовал быстро поехать к Антри, в 3-х косах отсюда, так как там Рай Райан и Сурадж Сингх с 3 000 царских всадников: можно сначала присоединиться к ним, а затем наказать Бир Сингха. Но Абу-л Фазл подумал, что сбегать позорно. Смело оборонялся, но вскоре был окружён и, пронзённый мечом всадника, мёртвый упал на землю. Бир Сингх отрубил голову Абу-л Фазлу и отослал её Салиму в Илахабад, который, как говорят, бросил её «в недостойное место», где она лежала долгое время.
Голландский путешественник Де Лаэт приводит следующий рассказ о смерти Абу-л Фазла.
«Салим вернулся в Халебассу (Илахбас, старое название и начал чеканить золотые и серебряные монеты со своим именем, которые он посылал даже своему отцу, чтобы ещё больше его рассердить. Царь от этого пришёл в ярость и написал обо всём, что случилось, Абу-л Фазлу, который успокоил царя и сообщил, что приедет к нему как можно скорее, и добавил, что его сын перешёл границы по отношению к нему то ли из честных намерений, то ли по глупости. И спустя некоторое время, получив отпуск от Даниель Кса (Даниил Шах), отправился в путь с двумя или тремя сотнями всадников, а багаж следовал за ним. Кса-Селим, которому всё это было хорошо известно, вспоминая, как враждебен был Фазл ему, и боясь, что отец ещё больше рассердится на него, решил, что лучше перехватить того во время путешествия. Итак, он попросил Радзия Бертзингха Бондела, который жил в провинции Оссиин (Уджжайн), подстеречь Фазла ОКОЛО Сура (Нарвара) и Гуалера (Гвалиора) и прислать его голову ему, пообещав, что отблагодарит за это и сделает его командиром 5 тысяч всадников. Радзия согласился и ожидал его (Абу-л Фазла) с 1 000 всадников и 3 000 пехоты в 3 или 4 косах от Гуалера, послав ещё разведчиков возле деревень, чтобы предупредили о приближении Фазла. Когда последний, не обратив внимания на засаду, подъехал к Голлебаге (Калабагх) и направился к Соуру, Радзия Бертзингх и его люди напали на него со всех сторон. Фазл и его всадники сражались храбро, но силы противника превосходили их. Фазл получил 12 ран во время схватки и был захвачен в плен под деревом и обезглавлен. Его голову отослали принцу, который был очень рад».