После завершения обесклеивания икры подачу воздуха прекращают, и в аппарат Вейса подают воду, постепенно увеличивая ее расход. Отходы, образующиеся при обесклеивании икры, и рабочий раствор удаляются из аппарата через водосливные шланги и водоотводящие лотки.
Инкубация икры и выдерживание личинок. Наиболее распространенным аппаратом для инкубирования икры карпа является аппарат Вейса емкостью 8 л. Это наиболее простое устройство, представляющее собой по форме перевернутую бутылку с отрезанным дном. Благодаря подающейся снизу воде инкубация обесклеенной икры карпа происходит во взвешенном состоянии. В аппарат загружают 500–600 тыс. шт. оплодотворенных икринок карпа. Расход воды на один аппарат 0,05-0,08 л/с. Аппараты Вейса размещаются в рыбоводных стойках по 10 шт. и более. Выдерживание свободных эмбрионов после выклева осуществляется вне аппаратов, в стеклопластиковых лотках. Аппараты и лотки объединяются в устройство для инкубации икры и выдерживания личинок карпа.
Инкубационный аппарат ИВЛ-2, разработанный специалистами ВНИИПРХ, предназначен для инкубации икры растительноядных рыб, карпа, буффало и других видов рыб. Этот аппарат отличается от ранее созданных тем, что образующиеся в аппарате спиралеобразный равномерный восходящий поток воды имитирует течение реки. Особенностью аппарата является то, что в нем совмещен процесс инкубации икры и выдерживания личинок, что в несколько раз сокращает площадь инкубационных цехов, кроме того, повышается выживаемость личинок. Объем аппарата ИВЛ-2 составляет 200 л, количество инкубируемой икры карпа достигает 3,5 млн. шт., расход воды — 0,23 л/с.
Универсальный инкубационный аппарат "Днепр-1" представляет собой усовершенствованный аппарат ИВЛ-2, он разборный и состоит из цилиндрического корпуса, изготовленного из оргстекла толщиной 8 мм, донной части, диска-завихрителя, надстройки, фильтра и каркаса. Завихритель представляет собой диск из оргстекла, в котором радиально прорезаны четыре направляющие щели под углом 33 ° к основной плоскости. Фильтрующая сетка крепится к каркасу винтами. Количество выдерживаемых в аппарате личинок растительноядных рыб составляет до 4 млн. шт. Выход личинок близок к 100 %. Этот аппарат можно использовать и для инкубации икры карпа при загрузке 2,5–3,0 кг.
Универсальный инкубационный аппарат "Амур", разработанный специалистами ВНИИПРХ, предназначен для инкубации икры, выдерживания и подращивания личинок растительноядных рыб, карпа, буффало и канального сома, является усовершенствованной конструкцией аппарата ИВЛ-2 и "Днепр-1". Принцип действия аппарата основан на инкубации икры и выдерживании личинок в равномерном восходящем потоке воды. Инкубатор "Амур" отличается от существующих системой водораспределения, под которой отсутствует камера, что облегчает чистку инкубатора. Аппарат состоит из рабочей емкости цилиндрической формы из оргстекла, распределительного узла в центре конусного дна, рабочей емкости и водосливного узла. Водосливной узел включает водосборный желоб, две водосливные трубы с уроненными трубками и фильтрационной сеткой на распорном каркасе. Фильтрационная сетка установлена на резиновой прокладке, закрепленной на торце рабочей емкости и фиксирующейся с помощью четырех шпилек с барашками. Водораспределительный узел выполнен в виде конуса с вмонтированным в него сопловым завихрителем. Рабочая емкость установлена на подставку с регулируемыми по высоте стойками. Аппарат эксплуатируется в трех режимах: инкубация икры рыб (без фильтрационной сетки и со снятыми уровенными трубками); выдерживание предличинок (с установленной фильтрационной сеткой и уровенными трубками); подращивание личинок.
Аппарат "Амур" по сравнению с аппаратами ИВЛ-2 и "Днепр-1" легче и проще в работе и обслуживании, в нем меньше потери личинок, ниже удельный расход воды, выше выход личинок. Объем аппарата-200 л, в нем можно инкубировать 1,5 млн. шт. икринок растительноядных рыб, 4,5 млн. шт. — карпа, 60 млн. шт. буффало и 0,1 млн. икринок канального сома. Аппарат вмещает до 4,0 млн. шт. выдерживаемых личинок растительноядных рыб, карпа и буффало, 0,1 млн. шт. личинок канального сома. Расход воды в режиме инкубации — 0,13-0,17 л/с, в режиме выдерживания — 0,17-0,20 л/с. Инкубацию икры карпа проводят при температуре воды 20–22 °C.