Деятельность цихлид наносит растениям не только прямой вред. При постоянном ворошении грунта в воде появляется муть, частицы которой оседают на листьях растений, покрывая их бурым налетом. Снижается количество света, поступающего к растениям, ухудшается доступ к ним питательных веществ. В результате нарушается дыхание и питание растений, они болеют и погибают. Несколько исправить положение может установка мощного фильтра, но полностью проблему это не решает.
Так же сильно, как цихлиды, ворошат грунт в аквариуме различные виды сомиков. Очень часто аквариумисты содержат сомиков торакатумов (Hoplosternum thoracatum).
Эти рыбки в природных условиях достигают значительных размеров — до 18 см. Обитают они в бассейне Амазонки, в Гвиане, на островах Тринидад и Мартиника.
В аквариуме сомики усердно подбирают со дна остатки животного и растительного корма, что предотвращает их загнивание. Но, перерывая грунт, они создают постоянное облако мути, о действии которой на растения уже упоминалось.
Несколько слов надо сказать о цихлидах, обитателях Великих озер Африки. Эти рыбы в природе живут у скалистых берегов, крайне бедных растительностью, поэтому в рационе цихлид растения значительной роли не играют. Тем не менее рыбы, содержащиеся в аквариуме очень любят пробовать растения "на зуб". Интересно, что от плотных листьев рыбы не отрывают куски, а только надкусывают их, оставляя четкий рисунок зубов. Конечно, такой "кружевной узор" совсем не украшает растения. Кроме того, рыбы нередко дергают листья, пытаясь оборвать их, и иногда выдергивают растения из грунта. Поэтому африканских цихлид не следует содержать в аквариумах, где предполагается выращивать растения. Да и сами рыбы в такой обстановке выглядят неестественно.
Очень популярны у аквариумистов сравнительно небольшие подвижные рыбки барбусы.
На первый взгляд они совершенно безобидны, однако могут нанести ущерб подводному саду. Взрослые рыбки с удовольствием отщипывают верхушечные почки растений, обрывают нежные молодые листья. Добавка растительных кормов в рацион несколько снижает агрессивность барбусов. Однако при малейшем нарушении регулярности кормления рыбки снова могут проявить ее, причем по отношению не только к растениям, но и к некоторым рыбкам, у которых они ощипывают плавники.
Любители оригинальных редких рыб содержат в своих аквариумах африканских угрей — макрогнатусов (Macrognathus) и мастацембелюсов (Mastacembelus).
Эти рыбы большую часть времени проводят зарывшись в грунт и проделывая в нем длинные тоннели. Они перемещают грунт, улучшая в нем газообмен. Это является положительной стороной деятельности угрей, но есть у нее и отрицательная сторона. Нередко такие тоннели проходят под корнями растений. Из-за обрыва мелких и крупных корней растения замедляют рост и нередко гибнут. Попытаться помешать работе угрей можно вкопав в грунт плоские камни и пластиковые перегородки. Но такая мера дает лишь частичный эффект, потому что мастацембелюсы могут зарываться в грунт даже в очень маленьком горшке, хотя размеры взрослых рыб достаточно внушительны, до 20–25 см.
Первыми жителями аквариума у начинающих аквариумистов часто бывают золотые рыбки. Однако совместить этих очень привлекательных представителей гидрофауны с богатым, красивым подводным садом не удается по нескольким причинам. Прежде всего золотые рыбки — обитатели холодных вод (обычная температура содержания -16-20 °C), а большинство аквариумных растений — представители тропической флоры и нуждаются в теплой воде. Золотые рыбки поедают практически любые корма и, конечно, с удовольствием ощипывают нежные листочки растений, причем особенно достается растениям с перистыми листьями. Противостоять золотым рыбкам могут только крупные жестколистные растения. Кроме того, эти рыбки очень любят рыться в грунте и поднимают со дна ил. А так как они весьма прожорливы, то на дне такого ила (экскрементов) обычно очень много, даже если аквариум часто убирают. Вся эта муть оседает на листьях растений.
Для аквариума с золотыми рыбками надо подбирать растения относительно холодноводные, жестколистные, стойкие к затенению, т. е. очень неприхотливые.
Перед начинающими любителями часто встает вопрос: каких моллюсков можно помещать в аквариум? А для аквариумистов, занимающихся водными растениями, этот вопрос совсем не праздный, так как существует очень много разновидностей моллюсков, обитающих в водной среде, и все они влияют на состояние аквариума.