Почему ЦРУ так поступило — остается только догадываться. Как обычно, управление боялось, что разыскные мероприятия внутренних служб выявят их компромиссные взаимоотношения с зарубежными разведслужбами, поэтому стремилось всячески защитить секретную информацию. Опыт сотрудничества ЦРУ с Джоном О’Нейлом показал, что последний требовал полного контроля над всеми случаями, которые касались сферы расследований ФБР, а этот случай был именно таким. Но в ЦРУ многие ненавидели О’Нейла и боялись вторжения ФБР в сферу разведывательной деятельности. Поэтому ЦРУ решило скрыть эту информацию, чтобы она не попалась на глаза О’Нейлу. Так объяснили это подчиненные Джона.
Существовали и другие причины, заставившие ЦРУ скрыть информацию, которую оно было обязано сообщить в ФБР. Несколько членов команды 1–49 считали, что ЦРУ намеренно прикрыло Мидхара и Хазми, надеясь их впоследствии завербовать. Управлению был необходим источник внутри «Аль-Каиды»; попасть не удавалось не только туда, но даже в число курсантов тренировочных лагерей, открытых для всех желающих. Мидхар и Хазми представляли великолепную возможность. Однако, проникнув на территорию США, они оказались в юрисдикции ФБР. Фактически управление неоднократно проводило спецоперации внутри Соединенных Штатов, хотя законных оснований для подобной деятельности у него не было. Обычно это происходило в Нью-Йорке, где постоянно находилось множество иностранных делегаций. О’Нейл нередко жаловался резиденту ЦРУ в Нью-Йорк на операции 1–49. ФБР подозревало, что управление создало совместное предприятие с саудовской разведкой для того, чтобы формально обойти запрет. Естественно, что и иностранным разведкам была запрещена деятельность на территории США, но они делали это постоянно.
Можно лишь предполагать, почему ЦРУ не передало важнейшую информацию ФБР, которое прекрасно представляло, что управление и так завалено множеством угроз и предупреждений. Резидентура «Алек» начинала в 1996 году с двенадцати сотрудников, а к моменту роковой встречи в Куала-Лумпуре там работало уже двадцать пять человек. Было не менее тридцати аналитиков в Антитеррористическом центре, которые отслеживали акты терроризма во всем мире, но «Аль-Каида» не находилась в сфере его непосредственной ответственности. Аналитики «Алека» были молодой командой, где каждый работал в среднем три года. В основном это были женщины, чувствовавшие себя в мужском окружении Ближневосточного отдела ЦРУ не совсем уютно. Именно молодые женщины должны были предотвращать террористические атаки на США. Этот груз ответственности так давил на них, что в глазах других сотрудников они выглядели одержимыми манией преследования, за что их за глаза называли «семейкой Мэнсона», по имени Чарльза Мэнсона, осужденного за безумные убийства. Они подняли тревогу, но служащие старшего поколения не потрудились их услышать.
Атмосфера внутри резидентуры «Алек» была отравлена попытками ряда аналитиков ЦРУ возложить ответственность за отстранение от дел Майка Шойера на О'Нейла. Всего за несколько месяцев до этого старший агент ФБР обратился в резидентуру с требованием передать необходимую информацию, что вызвало перебранку между Фри и Тенетом, уважаемыми руководителями двух учреждений. Шойеру пришлось отступить, но тот агент ФБР, который обладал решающим голосом, тяжело заболел и вынужден был подать в отставку всего за несколько дней до встречи в Малайзии. Ни у одного из трех агентов ФБР, оставшихся в резидентуре, не было права на передачу информации, поэтому они обратились за разрешением. Так происходило до июля 2000 года, пока в резидентуру не назначили старшего агента Чарльза Э. Фрэма. Он никогда не видел ни одного сообщения, распечатки переговоров и ничего не знал о проблеме обмена информацией с ФБР. Когда позже он услышал о встрече в Малайзии, то сделал вывод, что если об этом ничего не знали в ФБР, это было большой оплошностью.
В то время произошло множество роковых ошибок.
15 января 2000 года Мидхар и Хазми прибыли в Лос-Анджелес, чтобы записаться в летную школу. Они, вероятно, были удивлены таким заданием. Даже поиск жилья оказался трудной задачей, ведь ни один из них не говорил по-английски. Вскоре после приезда они познакомились с сорокадвухлетним студентом Омаром Байуми, который получал стипендию от саудовского правительства, но редко ходил на занятия. Он уже попадал в сферу внимания местного отделения ФБР по информации управляющего домом, где он жил. По словам одного из информаторов ФБР, Байуми, предположительно, был агентом саудовского правительства, но это мало что значило для ФБР, ибо Саудовская Аравия считалась верным союзником США. В любом случае агентам не разрешили проводить допрос Байуми, полагая, что это будет вторжением в большую антитеррористическую операцию.