Берлинский же трактат раздробил Болгарию на три части. Он значительно сократил территорию нового государства, предоставив Болгарскому княжеству лишь земли от Дуная до Балкан, и искусственно отделил от него населенные болгарами земли к югу от Балкан, образовав из них автономную турецкую провинцию, Восточную Румелию.
Независимое во внутреннем управлении, имеющее собственную милицию, болгарское княжество вынуждено платить дань Турции (ст. 1). Князь Болгарии должен свободно избираться населением и утверждаться Портою с согласия держав (ст. 3). Полученное Россией в Сан-Стефано право временного управления княжеством через особо назначенного русского комиссара в течение двух лет было ограничено Берлинским трактатом. Русский комиссар обязан был управлять княжеством при содействии турецкого комиссара и консулов европейских держав в течение 9 месяцев (ст. 6 и 7). Разграничение княжества доверялось не русско-турецкой, как по Сан-Стефанскому договору, а европейской комиссии (ст. 2). Срок пребывания 50-тысячного русского корпуса в Болгарии и Восточной Румелии был сокращен с 2 лет до 9 месяцев (ст. 22)177.
Управление автономной Восточной Румелией возлагалось на генерал-губернатора христианина, назначаемого Портою на пять лет, с согласия держав (ст. 13 и 17). Охрана внутреннего порядка области осуществлялась туземной стражей, при содействии местной милиции. Внешняя оборона предоставлялась Порте, с правом возводить укрепления на границах области и содержать в них только регулярные войска (ст. 15). Порядок устройства области поручался международной комиссии, так же как и временное заведование ее финансами (ст. 18 и 19).
3) Босния и Герцеговина по Сан-Стефанскому трактату соединены были в одну автономную область по началам проекта, выработанного на Константинопольской конференции 1876 г. (в заседаниях ее без участия турецкого представителя). В некоторых частях этот проект предложено было изменить по соглашению России, Турции и Австро-Венгрии178. Берлинский трактат предоставил Австро-Венгрии право занять Боснию и Герцеговину и управлять ими. Кроме того, Австро-Венгрии разрешалось держать гарнизоны, строить военные и торговые пути в Санджаке (Ново-Базар), между владениями Сербии и Черногории (ст. 25).
4) Независимость Румынии, Сербии и Черногории, признанная в Сан-Стефано Турцией, была признана по Берлинскому трактату всеми державами, подписавшими этот трактат (ст. 43, 34, 26), при условии, что в них будет установлено религиозное, гражданское и политическое равноправие.
5) Территория Сербии была увеличена в согласии с Сан-Стефанским договором. Берлинский трактат предоставил Сербии спорные места на р. Дрине (Малый Зворник и Сакар) и несколько изменил границы участка179 на юго-востоке, по верхнему течению Моравы, определенного Сербии в Сан-Стефано (ст. 36).
6) Территория Черногории также была увеличена по Берлинскому трактату значительно меньше, чем по Сан-Стефанскому (ст. 28). На морском побережье Черногория получила Антивари. Спицца отдана была Австро-Венгрии, а Дульчинье (Дульциньо) оставлено во владении Турции. Берлинский трактат не предоставил Черногории права иметь военный флот и закрыл гавань Антивари для военных судов других государств.
Морская санитарная полиция в черногорских водах предоставлена была Австро-Венгрии. Черногорскому торговому флоту обещано было покровительство консульских агентов этой державы. Черногория не имела права сооружать на новых своих владениях ни проезжих, ни железных дорог без соглашения с Австрией (ст. 29).
7) Румыния взамен возвращенной ею России южной части Бессарабии (ст. 45) получила острова дунайской дельты и Змеиный остров, а также Добруджу и местности к югу от Добруджи, на правом берегу Дуная (ст. 46). 44-я статья трактата обязывала Румынию дать евреям равноправие.
8) В отношении Греции державы предоставили ей исправление греко-турецкой границы по соглашению с Турцией и предложили свое посредничество в случае неудачи переговоров (ст. 24 и протокол XIII).
9) Относительно Крита, по Сан-Стефанскому договору, Порта обязалась в точности применять органический регламент 1868 г., принимая во внимание желания, выраженные уже населением180.
Берлинский же трактат допустил возможность изменений регламента, «какие будут признаны справедливыми» (ст. 23). Подобные критскому регламенту уставы, согласованные с местными потребностями (в особых комиссиях, с участием местных уроженцев), должны были быть введены, по рассмотрении их восточно-румелийской комиссией (по Сан-Стефанскому договору — русским правительством), в прочих областях европейской Турции, для которых не определено было особого устройства (ст. 23). В азиатской Турции, в областях, населенных армянами, Порта, равным образом, обязалась по обоим договорам ввести преобразования и ограждать безопасность армян от курдов и черкесов. Берлинский трактат, кроме того, возложил на Порту обязательство периодически сообщать о мерах, принятых ею в армянских областях, державам, участницам трактата, которые согласились наблюдать за их исполнением (ст. 61).