Особо следует сказать о талантливом математике С. В. Ковалевской. Она была первой в мире женщиной, ставшей профессором, членом-корреспондентом Петербургской академии наук (1889). Основные труды её были посвящены математическому анализу, механике и астрономии. Выступала также как и писательница. К сожалению, почти всю свою творческую жизнь она вынуждена была провести за границей. Докторская защита её состоялась в Гейдельберге, и профессорство она получила не в отечественном, а в шведском — Стокгольмском университете. Да и награды за свои выдающиеся труды присуждались французской и шведской академиями.
В. В. Докучаев разработал основы учения о почве, изложив их в 1883 г. в своём труде «Русский чернозём», создал учение о географических зонах. Дал научную классификацию почв (1886). В 1889 г. на Всемирной выставке в Париже коллекция русских почв, а также труды Докучаева были удостоены золотой медали. В книге «Наши степи прежде и теперь» (1892) учёный изложил комплекс мер борьбы с засухой. Идеи Докучаева оказали влияние на развитие физической географии, лесоведения, мелиорации и др.
В Петербургском университете А. Н. Бекетов развернул научные исследования по проблемам морфологии, географии растений и флористике. Стал основателем русской научной школы ботанико-географов. Ввёл в основу преподавания русскую ботаническую терминологию. В 1886 г. совместно с X. Я. Гоби организовал первый русский ботанический журнал «Ботанические записки». Выдающийся географ, основоположник русской климатологии А. И. Воейков кроме многочисленных поездок по Европейской части России, Кавказу, Крыму и Средней Азии, путешествовал по Западной Европе, Южной и Передней Азии, Северной, Центральной и Южной Америке, был в Южном Китае и Японии. В 1884 г. опубликовал свой труд «Климаты земного шара, в особенности России», в котором впервые была вскрыта физическая сущность и рассмотрена структура сложных климатических процессов. Явился одним из организаторов высшего географического образования в России.
Во многом обогатил науку и Казанский университет. Самобытные астрономические исследования вели здесь в обсерватории М. А. Ковальский и Д. И. Дубяго. В этом университете сложились и успешно развивались прославленная химическая школа, основанная Н. Н. Зининым, и не менее известная физиологическая школа во главе с Н. О. Ковалевским. Ученик Зинина Н. Н. Бекетов, работая затем в других научных центрах, продолжал успешные исследования в области физической химии, стал основателем отечественной научной школы физикохимиков. Открыл способ восстановления металлов из их оксидов, заложив основы алюминотермии. Обнаружил вытеснение металлов из растворов их солей водородом под давлением.
Большая научная работа проводилась и в отраслевых институтах. Мировую известность приобрела механическая лаборатория в Московском техническом училище, где, как и в Московском университете, проводил свои исследования по теории авиации Н. Е. Жуковский. В Петербургском институте корпуса инженеров путей сообщения, в лаборатории Н. А. Белелюбского, разрабатывались методы испытания стройматериалов, нормы и технические условия на железобетонные работы.
Горный институт, где трудились П. В. Еремеев, Н. И. Кокшаров, А. П. Карпинский, И. В. Мушкетов, внёс важный вклад в разработку теоретических и практических вопросов геологии, минералогии и кристаллографии.
В Медико-хирургической академии химическая лаборатория благодаря трудам Н. Н. Зинина, А. М. Бутлерова и их учеников стала базой для формирования одной из химических научных школ, известных не только в России, но и во всём мире. Лаборатория И. М. Сеченова в этой академии превратилась в центр исследовательской работы в различных областях научной медицины — физиологии, клинической медицины, фармакологии. Во второй половине XIX в. Медико-хирургическая академия представляла собой не только место сосредоточения важных исследований в области медицины, но и центр разработки фундаментальных теоретических проблем общей биологии.