Сентябрь — поездка в США, начало переговоров с представителями Русской Зарубежной Церкви о сближении.
1990, январь — участие, а по сути дела руководство митрополита Алексия на Архиерейском Соборе.
23 марта — митрополит Алексий возглавил первый крестный ход по Москве.
3 мая — кончина Святейшего Патриарха Пимена.
7 июня — в 22 часа 20 минут на Архиерейском Соборе Русской Православной Церкви митрополит Ленинградский и Новгородский Алексий избран пятнадцатым Патриархом Московским и всея Руси.
10 июня — Патриаршая интронизация в Богоявленском Елоховском соборе Москвы. Вселение в загородную патриаршую резиденцию в подмосковном Переделкине.
Июль — первый пастырский визит на Украину, начало борьбы с украинским расколом.
23 сентября — первое богослужение Патриарха в Успенском соборе Московского Кремля.
25 октября — постановление Синода о восстановлении Соловецкого монастыря.
25—27 октября — первый Архиерейский Собор, проходивший под руководством Патриарха Алексия II.
4 ноября — закладка Казанского собора на Красной площади.
5 ноября — Патриарх впервые дал резко отрицательную оценку революции 1917 года.
25 ноября — благословил начало восстановления храма Христа Спасителя.
1991, весна — паломничество Патриарха на Святую землю.
Лето — перенесение мощей Серафима Саровского в Дивеево.
19—21 августа — неудавшийся путч, призывы Патриарха не допустить братоубийственной войны. Развал СССР.
Осень — поездки Святейшего по Ближнему Востоку, в Европу и США.
1992, 31 марта — 5 апреля — Архиерейский Собор, канонизация святых и споры о расколе на Украине.
6—7 мая — на заседании Синода временное отлучение Украинского митрополита Филарета (Денисенко).
Май — паломничество Патриарха Алексия II на Святую землю.
11 июня — Архиерейский Собор, окончательное отлучение Филарета (Денисенко).
Июнь — паломничество Патриарха в Грецию и на Афон, посещение Оптиной пустыни.
Июль — поездки на Валаам и в Дивеево.
Август — поездка на Соловки.
Октябрь — поездка в Астрахань.
1993, 23 марта — выступление Патриарха по телевидению с призывом не допустить гражданскую войну в России.
26 мая — I Всемирный Русский Народный Собор под председательством Патриарха Алексия II.
Лето — поездки по стране с призывами не допустить кровопролития.
Сентябрь — визит в США, прерванный досрочно в связи с событиями вокруг Белого дома в Москве.
29 сентября — выступление Патриарха Алексия II «Россия — на краю пропасти!».
1—4 октября — переговоры в Свято-Даниловом монастыре под руководством Святейшего Патриарха.
3—4 октября — кровопролитие в Москве; у Патриарха — тяжелейший сердечный приступ.
4 ноября — освящение Казанского собора на Красной площади в Москве.
1994 год, май — прибытие в Сербию; награждение Патриарха орденом Саввы Сербского; посещение Боснии и Герцеговины, Черногории, Косова.
Осень — начало работ по ликвидации бассейна «Москва» и строительству храма Христа Спасителя.
13 октября — обретение мощей святителей Филарета (Дроздова) и Иннокентия (Вениаминова), а также архимандрита Антония (Медведева). На Архиерейском Соборе святитель Филарет причислен к лику святых.
26 декабря — в своём воззвании Патриарх тщетно призывает власть избежать войны на Кавказе.
1995, 7 января — закладка храма Христа Спасителя в Москве.
1 февраля — II Всемирный Русский Народный Собор.
3 мая — освящение храма-памятника на Прохоровском поле.
9 мая — участие Патриарха Алексия в торжествах по случаю пятидесятилетия Победы.
Июнь — визит в Казахстан. Кровавые события в Будённовске (Святой Крест), после которых у Патриарха произошло обострение болезни сердца.
Конец июня — визит в Швейцарию, богослужение у памятника А. В. Суворову.
Июль — визит в Белоруссию.
Начало августа — визит в Краснодар, посещение госпиталей с раненными в Чечне воинами.
19 августа — первый молебен в нижнем приделе строящегося храма Христа Спасителя.