Но именно безрассудное расширение империи Аурангзебом в Деккан, в основном в борьбе с мусульманскими государствами шиитов Биджапуром и Голкондой , привело к истощению и истощению ресурсов империи. Она также вызвала против Моголов нового врага, который был столь же грозным, сколь и неожиданным. Крестьяне и землевладельцы маратхи когда-то служили в армиях Биджапура и Голконды. В 1680-х годах, после того как Моголы завоевали эти два государства, партизаны Маратхи под предводительством Шиваджи Бхонсле, харизматичного индуистского военачальника Маратхи, начали совершать нападения на могольские армии, оккупировавшие Декан. Как отмечал один неодобрительный могольский летописец, "большинство мужчин в армии маратхов не наделены знатным происхождением, а среди их солдат в изобилии встречаются крестьяне, плотники и лавочники". Это были в основном вооруженные крестьяне, но они знали страну и умели сражаться.
С малонаселенных возвышенностей западного Декана Шиваджи возглавил длительное и все более широкое крестьянское восстание против моголов и их сборщиков налогов. Легкая кавалерия маратхов, вооруженная копьями, отличалась чрезвычайной мобильностью и способностью совершать вылазки далеко за линии моголов. За день они могли преодолеть пятьдесят миль, потому что кавалеристы не носили с собой ни багажа, ни провизии, а жили за счет деревни: Максимум Шиваджи гласил: "Не грабь, не плати". Один из якобинских путешественников, доктор Джон Фрайер из ИИК, отмечал, что "голые, голодные негодяи", составлявшие армию Шиваджи, были вооружены "только копьями и длинными мечами шириной в два дюйма" и не могли выиграть сражения на "поле брани", но были превосходны в "удивлении и грабеже".
По словам Фрайера, маратхи Шиваджи благоразумно избегали сражений с армией Моголов, предпочитая вместо этого разорять центры могольской власти, пока экономика не рухнула. В 1663 году Шиваджи лично возглавил дерзкий ночной рейд во дворец штаб-квартиры Великих Моголов в Пуне, где убил семью губернатора Декана, дядю Аурангзеба, Шаиста Хана. Ему также удалось отрубить губернатору палец. В 1664 году крестьянская армия Шиваджи совершила набег на могольский порт Сурат , разграбив его богатые склады и вымогая деньги у многочисленных банкиров. То же самое он сделал в 1670 году, а к третьему визиту маратхов в 1677 году не было даже намека на сопротивление.
В промежутке между двумя последними набегами Шиваджи принял в своей впечатляющей горной крепости Райгад ведическое посвящение и коронацию, проведенную пандитом из Варанаси Гагабхаттой, что стало ритуальным событием в его карьере. Она состоялась 6 июня 1674 года и дала ему статус Владыки Зонта, Чхатрапати, и законного индуистского императора, или Самраджьяпады. Вскоре после этого последовала вторая тантрическая коронация, которая, по мнению его последователей, дала ему особый доступ к силам и благословениям трех великих богинь гор Конкана:
Сиваджи вошел в тронный зал с мечом и совершил кровавое жертвоприношение Локапалам, божествам, охраняющим миры. Придворных, присутствовавших на церемонии, попросили удалиться, пока под музыку и песнопения саманов на тело короля наносились благоприятные мантры . Наконец он взошел на свой львиный трон, приветствуемый криками "Победа" из зала. Он наделил трон силой мантр десяти Видья. Благодаря их силе тронный зал наполнился могучим великолепием. Сакты держали в руках светильники и люстрировали царя, который сиял как Брахма.
Аурангзеб отверг Шиваджи как "крысу пустыни". Но к моменту своей смерти в 1680 году Шиваджи превратился в заклятого врага Аурангзеба, оставив после себя имя великого символа индуистского сопротивления и возрождения после 500 лет исламского правления. Через поколение маратхские писатели превратили его в полубога. Например, в "Сивабхарате" Кавираджа Парамананды Шиваджи предстает не кем иным, как Вишну-воплощением:
Я - Господь Вишну,
Сущность всех богов,
Проявление на земле
Чтобы снять с себя бремя мира!