Высшее духовенство и аристократия, отчаявшись добиться чего-либо от населения, преданного во власть самых неосновательных внушений, отправили послов умолять Флора и Агриппу как можно скорее вернуться и подавить восстание, указывая, что скоро будет уже поздно. По Иосифу, Флор добивался истребительной войны, которая бы стерла с лица земли всю еврейскую расу; поэтому он ничего не ответил. Агриппа отправил в распоряжение партии порядка отряд в три тысячи арабских всадников. Партия порядка вместе с этими всадниками заняла верхний город (нынешние армянский и еврейский кварталы). Партия действия занимала нижний город и храм (нынешние кварталы мусульманский, могариби, харам). Между обеими частями города началась настоящая война. 14 августа революционеры, предводительствуемые Елеазаром и Менахемом, сыном того Иуды Гавлонита, который первый 60 лет тому назад поднял евреев, проповедуя им, что истинный поклонник Бога не должен признавать никакого человека старшим, овладели верхним городом, сожгли дом Анания и дворцы Агриппы и Вероники. Всадники А1риппы, Анании, его брат и все старейшины, которые могли к ним присоединиться, укрылись в самых верхних этажах дворца Асмонеев.
На следующее утро после этого успеха инсургенты напали на башню Антонии; после двухдневного боя они взяли ее и зажгли. Затем они осадили верхний дворец и взяли его приступом 6 сентября. Всадникам Агриппы было предоставлено право свободно выйти. Что касается римлян, то они заперлись в трех башнях, носивших названия Гиппика, Фазаила и Мариамны. Анания и его брат были убиты. Как это обыкновенно бывает при народных восстаниях, вскоре между вождями победившей партии начались раздоры. Менахем стал невыносимым в своей гордости демократического выскочки. Елеазар, сын Анания, без сомнения раздраженный убийством своего отца, выгнал Менахема и убил его; остатки партии Менахема укрылись в Масаду, которая и была вплоть до окончания войны оплотом партии наиболее экзальтированных изуверов.
Римляне долго защищались в своих башнях. Доведенные до крайности, они сдались с условием, чтобы им была сохранена жизнь. Это им пообещали, но как только они сложили оружие, Елеазар приказал всех их убить, за исключением Метилия, примипилария когорты, обещавшего принять обрезание. Таким образом, римляне окончательно потеряли Иерусалим около конца сентября 66 года, почти спустя сто лет после взятия его Помпеем. Римский гарнизон в замке Махерон, опасаясь, что ему будет отрезан путь к отступлению, сдался на капитуляцию. Замок Кипрос, господствующий над Иерихоном, также попал в руки инсургентов. Возможно, что Иродиум был занят мятежниками также около этого времени. Слабость, которую обнаружили римляне во всех этих сражениях, представляется довольно странной и дает некоторое правдоподобие мнению Иосифа, что план Флора заключался в том, чтобы побудить евреев на крайности. Правда, что первый натиск революционеров бывает очень бурным, вследствие чего их трудно остановить, и дальновидные люди всегда предпочитают, чтобы они своими излишествами довели себя до утомления.
За пять месяцев восстание распространилось со страшной силой. Инсургенты не только владели Иерусалимом, но вступили в сношения через Иудейскую пустыню с областью Мертвого моря, где занимали все крепости; отсюда они подавали руку арабам, Наватеям, в большей или меньшей степени врагам Рима. Сторону мятежников приняли Иудея, Идумея, Перея, Галилея. Тем временем в Риме презренный тиран предоставлял первые должности империи самым гнусным и самым неспособным людям. Если бы евреи могли сгруппировать вокруг себя всех недовольных Востока, то владычеству Рима там наступил бы конец. Но, к несчастью для них, произошло как раз обратное; восстание евреев вдохнуло народностям Сирии удвоенную верность Римской власти. Ненависть, которую евреи внушили своим соседям в эпоху, когда римское владычество над ними находилось в состоянии как бы оцепенения, была достаточно сильна, чтобы возбудить против них врагов, не менее опасных, нежели римские легионы.