Время послѣднихъ двухъ лѣтъ жизни Святителя, это было время темной ночи, повисшей надъ Православіемъ (какъ писалъ св. Маркъ Георгію Схоларію, говоря: “до сихъ поръ заключенная ими Унія объемлетъ мракомъ Церковь”), хотя уже и были на лицо признаки зари, и Святитель зналъ, что та борьба, во главѣ которой онъ стоялъ, вела къ побѣдѣ — ибо это была борьба за Истину, которая — непобѣдима! Однако, онъ зналъ, что побѣда сама по себѣ не придетъ, и требуется еще много и много труда за Православіе, труда напряженнаго, горѣнія неугасающаго ни на минуту, и къ тому же — борьбы длительной и опасной. А онъ — воевода борьбы, шедшій во главѣ воинства, уже едва шелъ, истощенный болѣзнью и измученный людскими кознями. Но сила Господня совершается въ немощи!
О самой кончинѣ святителя у насъ больше свѣдѣній, чѣмъ о двухъ послѣднихъ годахъ его жизни.
Великая и жестокая борьба за Православіе, одиночество въ этой борьбѣ, государственныя и церковныя репрессіи, которымъ подвергался Святитель, а главное — его горѣніе, его непрестанная печаль о Церкви: все эго не могло не имѣть гибельныхъ послѣдствій для хрупкаго и немощнаго тѣлеснаго сосуда Святителя, въ которомъ покоился духъ, подобный пророку Иліи по ревности о Бозѣ, или же духу великаго основателя Ефесской Церкви, Апостола Павла, по его попеченію о всѣхъ Церквахъ. При пламенномъ духѣ было немощно тѣло, изнуренное непосильной борьбой съ смертельнымъ недугомъ рака, подвигами и богословскими трудами. Уже на Соборѣ во Флоренціи онъ былъ тяжко боленъ, а послѣ него окончательно надорванъ и измученъ. Недолго прожилъ онъ послѣ возвращенія изъ ссылки. Смерть его наступила 23-го іюня, какъ намъ сообщаетъ Іоаннъ Евгеникъ въ своемъ синаксарѣ Святителю, а годъ его кончины, согласно неопровержимымъ доказательствамъ Mgr. L. Petit, слѣдуетъ относить къ 1444 году. 7)· Ошибочно утверждали архіепископъ Черниговскій Филаретъ 8) и А. Норовъ 9), что св. Маркъ Ефесскій умеръ много позднѣе: первый говоря о 1452 г., а второй говоря, что св. Маркъ скончался уже послѣ паденія Константинополя. Ихъ утвержденія и голословны и ошибочны.
Св. Маркъ Ефесскій умеръ въ возрастѣ 52 лѣтъ. Георгій Схоларій такъ говоритъ намъ о кончинѣ св. Марка: “Но скорбь наша усугублена еще тѣмъ, что онъ похищенъ изъ нашихъ объятій, прежде чѣмъ онъ состарѣлся въ пріобрѣтенныхъ имъ добродѣтеляхъ, прежде чѣмъ мы могли достаточно насладиться имъ, во всей силѣ этой преходящей жизни! Ни порокъ ни ухищренія не въ силахъ уже были поколебать его ума, ни совратить его душу, такъ сильно она была пропитана и закалена добродѣтелью! — Если бы и сводъ небесный обрушился, и тогда бы праведность этого мужа не поколебалась, сила ея не изнемогла бы, душа его бы не подвиглась, и мысль его не ослабѣла бы ни при какихъ трудныхъ испытаніяхъ” 10). Іоаннъ Евгеникъ такъ намъ говоритъ о кончинѣ своего брата: “Такимъ образомъ, проживъ боголюбиво и во всемъ свѣтло отличившись въ жительствѣ въ молодости до божественной схимы, въ самой святой схимѣ, въ степеняхъ священническаго служенія, въ достоинствѣ архіерейскомъ, въ разсужденіяхъ о Православной Вѣрѣ и въ благочестивомъ и безстрашномъ исповѣданіи, достигнувъ уже 52 лѣтъ тѣлеснаго возраста, къ Тому, къ Которому, по Павлу, онъ желалъ разлучиться и быть съ Нимъ, Котораго добрыми дѣлами прославилъ, Котораго православно богословилъ, Которому во всей жизни угождалъ, къ Нему радуясь преставился мѣсяца іюня въ 23-й день” 11). Святитель пробылъ 14 дней въ мучительной агоніи; объ этомъ и о внутреннихъ причинахъ для этого, такъ разсказываетъ намъ Іоаннъ Евгеникъ въ болѣе пространномъ своемъ синаксарѣ, изданномъ S. Pétridés: “Проболѣлъ онъ 14 дней, при чемъ сама болѣзнь, какъ онъ самъ говорилъ, оказывала на него то же дѣйствіе, что и тѣ желѣзныя орудія пытокъ, какія примѣнялись палачами по отношенію къ святымъ мученикамъ, и которыя какъ бы опоясывали ребра и внутренности, сжимали ихъ и оставались прикрѣпленными въ такомъ состояніи и причиняли совершенно невыносимыя боли; такъ что казалось, что то, что не могли сдѣлать люди со священнымъ и страстотерпческимъ тѣломъ, это исполнила болѣзнь по несказаннымъ судамъ Провидѣнія, для того, чтобы Исповѣдникъ Истины и Страстотерпецъ и Побѣдитель всевозможныхъ страданій и Вѣнечникъ предсталъ Богу, пройдя чрезъ всѣ бѣды и то даже до послѣдняго издыханія, какъ золото въ печи испытанное, и благодаря этому еще больше почести и награды во вѣки воспріялъ отъ Праведнаго Судіи” 12).