С-2 шел на прорыв замыкающим (да еще и тринадцатым), получил повреждения, но все же, дошел до Киева.
Не участвовавшие в прикрытии переправ С-4 и С-9, находившиеся в Киеве, были 28 августа 1941 г. включены в состав Черниговского отряда речных кораблей Пинской военной флотилии и 3 сентября ушли в составе отряда вверх по Десне, к Чернигову. Приход кораблей в район Чернигова для пресечения попыток переправы противника оказался запоздалым - 260-я пехотная дивизия еще 30 августа беспрепятственно переправились через Десну и захватила плацдарм на ее левом берегу, у села Вибли, в 12 км восточнее Чернигова. Немецкий плацдарм расширялся: 8 сентября противником были атакованы железнодорожный и шоссейный мосты через Десну, их пришлось взорвать. В ночь на 9-е Чернигов был оставлен советскими войсками. Тяжелее всех пришлось 45-й и 62-й стрелковым дивизиям: отходя с арьергардными боями на юг по правому берегу Десны, к полудню 9 сентября они оказались прижатыми к берегу в излучине Десны у села Шестовицы, в 15 км южнее Чернигова. В штаб 31-го стрелкового корпуса смог пробиться политрук из 62-й стрелковой дивизии, доложивший о сложившейся обстановке. Командующий 5-й армии, генерал-майор танковых войск М.И. Потапов, приказал выдвинуть в район Шестовиц все переправочные средства и корабли Черниговского отряда для оказания помощи окруженным. Утром 10 сентября к Шестовицам вышли СКА С-4, С-9 и БКА №41. В 5 км ниже по течению, у села Слабино, встал на огневую позицию монитор "Смоленск" - предполагалось, что залпы его гаубиц не только остановят преследование, но и будут служить ориентиром для переправы выходивших к реке подразделений. К этому времени окруженные находились в отчаянном положении - прорваться или обойти Шестовицы им не удалось. На прибрежном лугу были подорваны орудия, сожжены трактора и автомашины. Красноармейцы, на подручных средствах и даже вплавь, пытались переправляться на левый берег Десны. Сторожевые катера и БКА №41 попали под пулеметный огонь, на бронекатере вышел из строя двигатель, и С-4, взяв его на буксир, начал уходить вниз по реке. Бронекатер при этом продолжал вести огонь из двух ДШК по огневым точкам противника. С-9 смог подойти вплотную к берегу, и на его палубу уже начали погружать тяжелораненых, когда отчаявшаяся спастись толпа красноармейцев бросилась на борт. Перегруженный, осевший сторожевой катер безуспешно пытался отчалить, когда из Шестовиц по нему открыла огонь 37-мм пушка. Несколько попаданий в машинное отделение и рубку привели к пожару, и С-9 сгорел на мелководье недалеко от правого берега.
С-4 пережил собрата только на один день. Путь отхода к Киеву для Черниговского отряда был отрезан 9 сентября, когда немцы захватили Остер. Поэтому к вечеру 11 сентября с кораблей, собранных в Ладинском затоне, было снято пулеметное вооружение и ценное имущество, после чего монитор "Смоленск", СКА С-4 и БКА N941 были подорваны. С-2 и С-3 такая же участь постигла 18 сентября 1941 г. в районе Киева, при оставлении города войсками.
До сих пор речь шла о катерах вооруженных артиллерийскими установками 40-К и 41-К и действовавших выше Киева. Боевая деятельность С-7, С-10, С-12, не фиксируется ни в одном из известных документов Пинской военной флотилии военного времени.[* Упоминаются два командира С-10 [ЦВМА. ф.З. оп.1. д.279].] У штаба флотилии в Пинске даже не было радиосвязи с Днепропетровским отрядом СКА - посылка отряду радиостанции "11 -АК" на автомобиле, планировалась только в августе. Вся информация о Днепропетровском отряде сторожевых катеров ограничена кратким упоминанием в отчете Г.И. Брахтмана, воспоминаниями командира С-7 лейтенанта И.О. Рогальского и упоминанием о командире СКА С-10 в записке контр-адмирала Д.Д. Рогачева, тогда уже командующего Волжской военной флотилией. Официально считается, что сторожевые катера Днепропетровского отряда были подорваны командами 25 августа 1941 г. при оставлении Днепропетровска. Но, как оказалось, не все...