Первоначально японские самолёты господствовали в воздухе, регулярно совершая вылеты на разведку и бомбёжку американских сил на Алеутских островах, но затем американцы опомнились, и их 11-я воздушная армия начала ответные атаки. Их сила была такой, что 18 июня "Кимикава-мару" ушёл от Кыски на стоянку к расположенному гораздо западнее острову Агатту, возвращаясь на Кыску только по ночам, обычно с грузом авиабензина, запасы которого корабль пополнил 27 июня в Оминато. Но американцы нашли и эту базу, и 3 июля Агатту "посетили с дружественным визитом" 7 бомбардировщиков В-24. Одна из сброшенных ими бомб разорвалась неподалёку от борта "Кимикава-мару", убив несколько человек из экипажа и нанеся небольшие повреждения кораблю. 7 июля "Кимикава-мару" покинул Агатту и отправился в Оминато, а затем в Йокосука, куда и прибыл 14-го числа.
Командир "Кимикава-мару" капитан 1 ранга Усуку Сюити проводит инструктаж экипажей гидросамолётов-разведчиков перед вылетом на разведку острова Кыска, 11 мая 1942 г.
Вверху: старт гидросамолёта-разведчика тип 0 с катапульты гидроавианосца "Кимикава-мару", в 250 милях от острова Кыска, 11 мая 1942 г. В глубине снимка справа можно различить силуэт крейсера 2-го класса "Кисо"
Внизу: старт гидросамолёта-разведчика тип 0 с катапульты гидроавианосца "Кимикава -мару"
После ремонта, проведённого в соседней Йокогаме, гидроавианосец покинул Йокосука 4 августа и вышел к острову Кыска под эскортом эсминца "Хокадзэ". При этом корабль нёс 6 новейших гидроистребителей A6M2-N, предназначенных для усиления авиагруппы на острове Кыска.
Прибыв на Кыску 13-го числа, уже на следующий день гидроавианосец отправился назад в Йокосука (прибыл 20 августа; в тот же день корабль получил нового командира — капитана 1 ранга Ясима Гэнтоку). При этом и по дороге на Кыску, и по дороге обратно он заходил на остров Парамушир. С 24 августа по 10 сентября "Кимикава-мару" сделал ещё один рейс на Кыску. 12 сентября гидроавианосец снова встал под загрузку: на этот раз он должен был доставить на Кыску личный состав 51-го базового отряда флота, 6 A6M2-N, 2 Е13А1, а также материалы для постройки зимних казарм для гарнизона острова.[* Первоначально гарнизоны Атту и Кыски планировали эвакуировать с наступлением зимы, но соображения престижа не позволили оставить острова, несмотря на бесполезность их удержания для Японии.] 17-го числа корабль покинул Йокосука и через два дня прибыл в Оминато, где погрузил на борт солдат и в тот же день отбыл к Кыске под эскортом верного "Хокадзэ". 25 сентября он прибыл на Кыску, разгрузился и на следующий день вместе с "Хокадзэ" отправился обратно в Оминато. 2 октября "Кимикава-мару" прибыл в Оминато, где застрял почти на две недели: только 14 октября он вышел в Йокосука под эскортом эсминца "Усугумо". Прибыв в Йокосука на следующий день, корабль немедленно начал грузиться для нового похода к Алеутам. Среди различных грузов гидроавианосец нёс 6 (по другим данным — 5) A6M2-N и 3 Е13А1. 21 октября "Кимикава-мару" вышел из Йокосука на Парамушир. Прибыв в Касивабара 25 октября, 2 ноября он вышел на Атту, куда и прибыл 6-го числа (западная бухта залива Гольцовой). В тот же день "Кимикава-мару" быстро выгрузил самолёты и покинул Атту, прибыв в Оминато 12 ноября. В Оминато он погрузил на борт четыре Е13А1 и 14 ноября вышел на Шумшу. 18-го числа корабль под эскортом эсминца "Усугумо" вышел из залива Катаока к Кыске, не доходя до острова, катапультировал самолеты и 24 ноября вернулся в Оминато.
Гидросамолёт-разведчик тип 0 гидроавианосца "Кимикава- мару" с бортовым номером Х-5 в полёте над тундрой острова Амчитка, Алеутские острова. Операция по разведке Алеутских островов, май 1942 г. В отличие от первых месяцев войны, самолёт перекрашен из светло-серого цвета в двухцветный камуфляж (тёмно-зелёный верх и серый низ), а бортовой номер из красного стал белым
Личный состав авиационной боевой части гидроавианосца "Кимикава-мару" на кормовой палубе. Хорошо видны рельсовые дорожки для транспортировки гидросамолётов. На переднем плане слева от середины снимка видна самолётная тележка. У левого края снимка видна хвостовая часть самолётной катапульты
Носовая палуба "Кимикава-мару" на переходе морем с острова Парамушир на остров Атту, февраль 1943 г. На заднем плане видна носовая артиллерийская площадка с зачехлённым 15-см орудием
Кормовая палуба "Кимикава-мару" на переходе морем на остров Атту, зима 1943 г. Хорошо видно обледенение палубы, авиационного оборудования и гидросамолётов
8 декабря корабль вышел из Оминато и на следующий день прибыл в Йокосука, которую покинул 16 декабря с новым пополнением самолётов для гарнизонов острова Кыска: 7 (по другим данным — 5) A6M2-N и 8 гидросамолётов-разведчиков. В связи с тем, что подходы к Кыске стали небезопасными, "Кимикава-мару" не стал подходить к острову, а выпустил четыре Е13А1 к юго-западу от острова Атту, и дальше они уже добирались своим ходом. Только обзаведясь эскортом в виде эсминца "Хацусимо", гидроавианосец смог, наконец, 23-го покинуть остров Симусю (Шумшу), куда он прибыл 20 декабря, и привезти остаток груза на Кыску. Корабль прибыл туда 25 декабря, быстро разгрузился и в тот же день покинул остров, отправляясь в Оминато, куда и прибыл 1 января 1943 г.
В новом году "Кимикава-мару" тоже не стоял без дела: уже 13 января он перешёл из Оминато в Йокосука, откуда вышел 19-го вместе с конвоем №10 к Парамуширу, неся на борту 8 A6M2-N (для Атту), 1 Е13А1 (для Кыски), а также 4 десантных катера типа "Дайхацу" и 2 десантных катера типа "Току Дайхацу". Прибыв к Парамуширу 28 января, гидроавианосец направился к Атту (прибыл 31 января) и Кыске (прибыл 1 февраля под эскортом эсминца "Усугумо"), после чего пошёл к Оминато (прибыл 5 февраля). Уже 9 февраля корабль снова покинул Оминато и 12-го числа к юго-западу от Атту запустил с борта 7 A6M2-N и 5 Е13А1, предназначенных для Кыски.
Похоже, японское командование эти полумеры не устраивали, и в следующий раз к Кыске было решено отправить целый конвой, получивший номер 21. Конвой, в который, кроме "Кимикава-мару" (нёс 6 A6M2-N и 3 Е13А1) входили транспорты "Авата-мару" и "Касадо-мару", лёгкие крейсера "Тама" и "Кисо", плюс тяжёлые крейсера "Нати" и "Мая" в виде дальнего эскорта. Конвой вышел из Йокосука 27 февраля, покинул Парамушир 7 марта и 10-го в 18:00 подошёл к острову Кыска. "Кимикава-мару" успел выгрузить 185 солдат и начал выгружать боеприпасы и материалы для строительства аэродрома, как в 21:00 конвой был вынужден покинуть остров вследствие угрозы авиационного налёта. При этом большинство грузов так и остались не выгруженными. Например, гидроистребители "Кимикава-мару" был вынужден выгрузить на Атту.