Два «Крагуя» с бортовыми номерами 02 и 03 и названиями «Милич» и «Вулич» в 1992-1995 гг. служили в 76-й резервной эскадрилье армии Республики Сербской. Они дислоцировались на полевом аэродроме у села Братунац и привлекались для поддержки наземных частей, воевавших в восточной Боснии и Герцеговине. После окончания войны «Милич» оказался в Сербии, где благополучно пережил и налеты авиации НАТО в 1999 г.
В ходе войны в Боснии и Герцеговине периодически появлялись сообщения об «Крагуе», использовавшемся мусульманскими формированиями с аэродрома Тузла. Там на самом деле находился один J-20, но это была не боевая машина, а один из самолетов первой серии, списанный в середине 80-х гг. и установленный перед зданием местного аэроклуба. Естественно, подниматься в воздух он уже не мог.
В 61-й смешанной эскадрилье легкой боевой авиации, входившей в состав армии Республики Сербской Краины, имелось пять «Крагуев». Три из них дислоцировались на аэродроме Борово Село (у границы Хорватии с Сербией), а два - в Кордуне (у восточной границы Хорватии с Боснией). В августе 1995 г. в результате наступательной операции «Олуя» хорватские войска овладели Кордуном. Среди захваченных там трофеев было и два J-20, находившихся в нелетном состоянии. После ремонта на предприятии в Великей Горице (под Загребом) их доставили на аэродром Земуник (у Задара). Однако эксплуатация хорватских «Крагуев» ограничилась использованием в качестве наземных учебных пособий.
Успешные действия хорватских войск привели к взятию под контроль всей территории бывшей Республики Сербской Краины, включая её последний оплот у границы с Сербией - Восточную Славонию и Баранью. Впоследствии сербские анклавы под контролем ООН были реинтегрированы в состав Хорватии. Одним из условий реинтеграции был вывод всего вооружения бывшей армии Республики Сербской Краины на территорию СРЮ. Среди них оказалось и три самолета J-20. Вместе с однотипной машиной из состава армии Республики Сербской их передали не ВВС и ПВО, а Управлению государственной безопасности сербского МВД.
«Крагуй» в музейной экспозиции
| Размах крыла, м | 10,64 |
| Длина самолета, м | 7,92 |
| Высота самолета, м | 3,04 |
| Колея шасси, м | 2,41 |
| Масса пустого самолета, кг | 1130 |
| Взлетная масса (с двумя 100-кг бомбами), кг | 1624 |
| Максимальная скорость, км/ч: у земли | 275 |
| на высоте 1500 м | 295 |
| Крейсерская скорость, км/ч | 210 |
| Скорость сваливания, км/ч | 88 |
| Дальность полета, км | 710 |
| Боевой радиус, км | 150-235 |
| Взлетная дистанция до высоты 15 м, м | 293 (в т.ч. 175 м разбега) |
| Посадочная дистанция с высоты 15 м, м | 324 (в т.ч. 120 м. пробега) |
Самолеты передислоцировали на аэродром Сремска Митровица и включили в состав авиаэскадрильи части специального назначения (JSO), участвовавшей в различных операциях, в том числе тайных, по прямому указанию президента Слободана Милошевича. В составе JSO «Крагуе» получили новый камуфляж с малозаметными опознавательными знаками (небольшим изображением сербского флага вверху вертикального оперения). В 1998 г. их привлекали для борьбы с албанскими партизанами в Косово. В тот период J-20 базировались на аэродроме у г. Клина. После начала весной 1999 г. воздушной операции НАТО против Югославии авиаэскадрилью JSO передислоцировали на аэродром Трстенику Кральева. Вследствие нескольких месяцев безделья личный состав эскадрильи начал встревать в конфликты и драки с военнослужащими Югославской армии, и вскоре вконец разложившуюся часть пришлось расформировать. Её самолеты перегнали на аэродром Лисичийи Ярак, где законсервировали. ВВС и ПВО Югославии списали свои J-20 ещё в 1996 г. Один из них (с/н 30136) был разоружен и продан в частные руки, получив гражданскую регистрацию YU-YAA. После 2000 г. большинство уцелевших «Крагуев» (как ранее принадлежавших ВВС, так и МВД) сосредоточили в белградском аэропорту «Никола Тесла», откуда постепенно распродали музеям и частным владельцам. Так самолет с с/н 30146 оказался в Великобритании (гражданская регистрация G-BSXD), а с с/н 30153 - во Франции (F-AZFR).