В июньскую лагерную смену в дружине "Янтарной" проводился Всесоюзный сбор лучших организаторов пионерской работы по месту жительства, а в дружинах "Лесной" и "Полевой" Всесоюзный сбор пионеров — организаторов атеистической работы. Такой сбор в Артеке проводился впервые и потребовал определенной подготовки. Коллектив сотрудников лагеря с честью справился с этой трудной задачей. Начальник дружин Е. А. Васильев и его пионерские вожатые много выдумки и смекалки вложили в содержание работы атеистического клуба "Прометей" с его интересными секциями "Истории, религии и атеизма", "Юных атеистов-химиков", "Юных биологов и любителей природы", "Юных астрономов", "Юных зоологов", "Крест красный против креста церковного", "Юных любителей кино", секции юных любителей поэзии и музыки, кукольный и теневой театр, которые средствами искусства пропагандировали атеистические идеи.
24 июня Артек посетил президент и председатель Совета Министров Республики Чад Франсуа Тромбалбай.
Международная лагерная смена по времени совпала с проведением IX Всемирного фестиваля молодежи и студентов в Софии. Было принято решение это событие отметить Малым артековским фестивалем. Зарубежные гости Артека из двадцати шести стран активно включились в работу по подготовке к фестивалю. На общем собрании руководителей был избран оргкомитет фестиваля, в состав которого вошли Галина Тарасова — представитель КМО СССР, Кольо Александров из Болгарии, Доротти Кемпка из Польши и француз Франсуа Мартинес.
Фестиваль в Артеке проходил с 28 июля по 8 августа. В его программе были массовые политические акции, спортивные соревнования, смотры, конкурсы и концерты художественной самодеятельности. Фестиваль в Артеке, проведенный в дни Всемирного фестиваля молодежи и студентов в Софии, стал существенным вкладом в укрепление дружбы между детьми различных стран. В конце международной смены была проведена конференция, на которой с докладами выступили сорок семь руководителей иностранных групп детей. Эта конференция была юбилейной, десятой с лета 1959 года, когда она впервые была проведена в Артеке.
В шестую лагерную смену в лагере был проведен Всесоюзный сбор красных следопытов, а в седьмую — сбор знаменосцев дружинных знамен. Оба сбора проводились по специальным программам, разработанным Центральным Советом Всесоюзной пионерской организации.
29 октября артековцы пионерским костром отметили 50-летие Всесоюзного Ленинского Коммунистического Союза Молодежи. Центральный Комитет ВЛКСМ за успешную работу по коммунистическому воспитанию пионеров-артековцев и в ознаменование 50-летия Ленинского комсомола наградил Артек памятным знаменем. Сотни сотрудников лагеря были награждены Почетными Грамотами ЦК ВЛКСМ, юбилейными значками "50 лет ВЛКСМ", значками "За активную работу в комсомоле" и "За активную работу с пионерами".
Последним в 1968 году сбором в Артеке был Всесоюзный сбор пионеров — активистов детских домов и школ-интернатов.
По итогам года пионерская студия лагеря "Артек-фильм" выпустила короткометражную кинокартину "Зарница" и два кино-журнала "Костер".
За год в дружинах Артека побывали более 26 тысяч советских пионеров. Летом в лагере отдыхали дети из 39 стран.
Январские штормы 1969 года на Черном море произвели впечатление даже на жителей городов и поселков южнобережья. Шестого и седьмого января море бушевало с невиданной силой. Волны с тяжелым грохотом обрушивались на берег. Шторм разрушил и разметал железобетонный мол в Артеке. Досталось и ялтинскому молу, который более девяноста лет сдерживал натиск волн и вот теперь не выдержал. Мощная каменная преграда не устояла.
В первую лагерную смену в Артеке собрались команды юнармейских отрядов военно-спортивной игры "Зарница". Итогом смены была большая военно-спортивная игра "Аю-Даг".
Вторая лагерная смена 1969 года была юнкоровской и проходила по специальной программе.
В марте была осуществлена реорганизация структуры управления лагеря.
В результате реконструкции и нового строительства, осуществленных в Артеке за последнее десятилетие, лагерь стал крупным воспитательно-оздоровительным учреждением. Необходимы были новые формы и методы руководства его деятельностью. Инициатором реорганизации был начальник Управления Артека Евгений Михайлович Рыбинский, заступивший на эту должность еще в апреле 1968 года.