В свою очередь, «ЛОК», представлявший собой доработанный корабль «7К», состоял из спускаемого аппарата (СА), бытового отсека со стыковочным агрегатом и двигателями ориентации и причаливания, приборно-агрегатного и энергетического отсеков, в которых размещались ракетный блок «И» и агрегаты системы энергопитания на кислородно-водородных топливных элементах. Бытовой отсек служил одновременно шлюзовой камерой при переходе космонавта в «ЛК» через открытый космос, для чего использовался лунный скафандр «Кречет». После этого лунный корабль с пристыкованным к нему блоком «Д» двигался бы 'с торможением к поверхности Луны до высоты примерно 3 км. По команде посадочного радиолокатора должен был включиться двигатель блока «Е», который обеспечивал дальнейшее торможение и зависание для выбора космонавтом места посадки.
Ракета-носитель «Н-1» в монтажно-испытательном корпусе космодрома Байконур
Ракета-носитель «УР-500К» получила название «Протон»
Беспилотный космический корабль «7К-Л1» готовится к облету Луны
Возвращение на Землю также имело свои особенности. Ввиду трудностей с точным «нацеливанием» корабля в очень узкий диапазон допустимых углов входа в атмосферу со второй космической скоростью, обеспечивающей нормальную посадку, был применен вариант торможения «с подскоком». Следовало задеть плотные слои воздуха буквально по касательной и сразу же выскочить из них, «притушив» скорость до первой космической, а затем вновь войти, но уже в конкретном месте и под определенным углом, чтобы попасть в нужный район посадки. Общее время экспедиции планировалось 11-12 суток
Весь комплекс, включавший ракету-носитель «Н-1» и головной блок «ЛЗ», получил название «Н1-ЛЗ» (индекс 11А52). Подготовить первую полноценную экспедицию на Луну предстояло в очень сжатые сроки – в 1967-68 гг. Но работа по реализации проекта вскоре застопорилась из-за разногласий между С.П.Королевым и главным конструктором двигательного ОКБ-456 В.П.Глушко: «бог огня» отказался разрабатывать для «Н-1» кислородно-керосиновый ЖРД, как того требовал Королев, а настаивал на необходимости создания двигателя на токсичных компонентах топлива.
Руководство страны попыталось ускорить ход событий, издав 3 августа 1964 г. Постановление ЦК КПСС и СМ СССР №655-268 «О работах по исследованию Луны и космического пространства». Видя недостаточный темп развития программы «Н-1» и трудности проекта «Союз», оно наметило облет Луны по варианту, предложенному фирмой Генерального конструктора В.Н.Челомея (ОКБ-52) и получившему название «УР500К-ЛК». По сути, новый вариант был той же программой «Союз», но избавленной от многочисленных стыковок на околоземной орбите за счет применения созданной в ОКБ-52 более мощной, чем «Р-7», ракеты-носителя «УР-500К» (8К82К), которой дали имя «Протон». Ее получили путем доработки двухступенчатой баллистической ракеты «УР-500» (8К82) – носителя 100-150-мегатонной термоядерной бомбы. ОКБ Челомея поручили делать и пилотируемый корабль, предназначенный исключительно для облета Луны. Работа была начата, однако занятые доводкой «Протона» специалисты ОКБ-52 не смогли уделить достаточного внимания решению этой задачи. В то же время, у Королева работы по созданию «ЛОК» на базе проекта корабля «7К» продвигались вполне удовлетворительно. И он выдвинул идею установить на «УР-500К» корабль с «Н-1», но в облегченном варианте – без бытового отсека. Кроме того, он предложил заимствовать с комплекса «Н1-ЛЗ» разгонный блок «Д». 26 августа 1965 г. у председателя Военно- промышленной комиссии при ЦК КПСС Л.В.Смирнова состоялось совещание, констатировавшее, что лунная программа реализуется неудовлетворительно, в результате чего «возникает серьезная угроза утраты приоритета Советского Союза в области освоения космоса». Предложения Королева были признаны способными исправить положение и полностью одобрены. Силу закона они получили после принятия Постановления ЦК КПСС и СМ СССР от 25 октября 1965 г. «О сосредоточении сил конструкторских организаций промышленности на создании комплекса ракетно- космических средств для облета Луны».
Таким образом, предложенный ранее проект «Союз» был отвергнут, разработка блоков «9К» и «11 К» прекращена, а пилотируемый корабль «7К» подвергся значительным изменениям. Фактически на его базе в ОКБ-1 стали разрабатывать три разных по назначению корабля. Один – уже упоминавшийся «ЛОК» для полета на Луну в составе комплекса «Н1-ЛЗ», другой – для облета Луны в составе комплекса «УР-500К-7К-Л1», третий – для отработки и испытаний бортовых систем первых двух кораблей на орбите Земли и решения широкого круга задач в околоземном пространстве с помощью модифицированной ракеты «Р-7». Второму кораблю присвоили индекс «7К-Л1» (11Ф91), а третьему – «7К-ОК» (11Ф615). Для будущих публикаций ему, по предложению Королева, в память об истоках оставили название «Союз». В процессе запуска этих кораблей предполагалось, в первую очередь, отработать средства сближения и стыковки космических аппаратов на орбите Земли.