Очевидно, пример Египта вдохновил приобрести новую технику Тунис, который заказал 12 L-59T. Эта модификация отличалась от египетской лишь тем. что на ней не предусмотрена подвеска советских образцов вооружения. В качестве прототипа использовали все тот же самолет 0101. Поставки были осуществлены в 1995-96 гг.
Другое направление в развитии -Альбатроса- возникло. когда -Аэро-Водоходы- решили принять участие в программе JPATS (Joint Primary Aircraft Training System), предусматривавшей создание единого учебно-тренировочного самолета первоначальной подготовки для Вооруженных сил США В этом конкурсе испытали свои силы почти все известные мировые компании, занимавшиеся созданием УТС. Водоходовцы стали примеряться к американским требованиям еще в 1990 г.. параллельно изучая возможности -вестернизации- серийного L-39C и улаживая с СССР спорные вопросы. связанные с использованием на машине советского оборудования. Работы над самолетом, названным L-139 Super Albatros (или Albatros 2000), велись под руководством Доброслава Рака. В 1991 г. был заключен ряд соглашений с западными партнерами. 15 июня -Аэро-Водоходы- подписали меморандум с американской компанией Garrett, позже вошедшей в состав корпорации Allied Signal. Он касался использования на -Супер Альбатросе- двигателя -Гаррегт- TFE 731-4, который развивал практически такую же тягу, что и АИ-25ТЛ – порядка 1800 кгс. но выгодно отличался от него меньшим на 15% расходом топлива. В сентябре начались конструкторские работы, связанные с пересадкой нового -сердца-, а из Штатов прибыл макет -Гаррета- для практической отработки компоновочных решений. Предполагалось, что различные агрегаты для силовой установки самолета, включая ВСУ. будут поставлять американские фирмы Abex, Ametek, Lucas.
В полете – L-39MS с подвешенными ракетами Р-Зи блоками НАР УБ-16
Отработка стрельбы из пушки с борта L-39MS
Кроме того, машину решили оснастить целым рядом новых систем заокеанского производства Прежде всего, следует отметить прицельно-навигационный комплекс, который включал ИЛС. близкий к использованному на F/A-18. Существенную помощь во- доходовцам в этой работе оказали компании Bendix King и Flight Vision. У фирмы Litton была приобретена бортовая кислородная система OBOGS (On Board Oxygen Generation System), применяемая на самолетах ВМС США. На -Супер Альбатросе- собирались установить бортовую систему учета усталости планера FMS (Fatique Monitoring System) компании Esprit, что должно было позволить довести ресурс планера до 10000 летных часов. К проекту также привлекли британскую компанию Martin Baker, при содействии которой чехи доработали свое новое катапультное кресло VS-2. получившее обозначение VS-2A Особенностью новой системы спасения летчика стало катапультирование сквозь остекление фонаря кабины, что характерно для многих британских самолетов В довершение всего подкрыльевые узлы были приспособлены под системы вооружения, применяемые в НАТО.
Была предпринята попытка наладить сотрудничество с какой-либо крупной американской самолетостроительной компанией. Интерес проявила General Dynamics, однако из-за внутренних проблем этой фирмы сотрудничество быстро свернули.
В 1992 г. -Аэро-Водоходы- начали постройку двух прототипов, которые планировали собрать в следующем году. Однако из Штагов прибыл лишь один двигатель, и. не дождавшись второго, чехи решили завершить постройку одного L-139 (сер. № 5501). Чтобы успеть показать машину на очередном авиасалоне в Ле Бурже, работы велись круглосуточно в бешеном темпе. Старались как чешские, так и американские специалисты В начале апреля самолет выкатили из цеха, после чего на протяжении месяца он проходил наземные испытания. Первый вылет состоялся 8 мая 1993 г. Машину поднял в воздух экипаж в составе летчиков- испытателей Станислава Воганки и Ладислава Шныдра. Дебют оказался успешным. В тот день самолет летал еще дважды, причем в третьем полете был выполнен полный комплекс высшего пилотажа. До начала работы авиасалона L-139 успел совершить 25 полетов. В Париж он отправился своим ходом и получил на выставке неплохое реноме. В том же году – 139-и выставляли в Турции и Дубае, где он вызывал неизменный интерес, однако до заключения контрактов дело так и не дошло Не устроила машина и американцев, которые выбрали турбовинтовой Р-9 швейцарской фирмы Pilatus.