Ведущим испытателем "Аналога" назначили летчика ЛИИ О.В. Гудкова. Как обычно, перед первым вылетом он выполнил небольшой подлет (на высоту 1-2 м), во время которого обнаружил, что самолет трудно прижать к земле. Объяснение оказалось довольно простым – возник так называемый экранный эффект, выразившийся в заметном увеличении подъемной силы крыла с большой хордой при приближении к ВПП. Первый полноценный полет машины состоялся 18 апреля 1968 г., и до конца года она поднималась в воздух еще 63 раза В 57 случаях машину пилотировал Гудков
Опытный самолет МиГ-21-93
Второй экземпляр МиГ-21 И был закончен в конце 1969 г. Ведущим летчиком этой машины стал молодой пилот ЛИИ будущий космонавт И,П. Волк, который и поднял ее в первый полет в конце января 1970 г. Если полеты первого экземпляра "Аналога" были направлены в основном на отработку методики управления самолетом схемы "бесхвостка ". то на втором экземпляре исследовали изменение формы наплывов крыла Для этого машину оснастили сменными наплывами: с постоянной стреловидностью 78 по передней кромке и оживальной формы. В гаргроте и на вершине киля установили кинокамеры, а правое полукрыло оклеили шелковинками для фиксации на кинопленке картины обтекания Кроме того, на самолете смонтировали лазерную систему визуализации обтекания крыла. На верхней и нижней его поверхностях были смонтированы датчики полного и статического давления.
Полеты МиГ-21 И проводились на высотах до 12 км при числах М до 2.06 Для моделирования поведения будущего пассажирского лайнера летали с разными значениями центровки, которую изменяли путем установки грузов массой от 277 до 290 кг в носовой или хвостовой частях фюзеляжа. Полетная масса первого «Аналога» находилась в пределах 6550-7930 кг, второго – 6260-7640 кг
Летные исследования на МиГ-21 И (научный руководитель – И.М. Пашковский) позволили изучить практически все особенности динамики полета и управляемости, свойственные <бесхвостке>, а также в широком диапазоне углов атаки и чисел М оценить пилотаж ные качества, исследовать режимы сваливания и штопора. В полетах приняли участие 16 летчиков-испытателей, в том числе будущие члены экипажа Ту-144 Э. В Елян и MB. Козлов. «Аналог» оказался довольно прост и удобен в пилотировании, летчикам даже нравилось летать на нем. Ввиду большей площади крыла он обладал высокой маневренностью, однако разгонялся медленней, чем истребитель.
Уже после завершения основной программы испытаний, 28 июля 1970 г, заканчивая очередной полет, первый Аналог» разбился. Произошло это по вине летчика-испытателя ЛИИ B.C. Константинова, который в то время готовился к показу элементов высшего пилотажа на обычном МиГ-21 на авиасалоне в Ле Бурже. В совершенстве отрепетировавший свою программу на серийной машине, пилот решил несколько ее элементы повторить на Аналоге однако не учел различия в пилотажных свойствах самолетов. В результате ошибки летчика машина потеряла скорость и стала плашмя падать вниз. МиГ-21И упал в центре аэродрома, и хотя пилоту удалось катапультироваться, но высоты для отделения от кресла не хватило, и он погиб Полеты второю экземпляра завершились в 1972 г.. после чего самолет передали Музею ВВС в Монино.
Вторая жизньК началу 1990-х гг МиГ- 21 уже явно устарел, однако парк «двадцать первых- был огромен: более 6500 машин в почти 40 странах мира! Большинство из них обладало еще достаточно большим остатком ресурса, было прекрасно освоено летным составом, имело налаженную систему техобслуживания и ремонта, и, чтобы и далее оставаться грозными воздушными бойцами, им требовалось лишь обновить бортовую электронику, прогресс которой в течение 1970-1990 гг. был огромен. При этом коммерческая привлекательность модернизации привела к тому, что среди желающих поучаствовать в ней оказалось не только ОКБ Микояна.
Конечно, микояновцы разработали свое предложение на модернизацию и передали его в государственную компанию «Росвооружение которая разослала его в большинство стран, эксплуатировавших МиГ-21. Оно основывалось на оснащении самолета новейшим БРЭО, в том числе разработанной НПО Фазотрон легкой малогабаритной РЛС «Копье . Станция обеспечивала обнаружение, захват и сопровождение воздушных целей в свободном пространстве и на фоне земли или моря, в том числе вертолетов на режиме висения, сопровождение целей с сохранением режима обзора, выбор и атаку двух наиболее опасных из них, быстрый поиск и автоматический захват визуально видимых целей в режиме Ближний бой- с применением управляемых ракет и пушки, картографирование местности Дальность обнаружения воздушных целей РЛС Копье» намного превышала соответствующий параметр станции РП-22 истребителя МиГ-21 бис. Так, она обеспечивала обнаружение, захват и сопровождение цели типа МиГ-21 на фоне свободного пространства на встречных курсах на дальности до 57 км, на догонных курсах – до 30 км, а на фоне земли на встречных курсах – до 57 км, на догоне – 25 км, Обнаружение же наземных или морских радиоконтрастных целей обеспечивалось на дальностях до 100 км