Кроме того, в ВВС РФ входят еще 30 эскадрилий и отрядов, переданных из ВДВ, РВСН и РХБЗ, а также 7 авиачастей, занятых испытаниями ЛА.
Сокращения: АвБ – авиабаза, АвБ (ОН) – авиабаза (особого назначения), АвБ АА – авиабаза армейской авиации, АГ – авиагруппа, УАвБ – учебная авиабаза, УЦ БП – учебный центр боевой подготовки, ЦПАТ – Центр показа авиатехники, ЦПАП и ПВИ – Центр подготовки авиационного персонала и проведения войсковых испытаний
По состоянию на середину 2012 г. в состав ВВС РФ входят 7 оперативно-стратегических командований: Дальней авиации, ВТА, Оперативно-стратегическое командование воздушно-космической обороны (ВКО), 1-е командование ВВС и ПВО (территория бывшего Ленинградского ВО), 2-е (Сибирского и Забайкальского округов), 3-е (Дальневосточного ВО), 4-е (Северокавказского ВО и Приуральского ВО). В них входят 15 АвБ первого и второго разрядов, 8 АвБ армейской авиации, 2 учебные АвБ. К настоящему времени сократили около 25000 из 65000 офицерских должностей, количество летных экипажей уменьшили с 12000 до 7000. В 2012 г. предполагается выйти на численность ВВС в 170000 человек, из которых около 40000 – офицеры. Количество военных авиационных вузов уменьшили до трех: в Воронеже (подготовка специалистов ВВС нелетных специальностей), Краснодаре (летные специальности), Ярославле (специалисты ПВО). В 2008 г. были объединены ВВА им. Ю.А. Гагарина и ВВИА им. Н.Е. Жуковского. Главной причиной этого, по мнению многих, стала не оптимизация структуры, а большая стоимость участка земли в Москве, на котором располагалась академия им. Жуковского. С лета 2011 г. начался перевод академии в Воронеж, где после слияния с Воронежским авиационным инженерным университетом будет создан Военный учебно-научный центр ВВС «Военно-воздушная академия им. профессора Н.Е.Жуковского и Ю.А.Гагарина». Ряд бывших руководителей академий называют происходящее «безумием и падением в бездну». По их мнению, ущерб от потери научного потенциала, педагогических кадров и методической базы значительно превысит пользу от проводимой реформы.