ОСАПОН — отдельный смешанный авиационный полк особого назначения, Авиационный отряд специального назначения
| Название | Аэродром | Тип ЛА |
| АОСН | Москва | Як-40, Ка-226, AS.355, Ми-34/8, дирижабли, аэростаты |
| АОСН | Санкт-Петербург | Ка-226 |
| АОСН | Казань | Ка-226, R-44, Ми-8, L-410 |
| АО СН | Краснодар | Ка-226 |
| АО СН | Волгоград | Ка-226 |
| АОСН | Воронеж | Ка-226 |
| АОСН | Уфа | Ка-226 |
| АО СН | Нальчик | Ка-226, Ми-8 |
| АО СН | Новосибирск | Ми-8 |
| АО СН | Якутск | Ми-8 |
| АО СН | Кемерово | Ми-8, L-410 |
| АОСН | Омск | Ми-8 |
| АОСН | Самара | Ми-8 |
| АОСН | Петропавловск-Камчатский | Ми-8, Ми-2 |
| АОСН | Пермь | Ми-8 |
| АОСН | Ростов-на-Дону | Ми-8 |
| АОСН | Барнаул | Ми-8 |
| АОСН | Красноярск | Ми-8, Ка-226 |
| АОСН | Ленинск | R-44 |
| Название | Аэродоом | Тип ЛА |
| ЦАБ | Раменское/Домодедово | Ил-62/76, Як-42, Ка-32, Во. 105, ВК-117, ЕС-145, Ми-8/26, Бе-200ЧС |
| АвБ | Хабаровск, Петропавловск-Камчатский, Владивосток, Якутск, Южно-Сахалинск | Ми-8, Ан-74, Бе-200ЧС, Ми-26 |
| АвБ | Коаснояоск | Ми-26, Ан-ЗТ, Ан-74, Бе-200ЧС, Ми-8 |
| АвБ | Владимир | Ми-26, Ми-8 |
| ОАСО | Ростов-на-Дону, Сочи, Ставрополь, Нальчик | Ка-32, Ан-ЗТ, Ми-8 |
| АЭ | Нижний Новгород | Ми-8 |
| АЭ | Санкт-Петербург, Калининград | Ми-8 |
ЦАБ – центральная авиационная база; ОАСО – отдельный авиационный спасательный отряд
Российская авиация получила значительный боевой опыт в ряде конфликтов новейшего времени. В 1994-96 гг. российские ВВС принимали участие в Первой Чеченской войне (см. «АиВ», № 5'95). К боевым действиям активно привлекались Су-25, Су-24, Ту-22МЗ, Ми-8, Ми-24, ПВО района конфликта обеспечивали МиГ-29, Су-27 и А-50. К началу конфликта на аэродромах сосредоточили 515 самолетов и 70 вертолетов, число последних вскоре увеличили до 84, а затем и до 105.
В распоряжении дудаевского правительства Чеченской республики в 1992 г. находились 111 L-39,149 L-29 *, 3 МиГ-17, 2УТИ МиГ-15 из состава Ставропольского ВВАУЛШ, Армавирского ВВАУЛ и УАЦ ДОСААФ, а также другая авиатехника, в т.ч. несколько Ми-8. Процент исправности этого парка к концу 1994 г. составлял около 40%. На службе находилось около 50 пилотов.
28 ноября-1 декабря 1994 г. на аэродромах Ханкала и Калиновская российская авиация уничтожила 155 чеченских самолетов и 3 вертолета. Та же участь постигла 6 Ту-134, 1 Ту-154, 3 Ми-8 и 6 Ан-2, дислоцировавшихся на аэродроме Грозный- Северный. Кроме того, к тому моменту уже были сбиты, как минимум, 3 чеченских вертолета, по одному Ан-2 и L-39. С 19 по 24 декабря в результате бомбардировок были уничтожены оставшиеся 100 L-29 и L-39.
Поданным автора, федеральные войска потеряли 6 самолетов (5 Су-25 и 1 Су-24) и 22 вертолета (6 Ми-24 и 16 Ми-8). При этом общий налет (включая ВТА и ТА) составил 38000 ч.
Начиная с 1999 г., российские ВВС принимали участие во Второй Чеченской войне. При этом активно использовались Су-25, Су-24, Су-24МР, Ан-30, Ми-8, Ми-24, менее интенсивно – МиГ-25РБ и Ми-26. Боевое крещение в районе конфликта получили вертолеты Ка-50. На сентябрь 1999 г. в составе группировки федеральных сил насчитывалось 68 вертолетов (32 Ми-24, 26 Ми-8, 2 Ми-9 и 8 Ми-26). За время активной фазы конфликта российская авиация выполнила более 21000 вылетов. Поданным автора, за 1999-2011 гг. в небе Чечни было потеряно 9 самолетов (7 Су-25 и 2 Су-24) и 67 вертолетов (3 Ми-26, 22 Ми-24, 41 Ми-8, тип еще одного установить не удалось).
В конфликте также принимала участие авиация МВД, ФСБ, ФПС и даже МЧС (Ми-26). В марте 2001 г. в зону конфликта на Ан-22 перебросили 20 Ми-8 и Ми-24 из Гудауты и Вазиани, откуда их вывели во исполнение Стамбульских соглашений от 1999 г.
За время конфликта также уничтожены по одному чеченскому Ан-2 и Як-18. Еще 4 ЛА изъяли при зачистках.
Обе войны, несмотря на весь их трагизм и жестокость, позитивно сказались на развитии авиации силовых ведомств РФ. Экипажи получили неоценимый боевой опыт, политическому руководству пришлось обратить самое пристальное внимание на проблемы Вооруженных сил в целом и авиации в частности.
Кроме двух Чеченских войн, авиация силовых ведомств РФ несла потери и в других конфликтах. Так, в 1992 г. два Ми-26 сбили в районе Нагорного Карабаха. В 1992-93 гг. в Абхазии и Южной Осетии были потеряны 3 Ми-8, по одному Су-27, Су-25, еще один Ми-24 сбили в 2000 г. В 1997 г. в Таджикистане был сбит Ми-8.
В августе 2008 г. российская авиация участвовала в вооруженном конфликте в Южной Осетии. Анализ эффективности ее применения до сих пор не сходит со страниц прессы, уж очень много вопросов осталось. По официальным российским данным, потери составили 5 машин: один Ту-22МЗР и 3 Су-25 засчитали как сбитые грузинской ПВО, а один Ми-8 – разбившимся при посадке. Независимые эксперты называли другие цифры, например, 6 Су-25 и один Ту-22МЗР или 4 Су-25, 2 Су-24 и один Ту-22МЗР. У Грузии своя правда: сначала ее представители говорили о 21 сбитом российском самолете и трех вертолетах, затем уменьшили количество своих побед до 14 самолетов.
В конце 1990-х гг. ВВС РФ стали участником резонансного международного инцидента. 15 января 1998 г. пара Су-27 из 689-го ГИАП (аэродром Нивенское) впервые на постсоветском пространстве принудила к посадке самолет-нарушитель воздушной границы. На калининградском аэродроме Храброво был посажен L-29 с эстонской регистрацией, который пилотировали британские летчики, летевшие из Каунаса в Гданьск.