Военно-морские силы Финляндии имели в своем составе 2 броненосца береговой обороны, 5 подводных лодок, 4 канонерских лодок, 7 сторожевых кораблей, 10 сторожевых катеров, 10 надводных заградителей, 25 тральщиков, 5 торпедных катеров, 4 минных катера, 2 плавучие базы.
Они были приведены в полную боевую готовность в первой половине июня, а 16 июня их разделили на две группировки. Половина кораблей финского флота, в том числе оба броненосца, дислоцировались в Або-Аландских шхерах Подводные лодки, минные заградители и большинство сторожевых катеров финского флота базировались на порты Финского залива
Военно-морские силы Финляндии должны были: а) не допустить проникновения советских кораблей в Ботнический залив; 6) оборонять Або-Аландский архипелаг и шхеры Финского залива; в) нарушать наши сообщения, проходящие вдоль Финского залива из Таллина на Ханко и в Рижский залив. Кроме того, Финляндии была поставлена задача — уничтожить военно-морскую базу КБФ на полуострове Ханко.
Начиная с весны 1941 г. немцы и финны регулярно вели воздушную разведку северной части Балтийского моря, Финского залива и районов, прилегающих к советскому побережью, углубляясь в материк на 10 — 15 км. С целью разведки в Балтийском море были развернуты на позициях немецкие подводные лодки. По данным радиоразведки, в течение мая и июня 1941 г. подводные лодки противника находились на позициях в устье Финского залива, западнее острова Хиума, на подходах к Вентспилсу, Либаве и Клайпеде. Морская разведка обнаружила сосредоточение немецких кораблей в базах Балтийского моря, усиление противовоздушной обороны баз, переброску немецких войск и вооружения в Финляндию, а также сосредоточение войск в пограничных районах.
Угрожающая обстановка на границе и отсутствие документов по совместному действию флота и армии были учтены командованием КБФ. Штаб флота совместно со штабом ПрибОВО разработал план взаимодействия (так называемый «план прикрытия»).
План прикрытия ставил флоту следующие задачи:
1. Не допустить неожиданного подхода противника с моря и высадки десанта па побережье.
2. Создав минно-артиллерийские позиции, не допустить проникновения противника в Рижский и Финский заливы.
3. Не допускать захвата десантом противника военно-морских баз с моря и воздуха.
4. Содействовать войскам приморских флангов армии в обороне побережья.
5. Нарушать морские сообщения противника и обеспечивать свои.
При выполнении задач, поставленных «Планом прикрытия», КБФ надлежало непосредственно взаимодействовать с 8-й армией.
Исходя из сложившейся тревожной обстановки, ВС КБФ получил разрешение наркома ВМФ перевести из Либавы в Ригу плавбазы и 1-ю бригаду подводных лодок. В Риге форсировались работы по строительству причалов и завозу необходимых видов боевого снабжения. Был срочно выведен из Либавы в Таллин ремонтировавшийся МЗ «Марти».
Уже в мае началось несение дозорной службы на подходах к Ирбенскому проливу и на походах к устью Финского залива.
При появлении немецких самолетов наша зенитная артиллерия открывала огонь, истребительная авиация поднималась в воздух, но ни один самолет сбит не был. Незадолго до начала войны последовало распоряжение высшего командования ограничить зону открытия огня по германским самолетам пределами старой государственной границы и районом Ханко.
19 июня в 16.15 командующий КБФ, по указанию наркома ВМФ, приказал ввести на флоте оперативную готовность № 2. В ночь с 21 на 22 июня 1941 г. в дозорах находились: в устье Финского залива — БТЩ-216, подводная лодка М-99; в Ирбенском проливе — подводная лодка С-7, тральщик Т-297 («Вирсайтис»); на подходах к Таллину — СКЛ № 141; у Кронштадта — СКЛ № 223 и № 224; у Либавы — СКА № 212 и № 214.
Вечером 21 июня 1941 г. И.В. Сталин разрешил руководству НКО и НК ВМФ привести войска и силы флота в готовность № 1. На флоты немедленно были посланы условный сигнал, а затем и подробная директива о приведении сил флота в боевую готовность. В штабе флота условный сигнал был получен в 00.56 22 июня, а директива — в 2.32. Но мероприятия по приведению сил флота в боевую готовность начались сразу же после телефонного звонка наркома ВМФ командующему флотом в 23.37 21 июня.
В 4.50 22 июня ВС КБФ объявил но флоту. «Германия начала нападение на наши базы и порты. Силой оружия отражать всякую попытку нападения противника» (Хроника. Вып. 1. С. 9).