3 апреля 2014 г. Генеральная прокуратура Украины сообщила о задержании 12 бывших бойцов «Беркута» по подозрению в стрельбе в Киеве 18-20 февраля.
В этот же день и.о. генпрокурора Украины О. Махницкий, и.о. министра внутренних дел Украины А. Аваков, глава СБУ В. Наливайченко на совместной пресс-конференции заявили, что 18-20 февраля в Киеве активистов «Евромайдана» расстреливали снайперы группы «Альфа» Центра специальных операций СБУ и подразделения милиции специального назначения «Беркут» по приказу Президента В. Януковича. При этом журналисты и эксперты обратили внимание на многочисленные нестыковки и противоречия в приведенных украинскими силовиками фактах, а также в целом на шаткость «доказательной базы» озвученных ими обвинений.
3 апреля 2014 г. Генеральная прокуратура Украины выписала ордера на задержание и доставку в суд экс-главы СБУ А. Якименко. Выдачу ордера на его арест в Генпрокуратуре мотивировали обвинениями в организации так называемой антитеррористической операции.
4 апреля 2014 г. экс-глава МВД Украины В. Захарченко в интервью российскому «Первому каналу» отметил, что сотрудники милиции не виновны в массовых расстрелах на Майдане. По его мнению, и «Евромайдановцы», и сотрудники «Беркута» пострадали от стрельбы, которая велась из здания, находившегося под контролем так называемого коменданта Майдана А. Парубия. По словам В. Захарченко, А. Парубий контролировал и другие здания в центре города, в которых помимо прочего были оборудованы камеры пыток.
6 апреля 2014 г. на «Первом канале» показан репортаж, в котором сотрудники «Беркута», находящиеся в Киеве, задавали вопрос в камеру оператору: «Почему спилены деревья на Институтской улице, в которые попали пули снайперов?»
9 апреля 2014 г. опубликовано заявление генерала грузинской армии Т. Цителашвили, в котором он заявил, что в Киеве работали четыре грузинских снайпера, которые находились там по указанию бывшего Президента Грузии М. Саакашвили, а непосредственно ими руководили Гиви Таргамадзе и Гиа Барамидзе.
10 апреля 2014 г. председатель временной следственной комиссии Верховной Рады Украины, изучающей причины гибели людей на площади Независимости в Киеве во время акций протеста в феврале 2014 г., депутат парламента Г. Москаль заявил о ряде упущений правоохранительных органов и Генпрокуратуры при расследовании этого дела. По его словам, «не были проведены баллистические и другие необходимые экспертизы, не изъяты снайперские винтовки, которые могли фигурировать в событиях февраля». Он особо подчеркнул, что «даже не собраны вещественные доказательства, пули находятся в разных больницах, и никто никакой экспертизы не проводит».
Ранее начальник медицинской службы МВД Украины О. Петраш на заседании временной следственной парламентской комиссии также высказал мнение, что «до сих пор не было собрано никаких вещественных доказательств», а пули, которые врачи извлекли из тел погибших, находятся «или в больнице, или у родственников, или просто утеряны».
10 апреля 2014 г. в ходе заседания временной следственной комиссии Верховной Рады заместитель начальника спецподразделения МВД Украины «Сокол» А. Ершов признал, что 20 февраля в здании Кабинета министров находились два снайпера этого спецподразделения. При этом А. Ершов подчеркнул, что они не находились на крыше здания и не вели огонь по протестующим. По его словам, баллистическая экспертиза изъятого у снайперов оружия не проводилась, а была проведена лишь служебная проверка.
15 апреля 2014 г. в Киеве у здания Апелляционного суда радикалы из «Правого сектора» заблокировали около 60 бывших бойцов подразделения «Беркут», которые пришли поддержать своих коллег, подвергающихся уголовному преследованию по подозрению в «массовых расстрелах 18-20 февраля». Национал-радикалы в масках и с палками закидали бывших спецназовцев яйцами, потребовали встать на колени и «извиниться перед народом». Конфликт продолжался около двух часов и разрешился только после вмешательства подъехавшего начальника киевской милиции.
22 апреля 2014 г. группа хакеров, именующая себя «КиберБеркут», опубликовала на своем сайте «взломанную» ими переписку и.о. министра внутренних дел Украины А. Авакова со своим бывшим пресс-секретарем, журналистом Д. Бруком. Из переписки следует, что убийство 25 марта 2014 г. координатора «Правого сектора» в Западной Украине А. Музычко (Сашко Билого) было спланировано А. Аваковым, а в качестве компенсации за его смерть лидер «Правого сектора» Д. Ярош потребовал «посадить» бойцов «Беркута» (5-7 человек и обязательно командира роты). На этих условиях «Правый сектор» согласился не мстить А. Авакову за смерть соратника.