20 мая 1895 г. произведен в штабс-капитаны гвардии с переименованием в капитаны Генерального штаба. По Генеральному штабу вначале состоял при штабе Финляндского военного округа, а затем до 1897 г. обер-офицером для поручений при штабе 18-го армейского корпуса. С 13 октября
1898 г. по 13 октября 1899 г. отбывал стаж командира роты в Лейб-гвардии Егерском полку.
С 21 октября 1899 г. и до самого начала Первой мировой войны в августе 1914 г. П.К. Кондзеровский прослужил без перерыва в Главном штабе на Дворцовой площади, «куда, — как он пишет о себе сам, — я поступил капитаном, а откуда уезжал генералом»{~1~}.
За эти 15 лет он, начав младшим делопроизводителем канцелярии военно-ученого комитета Главного штаба в октябре 1899 г., стал уже в декабре 1904 г. полковником и начальником отделения по назначению на должности. С 14 октября 1907 г. полковник Кондзеровский занимает ключевой пост и.д. помощника Дежурного генерала Главного штаба при быстро выдвигавшемся генерал-лейтенанте А.З. Мышлаевском, ставшем в мае 1908 г. Начальником Главного штаба, а в 1909 г. -Начальником Генерального штаба.
2 декабря 1908 г. Кондзеровский назначается на ответственную должность Дежурного генерала Главного штаба с производством (6 декабря) в генерал-майоры.
Помимо всех назначений личного состава армии, Дежурный генерал был докладчиком на Высшей Аттестационной Комиссии, которая под председательством Военного Министра решала все назначения на должности начальников дивизий и выше, равно как и увольнения высших чинов{~2~}.
19 июля 1914 г. генерал-майор П.К. Кондзеровский был назначен Дежурным генералом при Верховном Главнокомандующем и прибыл с его штабом в Барановичи, будучи непосредственно подчинен начальнику штаба Верховного Главнокомандующего генералу Янушкевичу.
6 декабря 1916 г. он был произведен в генерал-лейтенанты и имел уже все ордена (кроме Георгиевского оружия и ордена Св. Георгия) всех степеней, доступных для его чина, однако без мечей, как это было решено в начале войны по отношению ко всем служившим в Ставке или в высших штабах офицерам и генералам.
После Февральской революции П.К. Кондзеровский продолжал оставаться на своей должности и при Верховном Главнокомандующем генерале М.В. Алексееве.
Однако вскоре военный министр Временного правительства А.И. Гучков, предполагавший назначить, по совету генерала М.В. Алексеева, генерала П.К.Кондзеровского Начальником Главного штаба, не только отказался от этого назначения, но и заявил лично Кондзеровскому, что не может оставить его на должности Дежурного генерала{~3~}.
Генерал П.К. Кондзеровский был назначен членом Военного Совета в Петрограде, т.е. был, по его собственному выражению, «сдан в архив»{~4~}, а его место в Ставке должен был занять генерал-лейтенант В.Н. Минут. В связи с задержкой прибытия последнего П.К. Кондзеровский временно оставался на своей должности до 24 мая 1917 г. Он выбыл в отпуск в Кисловодск, когда в Ставку приехал уже новый военный министр — А.Ф. Керенский, не возражавший против отпуска{~5~}.
Вернувшись в Петроград, генерал Кондзеровский остался не у дел, утеряв и личные связи с новым руководством Главного штаба (это видно, например, из того, как он рекомендовал генералу Юденичу в качестве начальника штаба 1-го стрелкового корпуса Северо-Западной армии генерал-майора С.Н.Самарина (см. его биографию), которого он летом 1917 г. ошибочно считал сторонником генерала Корнилова.) В 1918 г. генерал П.К. Кондзеровский перебрался с семьей в Финляндию.
По возвращении генерала Юденича из Стокгольма в январе 1919 г. в Выборге был избран Особый комитет (или, как он иногда именовался, Национальный Русский комитет). При нем был создан военно-политический центр во главе с генералом Юденичем.
В состав центра вошел генерал П.К. Кондзеровский под псевдонимом генерал Кондырев, вскоре ставший и. д. начальника штаба Главнокомандующего. Когда 24 мая 1919 г. генерал Юденич утвердил согласно проекту А.В. Карташева состав Политического Совещания при Главнокомандующем, генерал П.К. Кондырев (Кондзеровский) вошел в него по должности, как начальник штаба.
Однако приказ по Северо-Западной армии о назначении генерала Кондырева на должность начальника штаба при Главнокомандующем был отдан позже — 26 июля 1919 г., тогда же, когда генерал Кондырев был зачислен в Северо-Западную армию.
Возможно, эта задержка объясняется тем, что сам генерал Юденич официально, Указом Верховного Правителя адмирала А.В. Колчака был назначен лишь 5 июня «Главнокомандующим всеми Российскими сухопутными и морскими силами, действующими против большевиков [в] Прибалтийском районе»{~6~}.
О деятельности генерала Кондырева в Политическом Совещании можно отчасти судить по характеристике, данной ему ближайшим сотрудником А.В. Карташева, видным членом Национального Центра инженером Г.И.Новицким, бывшем в курсе всех дел Политического Совещания. Он поддерживал конспиративные связи с руководством Национального Центра в Петрограде и эта сторона его деятельности, видимо, была причиной того, что в ЧК его считали начальником разведки при генерала Юдениче{~7~}. В то же время Г.И. Новицкий регулярно информировал о ходе дел в Гельсингфорсе П.Б. Струве, уехавшего в Париж и Лондон для поддержки там Белого движения на северо-западе.
В письме к Струве от 3 сентября 1919 г. Г.И.Новицкий писал, что «Кондзеровский всю жизнь прослужил в Главном штабе в отделе чинов, наград и производств. Тихий, узкий, бумажный, канцелярский человек, без горизонтов и размаха; в политике обыватель, притом из числа неосведомленных, не чувствующих и, так сказать, заплесневелых»{~8~}.
Генерал Юденич, что видно из его обширной переписки с генералом Кондзеровским, находящейся в Бахметьевском архиве Колумбийского университета, ценил генерала Кондзе-ровского не только как знатока канцелярской механики, освобождавшего его от излишнего чтения приходивших бумаг, но и как безупречного исполнителя его воли и в Политическом Совещании и позже, на заседаниях Северо-Западного правительства, которых он стремился избегать.
В связи с образованием Северо-Западного правительства 13 августа 1919 г. и роспуском Политического Совещания генерал Кондырев был назначен приказом от 2 октября 1919 г. помощником Главнокомандующего по должности военного министра.
Вынужденный принять должность военного министра ради получения вооружения и снабжения Северо-Западной армии, генерал Юденич, насколько это было возможным, избегал принимать участие в заседаниях Северо-Западного правительства, сформированного английским генералом Марчем, предоставив эту роль генералу Кондыреву.
Генерал Кондырев в качестве помощника военного министра стал регулярно присутствовать на заседаниях правительства. Его член — М.С. Маргулиес, сообщает в своем дневнике от 7 октября 1919 г., что «...Кондырев назначен Юденичем товарищем военного министра, причем Юденич просил допускать его во все заседания вместо себя»{~9~}.
Деятельность генерала П.К. Кондырева-Кондзеровского далеко не ограничивалась в этот период посещением заседаний Северо-Западного правительства. Находясь в Ревеле, он следил за выгрузкой приходящего из Англии вооружения и имущества. Видя, что генерал Г.Д. Янов явно не соответствует должности начальника снабжения Северо-Западной армии, он настоял на назначении на эту должность генерала А.В. Владимирова, что было утверждено приказом по армии от 30 ноября 1919 г.
В своих почти ежедневных рапортах-отчетах в Нарву, где находился генерал Юденич, генерал Кондырев сообщал ему из Ревеля не только о текущих делах, но и о новоприбывающих в Северо-Западную армию офицерах и генералах. В частности, о прибытии Донского атамана генерала П.Н. Краснова с супругой, готового служить на любой должности. Генерал Кондырев упоминает в этом же письме о своих хлопотах о получении через генерала Вандама комнаты для генерала Краснова, где он мог бы жить и заниматься литературным трудом, пока не получит назначения{~10~}.
В вечернем добавлении («сейчас 9 ч. вечера») к письму от 3 октября, сообщая о прибытии корабля из Архангельска с эшелоном русских жандармов из французского иностранного легиона во главе с генералом Самариным, выразивших желание — в связи с уходом союзников из Архангельска — служить в Северо-Западной армии или у генерала Деникина, генерал П.К. Кондырев пишет, что он вызвал генерала Владимирова, с тем чтобы этих добровольцев не «раздергивали по всем полкам», а сохранили как надежный отряд при контрразведке. В то же время он докладывает генералу Юденичу, что желающих ехать к генералу Деникину он не задерживает{~11~}.