На плечи первой настоятельницы и сестер легло основное бремя трудов по устройству обители. Быстро продвигалось строительство в Пюхтицах — за один год на Святой горе появились временная трапезная, жилые дома-келлии, здание приюта для детей, хозяйственные постройки; были заложены святые врата с колокольней над ними, посажены деревья. Помимо больших строительных работ успешно налаживалась и молитвенная жизнь обители. В первый же год в ней был введен полный монастырский богослужебный круг, создано два монашеских хора: на церковнославянском и эстонском языках. Опытная в монастырской жизни, игумения Варвара с первых же дней существования обители сумела установить строгий монастырский порядок, какой можно было встретить только в старинных монастырях.
Проходившая общие послушания рясофорная послушница Елена вскоре была назначена игуменией Варварой уставщицей, как хорошо знавшая богослужебный устав. При второй пюхтицкой настоятельнице игумении Алексии (Пляшкевич), управлявшей монастырем с 1897 по 1921 год, она несла послушание на монастырском Ревельском подворье.
С тех давних времен сохранилось предание. Как-то мать Елена возвращалась с подворья в Таллинне. За ней была послана из монастыря лошадь на станцию Йыхви (тогда Йевве), где тоже было небольшое монастырское подворье для приезжающих в Пюхтицы по железной дороге. Однако мать Елена, тогда уже в возрасте 50-ти лет, не пожелала ехать, а возвратилась в монастырь пешком, пройдя 25 километров от станции. Случай тот запомнился. Видно, с тех пор она и стала привлекать внимание своим странным поведением.
Последовали тяжелые годы войн и разрухи.
Сразу по возвращении в монастырь из Таллинна мать Елена была послана на послушание в Гефсиманию — так назывался монастырский скит в 25-ти верстах от обители и в 2-х верстах от села Яамы, где в бывшей Вихтизбийской лесной даче была устроена монастырская богадельня и уединенно жили 10–15 насельниц (преимущественно престарелые монахини и две слепые, с детства принятые в монастырь), имевших для своего пропитания небольшое хозяйство, в основном огороды и 5–6 коров.
Помимо трудов насельницы скита ежедневно исполняли молитвенное правило преподобного Пахомия Великого, введенное при первой настоятельнице игумении Варваре в 1896 году. В него входит 12 псалмов днем и 12 псалмов ночью с умилительными тропарями и многочисленными поклонами. В скитскую домовую церковь в честь Успения Божией Матери ежемесячно приезжал священник совершать Божественную Литургию и причащать больных стариц. По праздникам все вместе ездили в церковь в Яамы.
Незадолго перед второй мировой войной, в 1938 году, мать Елена, почитавшаяся тогда уже блаженной, возвратилась в обитель из Гефсиманского скита. По рассказам сестер, она пришла в монастырь в тот год на праздник Троицы вместе с матерью Алексией, которая несла в Гефсиманском скиту послушание келарши. В скит блаженная старица больше уже не возвратилась. Она поселилась в домике у калитки при святых вратах, в крайней угловой келлии. Там жила тогда монахиня Асенефа (Екимова), у которой в начале апреля умерла келейница монахиня Арсения (Репина), бывшая привратницей у монастырских врат.
Многое, по сохранившимся в обители преданиям, ясно свидетельствует о богоугодной жизни матери Елены. И поныне среди пюхтицких сестер с благоговением сохраняется память о блаженной старице, под видом юродства скрывавшей свои подвиги. Вся жизнь матери Елены была сокровенна в Боге, и лишь из кратких сведений, имеющихся о ней, как из драгоценных крупиц, можно составить образ благодатной старицы.
Схимонахиня Варсонофия, поступившая в обитель в 1934 году, рассказывала: «В то время уже 68-летняя мать Елена была выше среднего роста, видная, крепкого телосложения, и все поступки ее были, как блаженной.
Как-то раз пришла она на кухню, где я, тогда еще молодая послушница Анна, несла послушание, села на большую скамейку и пропела церковный хвалебный гимн «Тебе Бога хвалим» — от начала до конца. В другой раз в соборе поднялась на клирос, посидела с певчими, потом спустилась и ушла (сама она на клиросе не пела, но была хорошей уставщицей и много стихир и тропарей знала наизусть).
Бывало, встретишь ее и скажешь: «Мать Елена, благословите!» Она скажет: «Бог благословит!» А то ответит: «Не моя неделя». Или и вовсе молча пройдет. Ночью ее часто можно было видеть с кухни. Около 3-х часов ночи выходит и начинает вокруг собора ходить: то камешки собирает, потом их переносит, то опять на место кладет. И все это имело особенное значение. В обители издавна существует предание о том, что в 3 часа ночи здесь Матерь Божия является. Валаамский старец иеромонах Памва, по сохранившимся рассказам, неоднократно пюхтицким сестрам о том же говорил: «В 3 часа ночи у вас в обители Матерь Божия всегда ходит».