Когда началась реализация плана СЁ-1, большинство кораблей японского флота находилось или в Лингга-Роудз в Сингапуре, или в японских водах. Они были разделены на 5 отдельных соединений, а главнокомандующий, адмирал Соэму Тоёда, остался в штабе флота в Японии.
Японским планом предполагалось отдать на заклание Оперативному Соединению 38 Мобильное Соединение адмирала Одзавы, на авианосцах которого почти не осталось самолетов. Японская разведка предположила, что адмирал "Бык" Хэлси погонится на авианосным соединением, и это отвлечет его самолеты от линкоров адмирала Куриты. После этого Первое Ударное Соединение Куриты (Соединения А и В) пройдет через пролив Сан-Бернардино и образует северную половину клещей, в которые предполагалось захватить, американские транспорты. Соединение С адмирала Нисимурывместе со Вторым Ударным Соединением адмирала Симы пройдет через пролив Суригао и атакует американцев с юга. Транспортное Соединение высадит немного войск на западном побережье острова. Бой был намечен на 25 октября. Все зависело от того, сумеет ли Фукудомэ обеспечить прикрытие кораблям с воздуха, и удастся ли отвлечь Оперативное Соединение 38. Ставилась цель — атаковать и уничтожить транспорты и сорвать высадку.
Первое Ударное Соединение Куриты вышло из бухты Бруней, Борнео, 22 октября в 7.00. На самом деле контратака началась слишком поздно, и силы японцев были так разбросаны, ЧТО даже если бы они прибыли к цели, как намечалось, большая часть транспортов уже успела бы уйти. Но Курита просто не мог собрать и подготовить свой флот раньше. Он выбрал юго-восточный маршрут через пролив Палаван, опасный район, изобилующий мелями, в котором, вдобавок, могли оказаться американские подводные лодки. И действительно, он натолкнулся на 2 из них. Ночью 23 октября "Дэйс" и "Дартер" обнаружили Куриту, сообщили о нем своему командованию и попытались атаковать. В 5.24 первой в атаку вышла "Дартер". В это время соединение Куриты шло в сомкнутом строю, прикрытое по бокам эсминцами, но не имея прикрытия спереди. Второе соединение шло в похожем строю в 6500 ярдах сзади.
"Дартер" выпустила 6 торпед с дистанции 1000 ярдов в тяжелый крейсер "Атаго" и добилась 2 попаданий. "Атаго" был охвачен пламенем и начала садиться носом. Эсминцы "Асасимо" и "Кисинами" подошли к крейсеру. Команда покинула корабль, адмирала Куриту выудил из воды "Кисинами", вместе с 529 остальными моряками. Курита только что выздоровел от лихорадки денге, и это купание не улучшило его физического состояния. В 5.53 "Атаго" затонул, унеся с собой 360 человек.
Одновременно "Дартер" выпустила 4 торпеды из кормовых аппаратов в тяжелый крейсер "Такао". Одна попала в правый борт под мостиком, вторая — в корму. "Такао" начал крениться, па нем вспыхнули пожары, вода залила котельное отделение. Крейсер отправили назад в Бруней под эскортом эсминца "Наганами". Теперь наступила очередь "Дейса". Она выпустила 4 торпеды, разнеся на куски тяжелый крейсер "Майя", который затонул в 6.05 вместе с 336 членами экипажа. Эсминец "Акисимо" успел спасти 769 человек.
Адмирал Курита, перейдя на борт "Ямато", приказал снова лечь на курс и в 6.30 вошел в море Сибуян. Но теперь американцы знали, что неприятель подходит. Были обнаружены соединения Нисимуры и Симы. Следующая фаза битвы должна была разыграться с море Сибуян, но Курита надеялся, что летчики Фукудомэ очистят небо над его головой. Курита даже катапультировал свои корабельные самолеты на помощь Фукудомэ. Но это была несбыточная мечта, так как Фукудомэ потерял не меньше 200 самолетов на Филиппинах. Он решил, что сможет лучше помочь Курите, если атакует американский флот вместо патрулирования над собственными линкорами. Утром 24 октября японцы обрушили 3 яростные атаки на Оперативную Группу 38.3. ОГ 38.2 была ближе к соединению Куриты, но ее не заметили. Хотя был потоплен легкий авианосец "Принстон", большая часть японских самолетов была уничтожена, и прикрывать корабли Куриты Сказалось просто нечем. Поэтому, когда Курита повернул на запад, он попал под 5 атак самолетов Оперативного Соединения 38 при полном отсутствии воздушного прикрытия.
Атаки начались поздним утром и длились почти до вечера. В них участвовали 259 самолетов. Удары были сосредоточены на "Мусаси", который получил 13 торпед в левый борт и 7 в правый, 10 бомб в правый борт и 7 в левый, не считая 18 близких разрывов. Когда смертельно раненый "Мусаси" отстал, с ним остался тяжелый крейсер "Тонэ", который сменили эсминцы "Киёсимо" и "Хамакадзэ". Ни один корабль не мог противостоять такому удару, и в 18.35 "Мусаси" затонул. Из 2279 человек экипажа погиб 991.