Японские потери на море во время Малайской кампании были минимальными. Австралийский бомбардировщик потопил транспорт в Сиамском заливе. Голландская подводная лодка О-XVI атаковала 11 декабря 4 груженых транспорта в Патани, но не сумела потопить ни одного. Зато сама лодка подорвалась на британской мине. Еще одна голландская подводная лодка потопила груженый транспорт, а американская подводная лодка “Суордфиш” 16 декабря возле Хайнаня отправила на дно японское торговое судно.
Японское наступление в Малайе и уничтожение там британских сил имели целью обеспечение правого фланга главного удара в направлении Южных Морей. К востоку от Малайи лежали Борнео, Целебес и остальная Голландская Ост-Индия. Военные силы, которые Могли защитить британские или голландские владения были просто крошечными по сравнению с тем, что японцы бросили в новое наступление. А размеры района боев только усугубляли это неравенство.
Борнео, третий по величине остров мира, имел площадь около 260000 квадратных миль, но население — всего лишь 3 миллиона. На острове имелись примерно десяток мелких городишек и очень большие запасы нефти и другого сырья. По своему расположению Борнео мог угрожать морским путям, ведущим в захваченную японцами Малайю и лежал барьером на пути японского наступления. В это время островом владела Голландия, исключая небольшой участок на севере, принадлежавший Британии.
Так как с самого начала войны Малайя попала под сильнейшее давление, британское командование ничего не смогло выделить для защиты Британского Борнео. Японцы не стали тратить время и сразу использовали эту слабость, сделав оккупацию Борнео составной частью Малайкой кампанией. Главной целью японцев были нефтяные поля Мири в северном Сараваке и Серии в Брунее. 13 декабря в 5.30 конвой с войсками для захвата Мири и Серии вышел из бухты Камран. Он состоял из эсминцев “Синономэ”, “Сиракумо”, “Муракумо”, 1 маленького охотника за подводными лодками и 10 транспортов. Потом к ним присоединились легкий крейсер “Юра”, гидроавианосец “Камикава Мару”, а в 9.00 подошли тяжелые крейсера “Кумано” и “Судзуя” вместе с эсминцами “Фубуки” и “Сагири”. Высадки были проведены 16 декабря при минимальном сопротивлении. Но главный приз был уничтожен отступавшими англичанами. 8 декабря они взорвали нефтеперегонный завод в Лутонге и уничтожили, оборудование промыслов в Мири и Серии.
Конвой стоял в Мири до 22 декабря и подвергался случайным атакам голландских и британских самолетов с аэродромов Сингкаван II на границе Саравака и из Сингапура, Транспорты не пострадали, но 17 декабря в 6.50 эсминец “Синономэ”, патрулируя возле Лутонга примерно в 9 милях к северу от Мири, был уничтожен таинственным взрывом. Погиб весь экипаж из 228 человек. На эту победу претендует голландская авиация. Захват Британского Борнео не встретил на суше почти никакого сопротивления. Аэродром, который англичане спешно соорудили в Кучинге, Саравак, был захвачен 24 декабря, Британские войска отступили на территорию Голландского Борнео в день Рождества.
С 15 декабря японские силы подвергались спорадическим атакам самолетов и подводных лодок. При этом был потоплен эсминец “Сагири”, который 24 декабря получил 2 торпеды с голландской подводной лодки К-XVI. Погиб 121 человек. В Кучинге 1 транспорт был потоплен самолетами, еще 1 — той же K-XVI. Еще 3 транспорта были повреждены K-XIV.
Капитуляция Британского Борнео была формально подписана 19 января в Сандакане. Следующими в списке числились богатые острова Голландской Ост-Индии. Правительство Голландии, начиная с 1940 года вело предварительные переговоры с Великобританией и Соединенными Штатами о защите Юго-Восточной Азии на случай, если Япония начнет войну. Поэтому Голландия объявила войну Японии в тот же день, когда это сделали Великобритания и США. (Япония объявила войну Нидерландам только 11 января 1942 года.) 10 декабря в Батавию (ныне Джакарта) прибыл генерал сэр Арчибальд Уэйвелл, назначенный главнокомандующим силами АБДА.
Командование АБДА начало действовать слишком поздно. Оно имело мало войск, кораблей и самолетов, зато отличалось скверной организацией. Уэйвелл скоро обнаружил, что у него слишком много хлопот с Малайей и передал руководство АБДА голландскому адмиралу Конраду Хелфричу. Однако он оставил оперативное командование морскими, сухопутными и воздушными силами офицерам всех стран, введенным в состав командования АБДА. Так как Хелфрич был также главнокомандующим Королевским Голландским Флотом, его штаб находился в Батавии, тогда как штабы армии, авиации и флота АБДА сначала находились в Лембанге, а потом в Бандунге. Эти 3 организации не могли сотрудничать друг с другом и адмиралом Хелфричем. Вообще, номинальный командующий Хелфрич узнавал оперативные планы АБДА только через голландского офицера в штабе ВВС АБДА. Беспорядок усилился, когда командование голландской сухопутной авиацией было передано КВВС, тогда как морская авиация осталась в распоряжении штаба флота АБДА. Это означало, что в морских боях корабли союзников не могут непосредственно руководить воздушным прикрытием. Кроме того они лишались возможности вести авиаразведку.