По указанию командующего подводными силами Азиатского флота «Сарго» была отозвана и вместо нее к месту аварии направлен патрульный самолет. Ко времени прибытия самолета командир «S-36» еще был уверен, что с помощью спасательного корабля можно выручить подводную лодку. Самолет полетел в Макассар, чтобы попросить помощи у голландских властей. На следующее утро был послан катер. Катер взял на борт только двух офицеров и 28 матросов; остальная часть команды осталась на борту в надежде, что лодку удастся спасти. Но положение ухудшилось. Когда на место аварии прибыл голландский корабль «Сиберот», командир подводной лодки уже решил отказаться от дальнейших попыток спасать корабль. Команда была взята на борт «Сиберота» и доставлена в Макассар.
25 февраля команда лодки прибыла в Сурабаю.
В ночь на 22 февраля подводной лодке «Тарпон» было приказано направиться в район к северу от Малайского барьера. В это время лодка находилась южнее Малайского барьера, и командир принял решение пройти через пролив Боленг. Подходы к проливу там широкие и достаточно глубокие, но в северной части пролив сужается до одной мили. Лодка шла на север по направлению к узкости курсом 35°. Командир считал, что курс лодки является продолжением оси канала.
Лодка должна была изменить курс, когда на траверзе появится узкая полоска земли «Пойнт Таек». Но подводники ошиблись и приняли за нее другой выступ, повернули не там, в результате чего лодка схода села на мель.
Попытка сняться с мели ни к чему не привела. Тогда для облегчения лодки решено было продуть цистерны (топливную и пресной воды), отдать два якоря и выгрузить три торпеды, у которых предварительно вынули взрыватели. Но лодка не двигалась с места. Наступал день. В любой момент мог появиться противник. Тогда за борт выгрузили остальные торпеды и двести трехдюймовых снарядов, продули масляную цистерну, освободились от якорной цепи. Но все эти меры не дали положительных результатов. Как ни старалась команда, лодка не двигалась с места. В конце концов, чтобы противник не захватил лодку, было уже решено подорвать ее. ~
Между тем с берега подошла шлюпка с миссионером, который рассказал подводникам, что в течение последних четырех дней над проливом летает японская авиация и что японские корабли находятся к востоку от пролива. Миссионером было также сообщено, что от 16 час. 00 мин. до 18 час. 00 мин. бывают высокие приливы.
Эти новости заставили команду действовать энергичнее. Когда начался прилив, был дан задний ход. Одновременно брашпилем выбиралась якорная цепь. Через несколько минут подводная лодка «Тарпон» снялась с мели. Этот случай показывает выдержку и упорство моряков, способных преодолевать трудности.
К середине февраля 1942 года японцы высадились на Борнео, Целебесе и Молуккских островах; создалась угроза их вторжения на остров Ява.
Защита Голландской Ост-Индии при наличии неукомплектованных частей была безнадежным делом. 2 февраля японцы нанесли тяжелый удар флоту АВДА. Днем раньше началась бомбардировка Сурабаи; авиация противника бомбила остров Тимор, в случае захвата которого японцы получили бы базу, откуда они могли совершать налеты на Австралию. Очевидно, японцы готовились к вторжению на Яву и Тимор, возможно одновременно.
Чтобы помешать продвижению японцев к Яве, адмирал Харт собрал все наличные подводные силы и под командованием голландского контр-адмирала Карела Дурмана направил их против сил вторжения противника, которые сосредоточивались в районе Баликпапана (остров Борнео).
В эскадру АВДА входили голландские крейсера «Де-Руйтер» (флагманский корабль) и «Тромп», американские крейсера «Хаустон» и «Марблхэд» и несколько эскадренных миноносцев.
Под прикрытием авиации эта эскадра могла бы успешно действовать против японцев. Но воздушную поддержу невозможно было получить. При очередном налете японской авиации на район Сурабаи японские летчики обнаружили эскадру АВДА в проливе Мадура.
Голландский адмирал понял, что корабли эскадры обнаружены, и ночью перевел их в Макассарский пролив. На следующее утро эскадра была вновь обнаружена в районе Кангеан, севернее острова Бали. Японские бомбардировщики совершили налет на эскадру. Больше двух часов корабли отгоняли авиацию. Несколько самолетов было сбито.
Бомбардировщики сконцентрировали свои удары по крейсерам, которые двигались зигзагом. Одна из бомб попала в грот-мачту крейсера «Хаустон», а затем рикошетом ударила в носовую орудийную башню; произошел взрыв, в результате которого было убито 48 человек.