Подводная лодка «Пермит» также получила задание идти на остров Коррехидор. Командир лодки был очень искусным подводником. И, хотя японцы усиливали противолодочные действия с целью не пропускать лодки к Коррехидору, подводной лодке «Пермит» все же удалось прорваться, и 28 февраля защитникам острова были доставлены необходимые боеприпасы. С Коррехидора подводная лодка сняла 10 морских офицеров и 21 солдата.
Из Коррехидора лодка направилась в Фримантл и прибыла туда 7 апреля.
Подводная лодка «S-38» получила задание идти к Яве и принять участие в боях за Малайский барьер.
Японское продвижение на юг по Макассарскому проливу было частью наступления на Голландскую Ост-Индию. 18 февраля подводные лодки патрулировали в проливе Ламбок с целью предотвратить вторжение противника на остров Бали. В конце февраля командующий подводными силами Азиатского флота приказал пяти подводным лодкам занять позицию в Яванском море, чтобы закрыть подходы к Сурабае. Среди них была подводная лодка «S-38». 26 февраля эта лодка получила специальное задание обстрелять радиостанцию на острове, действуя на линии от острова Бавеан до Сурабаи.
Впервые подводная лодка выполняла такое задание. В момент получения этого приказа она находилась недалеко от острова Бавеан и через четыре часа приблизилась к нему. На лодке заметили, что с острова передают какие-то световые сигналы. Чтобы избежать опасности, лодка погрузилась и некоторое время шла недалеко от берега, ожидая, когда положение станет более ясным. В 06 час. 00 мин. в перископ были обнаружены стоящие в гавани две шхуны и несколько небольших судов.
Командир лодки отдал приказ приготовиться к бою. Лодка всплыла и открыла огонь с дистанции около 4650 м. Радиостанцию различить было невозможно, поэтому артиллеристы вели огонь по береговой линии, ориентируясь на белый дом, который стоял на пирсе.
С берега ответила мелкокалиберная пушка. Но после двух выстрелов она оказалась выведенной из строя огнем подводной лодки. К этому времени дистанция стрельбы сократилась до 3900 м. Артиллерийский огонь продолжался: было выпущено 30 снарядов по зданию радиостанции и десять — по постройкам, где, возможно, находились войска. Возникло несколько пожаров, вероятно, один снаряд попал в склад с боеприпасами.
Обстрел прекратился по израсходовании снарядов. По всей вероятности, противнику были нанесены незначительные потери. Но подводная лодка продемонстрировала способность осуществлять обстрел береговых объектов на глазах у противника.
Итак, подводные лодки прорывали блокаду, эвакуировали личный состав, подвозили продовольствие и боеприпасы, спасали беженцев, обстреливали береговые укрепления противника.
Всего за вторую мировую войну американские подводные лодки выполнили 289 специальных заданий.
Участвуя в бою в Яванском море, подводная лодка «S-38», кроме того, выполняла еще одно задание — спасение людей.
В ночь на 28 февраля 1942 года при следовании подводной лодки «S-38» в свою базу на воде были замечены какие-то плавающие темные предметы. Когда лодка подошла ближе, то послышались голоса людей. Это были моряки с английского миноносца «Электра», потопленного японскими эскадренными миноносцами в бою в Яванском море 27–28 февраля.
Тогда же подводная лодка «S-37» подобрала в этом месте двух американских моряков, а часть команды с голландского крейсера «Де Руйтера», которая спаслась на шлюпке, снабдила пятидневным запасом питьевой воды и продовольствием.
Падение Сингапура предопределило потерю островов Явы и Суматры и оккупацию японцами (18 февраля) острова Бали. Американские подводные лодки в проливе Ломбок не могли предотвратить высадку противника на остров Бали. Когда подводные лодки «Сиил», «Сивулф» и «Сейлфиш» подошли к острову Бали, японцы уже захватили плацдарм.
Пять американских подводных лодок, находившихся в Яванском море, не могли даже замедлить продвижение японцев. Британские и голландские лодки, сосредоточенные в Яванском море, тоже действовали весьма неэффективно. К тому же небольшая глубина в этом районе также стесняла действие лодок. Японцы использовали это, и их конвои двигались вблизи берега.
25 февраля японцы в районе острова Бали получили подкрепление и готовились к заключительному бою в этом районе — захвату в клещи Явы. Для отражения этого штурма союзники имели весьма слабо подготовленные силы. Флот АВДА 27 февраля отошел к Сурабае для пополнения запасов горючего. К этому времени было известно, что японское ударное соединение флота находится в районе Бавеана. Кораблям флота АВДА был отдан приказ выйти в море.