Японский минный заградитель «Хацутака» доносил о том, что им атакована подводная лодка у берегов Малайи, у входа в Сиамский залив, именно вто время, когда поблизости находилась «Лагарто». Очевидно, «Хацутака» был одним из кораблей, сопровождавших конвой, которые безуспешно пытались атаковать подводные лодки. Как указывал командир японского минного заградителя, взрыв произошел на глубине 54 м, и лодка, следовательно, имела мало шансов спастись. Американскому штабу оставалось только предполагать, что «Лагарто» потоплена минным заградителем.
Минный заградитель «Хацутака» был потоплен 16 мая американской подводной лодкой «Хокбил» у побережья Малайи.
В то время как бомбардировщики В-29 наносили удары по Токио, а американские войска вторжения прокладывали себе путь через остров Окинава, подводные силы осуществляли блокаду тихоокеанских портов Японии и активно действовали на японских морских путях, ведущих в Китай и Маньчжурию. Действуя в мае в Желтом море, подводная лодка «Рейтоп» потопила у Шандуньского полуострова три небольших грузовых судна; «Спрингер» потопила два фрегата, а «Шэд» торпедировала у берегов Кореи большое торговое судно. Направляясь в конце мая в Желтое море, подводная лодка «Билфиш» потопила у берегов Кюсю небольшое грузовое судно, а затем 4 июня южнее Дайрена потопила транспорт (2200 т). 1 июня у берегов Кореи «Шэд» пустила ко дну еще одно судно. 9 июня юго-западнее Кореи подводная лодка «Сиоул» уничтожила фрегат. 11 июня у Шандуньского полуострова подводная лодка «Сегундо» потопила небольшое грузовое судно, а 14 июня в этом же районе «Сидевил» потопила еще одно судно. В течение мая — июня жертвами подводных лодок оказались лишь фрегат и небольшие грузовые суда. Очевидно, для этого района крупные транспорты являлись такой же редкостью, какой они были в районе патрулирования подводных сил, базировавшихся в Австралии.
В начале мая северо-восточнее Хонсю подводная лодка «Боуфин» потопила фрегат и небольшой транспорт, а в прилегающем районе «Серо» потопила два небольших грузовых судна. После этого до начала июня блокирующие подводные лодки не имели соприкосновений с противником, и только в первой половине июня подводная лодка «Тэнг» потопила близ Хакодатэ два небольших и одно среднее грузовое судно и один малый танкер. Позднее в течение этого же месяца подводная лодка «Перч» на южных подступах к Оми-нато потопила грузовое судно и переделанную канонерскую лодку.
В «Полярном секторе», который включал Курильские острова, подводные лодки Тихоокеанского флота действовали против остатков японского рыболовного флота, лишая страну продовольствия, которое для нее было так же важно, как и нефть. В этом районе никогда не было большого движения грузовых судов. Однако 29 мая восточнее Итурупа подводная лодка «Стерлит» потопила два небольших грузовых судна. 18 июня подводная лодка «Апогон» потопила транспорт (2614 те) и в этом же районе 19 июня подводная лодка «Кэйбезон» потопила среднее грузовое судно.
Для японского торгового флота, парализованного из-за недостатка горючего, подвергающегося непрерывным атакам с воздуха, неспособного собрать нужное количество эскортных кораблей — и произвести необходимые ремонт и замену, потери, наносимые американскими подводными лодками в водах империи, приближали катастрофу. Сокращение судоходства в Желтом море и непрекращающаяся блокада тихоокеанских портов означали для Японии ухудшение снабжения продовольствием. Даже при очень ограниченном рационе Япония была вынуждена ввозить большое количество зерна. В апреле 1945 года положение в стране стало настолько критическим, что почти весь наличный торговый флот был брошен на перевозку продовольствия и соли. Теперь в результате потопления торговых судов в Желтом море, в районе Курильских островов и северо-восточнее Хонсю продовольственный кризис дошел до высшей точки. В июне 1945 года американские подводные лодки совместно с бомбардировщиками В-29 блокировали пролив Симоносэки, в результате чего Япония потеряла последнюю надежду импортировать из Кореи и Маньчжурии товары, необходимые для снабжения населения.
В то время как проходили эти решающие операции, штаб подводных сил Тихоокеанского флота передал сообщение об эпизоде, по которому можно судить о характере боевых действий того периода.
Когда американские подводные лодки патрулировали в каком-либо районе, выполняя задачу по спасению пострадавших летчиков, часто они бывали непосредственными свидетелями воздушных боев. Однако немногим удавалось наводить американские самолеты на цель. Одной из немногих была американская подводная лодка «Атьюл».