17 апреля подводная лодка «Спиэрфиш» сообщила о потоплении «неизвестного» японского суда в Филиппинских водах. Через восемь дней эта же лодка во время другой дневной подводной атаки выпустила торпеду по торговому судну «Тоба Мару» (6995 т), по всей вероятности, судно затонуло.
В то время подводные лодки в Тихом океане не могли концентрировать все свое внимание только на борьбе с торговым судоходством противника; многие были заняты выполнением других заданий. В середине марта военно-морской флот осуществил несколько ударов по японским кораблям у северного побережья Новой Гвинеи. Подводные лодки при этом вели предварительно разведку, обеспечивая путь для надводных кораблей. Они осуществляли разведку также в районе Рабаула. Но удар по Рабаулу сорвался, так как американские корабли были замечены японскими самолетами, не давшими им возможности дойти до цели. Подводные лодки, однако, продолжали нести разведывательную службу в этом районе и сообщали данные, которые нельзя было добыть при помощи разведывательной авиации и надводных кораблей.
Лодки, действующие вблизи японских островов, добыли достаточно данных, чтобы осуществить успешный налет авиации на территорию собственно Японии. Еще 25 января подводным лодкам было приказано начать подготовку к ответному удару но противнику. Нужно было изучить погоду в этом районе, что имело немаловажное значение.
В японских водах действовала подводная лодка «Трешер», выполняя роль аэрографа и наблюдателя погоды. 10 апреля лодка потопила японское торговое судно «Садо Мару» (3000 т). Подводная лодка «Трешер» доставила затем данные наблюдений за погодой, которые очень интересовали моряков на авианосце «Хорнет».
Сводка погоды предсказывала шторм над Токио в апреле. 18 апреля «Хорнет» находился в 700 милях от Японии. 16 армейских бомбардировщиков типа В-25 взлетели с палубы авианосца и совершили налет на Токио.
Японские подводные лодки действовали в водах Гаваев и вели разведку перед налетом японской авиации на Пирл-Харбор. Аналогичную задачу выполняли теперь американские подводные лодки, разведка которых в Токийском заливе предшествовала и способствовала налету американской авиации, нанесшей удар в самое сердце Японии.
Подводная лодка «Тотог» вернулась в Пирл-Харбор, чтобы закончить ремонт, прерванный нападением японцев, и получила приказ идти в юго-западную часть Тихого океана.
Ведя разведку в районе Маршалловых островов, подводная лодка «Тотог» обнаружила две японские лодки в надводном положении. Командир американской лодки решил их атаковать; однако японцы заметили противника и ушли под воду.
26 апреля «Тотог» находилась в надводном положении в районе 18°11′ северной широты и 166°54′ западной долготы. Неожиданно был услышан всплеск воды, а затем показался перископ японской подводной лодки.
Командир «Тотог» приказал немедленно погрузиться и приготовить торпедные аппараты. Лодка развернулась и выпустила торпеду. Послышался взрыв. Перископ японской лодки исчез.
Опасаясь, что поблизости находятся еще подводные лодки противника, «Тотог» отошла на значительное расстояние от места взрыва. Когда же стало очевидным, что противника вблизи нет, лодка всплыла на поверхность.
Через несколько минут показался американский самолет.
С лодки дали сигнал, чтобы самолет осмотрел район, где раньше находилась японская лодка. На этом месте плавали обломки и видны были масляные пятна. Официальные данные подтвердили потопление японской подводной лодки «РО-30» водоизмещением 965 т.
Последующие 20 дней боевых действий проходили довольно спокойно. 16 мая около одного небольшого кораллового острова лодка заметила большое грузовое судно противника и выпустила по нему две торпеды. Одна торпеда попала в цель; на судне возник пожар, однако оно осталось на плаву, а затем выбросилось на отмель кораллового острова.
Подводная лодка «Тотог» продолжала поиск противника. Неожиданно она попала в тропический шквал. Спустя некоторое время после того, как шквал стих, впереди был замечен силуэт японской подводной лодки. Сближение с ней длилось два часа. Затем «Тотог» пошла в атаку и выпустила две торпеды. Одна из торпед как будто попала в цель, однако потопление японской лодки в этом районе не подтвердилось.
Два часа спустя была замечена другая подводная лодка. По ней выпустили три торпеды. В воде раздалось два взрыва. На этот раз потопление было совершенно явное. Японский флот потерял еще одну подводную лодку «И-28». водоизмещением 2212 т.