В связи с этим 4 команды, находившиеся на пути к острову Яп, получили приказание изменить маршрут и направиться на острова Адмиралтейства. Шла подготовка к операции по овладению Филиппинами. Маршрут 6-й и 7-й команд и команды «Эйбл», следовавших к острову Пелелиу, а также 8-й и 10-й команд, направлявшихся к соседнему острову Ангаур, остался без изменений. Однако одна из этих команд выбыла из строя еще до начала действий. 12 сентября перед рассветом недалеко от Пелелиу эскадренный миноносец «Фуллэм» врезался носом в корму транспорта «Ноа», на котором находилась команда «Эйбл». «Ноа» получил большие пробоины и стал тонуть. Экипаж и боевые пловцы команды «Эйбл» были вынуждены оставить корабль. Дело обошлось без потерь личного состава. Были даже спасены 3 резиновые лодки, но транспорт затонул, унеся с собой все снаряжение и тонны взрывчатки команды «Эйбл». После этого подрывников направили обратно в Мауи и распределили между другими командами. А та часть района высадки десантов, на которой предстояло действовать команде «Эйбл», стала предметом забот 6-й команды. Теперь ей предстояло выполнить работу двух команд.
Начальник 6-й команды старший лейтенант Логодон принимал некоторое участие в планировании операции на острове Пелелиу. На штабном совещании, где присутствовали генерал-майор Рупертэс, командир 1-й дивизии морской пехоты, и контр-адмирал Джордж X. Форт, командующий оперативной группой кораблей, обсуждался план высадки десантных войск и артиллерии. Адмирал Форт предложил Логсдону высказать свои соображения в связи с обсуждаемым планом.
Преодолевая робость, естественную на таком совещании для младшего офицера, прослужившего немногим более года в военно-морском флоте, Логсдон все же заметил, что, судя по аэрофотоснимкам, бухточка, предназначенная для высадки на берег артиллерии, отгорожена с внешней стороны рифом, усеянным острыми выступами, едва покрытыми водой. Боевые пловцы, продолжал он, могли бы уничтожить этот риф, но бухточка окружена тремя линиями дотов, которые могут воспрепятствовать и работам по уничтожению рифа, и выгрузке артиллерии. Затем он предложил выгрузить артиллерию на берег немного южнее основных пунктов высадки, так как через тянущийся там надводный риф боевым пловцам было легко проложить путь для артиллерии. После обмена мнениями этот последний вариант и был принят. Логсдону предстояло доказать на деле преимущества своего предложения.
Вскоре эскадренные миноносцы, выделенные для огневой поддержки, усиленно обстреливали из 127-мм и 40-мм орудий западные участки побережья, около которых боевые пловцы 6-й и 7-й команд спускались в море со своих десантных катеров.
Было время отлива, и длинный покатый подводный риф, тянущийся в 90 м от берега, едва прикрывало водой. Японские снайперы, притаившиеся среди кокосовых пальм, начали стрелять по пловцам из винтовок. Их примеру последовали пулеметчики замаскированных дотов.
В ответ заработали тяжелые пулеметы на десантных катерах, в то время как наблюдатели корректировали по радио огонь корабельных орудий. В результате корабельная артиллерия точной стрельбой начала выводить из строя один дот за другим.
В лагуне за рифом было слишком мелко, и бойцы не могли проделать весь путь до берега вплавь. Укрыться в воде можно на глубине не менее 60 см. Японский снайпер, забравшийся на кокосовую пальму, стремился поразить оного пловца, который лежал, распластавшись на мели, не будучи в состоянии ни укрыться под водой, ни быстро передвигаться. Радист с катера сообщил на миноносец координаты этой пальмы и попросил сбить снайпера. Вскоре 40-мм снаряд разорвался над самой верхушкой дерева и снайпер свалился на землю.
На северном участке района высадки боевые пловцы 7-й команды обнаружили и уничтожили линию заграждений из стальных балок. Дальше, примерно в 70 м от уреза воды, тянулись два ряда деревянных столбов. А на песке выше линии максимального прилива находились наполненные породой бревенчатые клети, бетонные кубы, окоп для стрелков и глубокий противотанковый ров. Уничтожать эти объекты могли только подрывные команды морской пехоты, прикрываемые танками, а не обнаженные пловцы, которые на берегу под огнем снайперов были беспомощны, как рыба, вытащенная из воды.
На основании ранее полученных стереоскопических аэрофотоснимков можно было сделать предположение, что риф усеян весьма опасными для транспортеров ямами глубиной до 15 м. Однако такая глубина ям вызывала сомнение и требовала уточнений. Отправившиеся в разведку боевые пловцы вместо «ям» обнаружили на рифе мох и морские водоросли. В целом же риф был плоским и гладким и имел удобные подступы. Возвратившись из разведки, Бэрк доложил, что его людям потребуется лишь один день, чтобы подорвать деревянные столбы и этим открыть путь на северный участок. После того как эта работа была выполнена, транспорту 7-й команды было приказано отбуксировать катера с затонувшего транспорта «Ноа» на очищенную от мин якорную стоянку флота северо-западнее прохода Коссол.