Опасаясь, что после взрывов, произведенных в предыдущую ночь, японцы будут настороже и попытаются отрезать пловцов, последние установили опознавательный сигнал — помахивание куском детонирующего шнура. Тем не менее один очевидец заметил: «Просто удивительно, сколько плавающих бревен получило в ту ночь удары ножом» (когда пловцы принимали их за подкрадывающихся японцев).
В результате ночных действий пловцов предназначенный для высадки десантов район был хорошо подготовлен.
В день высадки, 15 сентября 1944 года, пловцы сопровождали и направляли эшелоны десантных войск, а также устанавливали на подходах к рифу буи, указывающие пути следования.
Дальше предстояло действовать морской пехоте. Ее задача была значительно сложнее. Гарнизон на острове Пелелиу, вопреки данным разведывательной службы, оказался более многочисленным, все горы острова были покрыты густой сетью траншей и артиллерийских позиций. Об операции на этом острове мало сообщалось в печати. В ней одна только 1-я дивизия морской пехоты потеряла свыше 5000 человек, то есть больше, чем в кровопролитных боях за остров Тараву. На северном участке в ожесточенных боях принял участие усиленный батальон 321-й пехотной дивизии. Последние отряды японцев были разгромлены в небольшом горном районе острова, к северу от получившего печальную известность кряжа «Кровавый нос», лишь в конце сентября. А в районе самого «Кровавого носа» японцы продержались еще два месяца, и, прежде чем американские войска овладели им, они потеряли еще 2000 человек.
Артиллеристы морской пехоты успешно высадились на берег через южный надводный риф и громили японцев в юго-западной бухте. Там японцы все еще укрывались в дотах и наносили значительные потери частям, наступавшим с суши. Логсдон оказался прав в своем предостережении: если бы наступление велось с моря, то японцы могли бы поставить как пловцов, так и артиллерию в весьма затруднительное положение.
Боевые пловцы не оставались без дела и во время борьбы за овладение островом. Через три дня после начала десантной операции лейтенант Ондердонк и утренний патруль 7-й команды обнаружили на южной отмели недавно поставленное минное заграждение. Японцы пробрались ночью через позиции морской пехоты и установили на отмели пятидесятикилограммовые авиабомбы, протянув от них электропровода на берег. Боевые пловцы отсоединили провода, перенесли бомбы в безопасное место и взорвали их там.
В тот же день старший лейтенант Бэрк с двумя взводами пловцов, соблюдая все меры предосторожности, очистил юго-западную бухту, где, помимо надолб в виде бетонных кубов и железнодорожных рельсов, глубоко заделанных в грунт, имелась еще подводная полоса заграждений из 39 гальваноударных мин. Обезвреживание и удаление этих мин было опасным делом, хотя, как потом было обнаружено, многие из них оказались не снаряженными взрывчатым веществом.
Рано утром 21 сентября, то есть на шестой день после начала операции, младший лейтенант Р. Фэлпс с группой боевых пловцов из 7-й команды направился в десантном катере к северо-западному участку побережья, где поблизости проходил передний край обороны. Катер шел вдоль низкого восточного берега. Когда он повернул к рифу, чтобы зайти в лагуну, находившиеся на берегу солдаты морской пехоты внезапно укрылись за стволами пальм и навели на катер свои карабины. Боевые пловцы поспешно схватили флаг и начали усиленно им размахивать. К счастью, солдаты морской пехоты очень скоро убедились, что серый десантный катер не являлся одним из тех многочисленных японских судов, которые то и дело пробирались к еще не занятой американцами северной оконечности острова, чтобы подбросить подкрепления осажденному там японскому гарнизону. Боевые пловцы продолжили разведку. Во второй половине того же дня под аккомпанемент ожесточенной стрельбы, звуки которой доносились с севера, пловцы взорвали линию бетонных, деревянных и стальных надолбов протяженностью 275 м. Это была последняя работа, выполненная ими на острове Пелелиу.
Тем временем 2 другие команды проложили путь для десантов на остров Ангаур, расположенный в 6 милях к юго-западу.
Остров Ангаур тянется на 3 мили в длину. На нем нет таких обрывистых гор, как на Пелелиу. Он покрыт лишь холмами высотой до 60 м. Гарнизон там был намного слабее, чем на Пелелиу. Контрадмирал Говард Кингмэн начал бомбардировку острова Ангаур с кораблей 12 сентября, одновременно с бомбардировкой острова Пелелиу.
Боевые пловцы приступили к действиям на Ангауре 14 сентября, то есть за один день до начала десантной операции на Пелелиу и за три дня до высадки десантов на самом Ангауре.