На заре христианства, после распятия и →Воскресения Иисуса Христа, усилилась полемика между ранней Церковью, с одной стороны, лидерами иудаизма и экстремистски настроенными иудеями – с другой. В НЗ приведены случаи применения насилия к проповедникам христианства. Содержание этой полемики нашло отражение в новозаветных текстах, редакция которых в целом завершилась примерно к 120. Парадокс заключался в том, что сама Церковь с глубоким уважением относилась к иудейскому Закону – Торе, ревностными хранителями которого выступали иудеи.
Попав под власть Римской империи и широко расселившись по ее территории, евреи не утратили, однако, свойственного им культурного своеобразия, основой которого служила их приверженность ветхозаветному →монотеизму. Это способствовало росту отчуждения между евреями и язычниками, а затем и христианами из язычников. Христиане-евреи, после синода раввинов в Ямнии в 70, постановившего, что христианская →вера несовместима с иудаизмом, быстро ассимилировались в нееврейской среде.
После V в. в Римской империи, где христианство постепенно приобрело статус государственной религии, начались гонения на нехристианские культы. Преследований не избежали и иудеи. Богословскими основаниями преследований стали ошибочные и несправедливые толкования Нового Завета, вменявшие еврейскому народу как таковому вину за убийство Христа. Полностью эти толкования были отвергнуты только →Ватиканским II собором.
В средневековой Европе евреи жили преимущественно замкнутыми общинами – гетто; стремление изолироваться друг от друга было у евреев и основного населения европейских стран обоюдным. Контакты, однако, поддерживались, прежде всего на экономическом уровне. Временами социальное напряжение (особенно в случаях войны, голода, эпидемий) приводило к вспышкам А. Результатом этого становились погромы, а со стороны государства – освобождение тех, кто находился в долговой кабале у евреев-ростовщиков, от выплаты долгов и даже изгнание всех евреев из той или иной страны, никогда, впрочем, не становившееся полным. В большинстве своем евреи находились вне феодальных общественных отношений.
Святой Престол сожалеет об атмосфере религиозной нетерпимости, имевшей место во многих христианских странах вплоть до конца XVIII в., особенно в отношении евреев, рассеянных по Европе. Именно эта нетерпимость породила явление «антииудаизма», строго говоря, не имеющее оснований в христианской вере. Нетерпимость антииудаизма на государственном и бытовом уровне выражалась в массовых изгнаниях и насильственных обращениях евреев. В периоды социальных кризисов евреев, живших обособленно, в согласии с иудейскими правилами религиозной чистоты, рассматривали как виновников всех бед.
Процессы секуляризации XVIII–XIX вв. затронули и еврейские общины. Некоторые их члены покидали гетто и ассимилировались среди нееврейского населения, благодаря своей активности занимая нередко высокое социальное положение. На рубеже XVIII–XIX вв. евреи стали приобретать в некоторых странах равные гражданские права и занимать влиятельное положение. В климате развивающегося национализма XIX в. антиеврейская нетерпимость приобрела оттенок социальной зависти и политической подозрительности.
В XX в. нацизм в Германии использовал расовую теорию как псевдонаучную базу различия нордической арийской расы и низших рас. Несмотря на опасения репрессий, Католическая Церковь в Германии ответила осуждением расизма и антисемитской пропаганды. В 1937 папа Пий XI осудил нацистский расизм в энциклике Mit brennender Sorge.
Нацистский режим истреблял еврейский народ путем последовательного убийства миллионов евреев. Эта трагедия получила название Холокост (англ. Holocaust от греч. Holocauston – всесожжение), или Катастрофа, а также Шоа (евр. shōa – несчастье, бедствие).
Многие христиане в Европе прикладывали усилия для спасения евреев, но в целом сопротивление членов Церкви бесчеловечному режиму могло быть сильнее и бескомпромисснее. Причина состоит в страхе перед нацистским террором и равнодушии одних и легковерии других.
В России до XVIII в. количество евреев было незначительным. Это положение переменилось с присоединением новых западных губерний, где жило много евреев. Была создана так называемая «черта оседлости», за пределами которой евреям запрещалось селиться без особого разрешения (она была отменена в 1905). Социальный кризис начала XX в. вылился, в частности, в погромы и рост антисемитских настроений под лозунгами государственного →православия. Это подтолкнуло часть российского еврейства к участию в революционной деятельности.