9. При выходе эскадры 10.06.1904 г. был упущен благоприятный момент для осуществления прорыва во Владивосток, но выход окончательно убедил контр-адмирала В. К. Витгефта в невозможности прорыва. В то же время появление в составе русской эскадры броненосцев «Цесаревич», «Ретвизан», «Победа» изменило представление вице-адмирала X. Того о соотношении сил, и японская сторона после 10.06.1904 г. пошла на перенесение сроков наступления на Ляоян, отменила снабжение армии через Печилийский и Цзиньчжоуский заливы. Контр-адмирал В. К. Витгефт об этом не знал, и это незнание есть только результат отсутствия разведки и непонимания своего противника.
2.3. Командование 1-й эскадрой флота Тихого океана
Вице-адмирал О. В. Старк, ставший невольным виновником потерь в результате удачного нападения на корабли русской эскадры в ночь на 26.01.-27.01.1904 г., оставил свой пост.
01.02.1904 г. вице-адмирал С. О. Макаров в С-Петербурге получил официальное уведомление Морского министерства о его назначении на должность командующего флотом в Тихом океане.
24.02.1904 г. вице-адмирал С. О. Макаров прибыл в Порт-Артур и вступил в должность, подняв свой флаг на крейсере I ранга «Аскольд». Степан Осипович имел практический опыт командования большими соединениями кораблей. В 1895 г. он был младшим флагманом эскадры Тихого океана в Чифу, где составлял «Общие соображения о враждебных действиях против японцев в 1895 г.» (первым помощником С. О. Макарова в составлении этого документа был капитан I ранга 3. П. Рожественский). В течение всей службы вице-адмирал С. О. Макаров проявлял энергию, предприимчивость, обладал качествами лидера и пользовался большим авторитетом среди офицеров и экипажей кораблей.
26.02.1904 г. вице-адмирал С. О. Макаров поднял флаг на «Петропавловске».
04.03.1904 г. приказом командующего принята «Инструкция для похода и боя». Старший артиллерийский офицер броненосца «Пересвет» лейтенант В. Н. Черкасов писал: «Адмирал Макаров усиленно проявляет свою деятельность и хорошо готовит эскадру к бою. Его приказы прекрасны и хорошо написаны. Они вполне соответствуют данному положению… С каждым его приказом подымается доверие к нему, а вместе с тем подымается и уверенность в своих силах и в победе. Он не делает таких страшных секретов, какие были при Старке, он советуется со всеми, бывает везде и не отдает приказаний, не объяснив их назначения». Например, лейтенант В. Н. Черкасов упоминает такой эпизод: «При холодных котлах «Севастополь» должен разводить пары 12 часов, но может в два часа. Если же поддерживать теплую воду (на что тратится около четырех тонн угля в сутки), то достаточно 40 минут, что и доказал адмирал Макаров».
Гибель вице-адмирала С. О. Макарова 31.03.1904 г. была самой тяжелой потерей флота, такую потерю восполнить оказалось невозможно вплоть до конца войны. Едва налаженная работа штаба вице-адмирала С. О. Макарова оказалась также прервана гибелью начальника штаба контр-адмирала М. П. Моласа и большинства офицеров штаба.
В период 40-дневного командования вице-адмирала С. О. Макарова эскадра выходила в море шесть раз, в последующие восемь месяцев — два раза.
После гибели вице-адмирала С. О. Макарова во временное командование эскадрой вступил Наместник адмирал Е. И. Алексеев. В период его командования не было ни одного собрания флагманов и командиров, выходов в море миноносцев, только броненосец «Севастополь» вел 02.04.1904 г. перекидную стрельбу, при которой сломался контршток компрессора левого 12" орудия носовой башни ГК из-за слишком большого угла возвышения во время стрельбы. В условиях осады такое повреждение исправить было невозможно, и в бою 28.07.1904 г. орудие не стреляло.
22.04.1904 г. в связи с угрозой блокирования Порт-Артура с суши Наместник отбыл в Мукден. На должность командующего флотом был назначен вице-адмирал Н. И. Скрыдлов, а командующим 1-й эскадрой флота Тихого океана был назначен вице-адмирал П. А. Безобразов (оба адмирала прибыли во Владивосток). Контр-адмирал В. К. Витгефт в Порт-Артуре вступил только во временное командование эскадрой.
С Наместником убыл и капитан I ранга А. А. Эбергард, вот что по этому поводу писал старший артиллерийский офицер броненосца «Пересвет» лейтенант В. Н. Черкасов: «…это последнее больше всего удивило нас, потому что Эбергарт, почти командовавший при Старке эскадрой два года, мог бы нам быть крайне полезен и на него одного возлагались все наши надежды, а теперь мы чувствовали себя покинутыми на произвол судьбы».