Высшим достижением средневековой мысли А. является творчество великого поэта-мыслителя Низами Ганджеви (12 в.). По своим философским воззрениям Низами был идеалистом, но в его мировоззрении содержались элементы стихийной диалектики и материализма. Он сочувственно относился к борьбе угнетённых масс против феодалов, воспевая труд — основу социального равенства. Разуму, идее, слову Низами отводил главную роль в борьбе за всеобщее равенство. Старший современник Низами — поэт Хагани признавал роль ощущений и разума в познании, отрицал мистическую интуицию.
В 11—12 вв. выдвинулась целая плеяда азербайджанских учёных, предпринимавших длительные путешествия по странам Востока и составивших ценные труды по истории, географии, астрономии, медицине. Известный арабский путешественник Якут Хамави называет имена людей, вышедших из Ширвана, Дербента, Салмаса, Мараги, Тебриза и получивших образование в крупных культурных центрах Востока. Бардинец Макки ибн Ахмед путешествовал по Мавераннахру, Хорасану, по свидетельству средневековых авторов он оставил множество книг. Поэт-учёный Хатиб Тебризи (11 в.) преподавал в медресе Низамия в Багдаде. Абубекр Мухаммед Ширвани занимался правоведением.
Монголо-татарское нашествие 13 в. привело к усилению реакции в области общественоой мысли в А. Однако в этот период жил и работал прогрессивный учёный — астроном и математик Насирэддин Туей. В его «Трактате о династиях» изложен утопический проект переустройства экономической политики государства (значительное сокращение налогов и податей, новый принцип установления размеров налога, исходящий из учёта степени доходности земельных участков и имущественного ценза налогоплательщиков). Ему принадлежит идея своеобразной классификации государственных расходов и доходов.
В это же время были сделаны важные шаги в прогрессивном развитии истории познания (созданы летописные исторические сочинения и др.). В труде тебризского историка Фазлаллаха Рашидаддина (13 —14 вв.), известном под названием «Джами аттаварих» («Сборник летописей»), содержатся ценные сведения об экономических и политических событиях в А. и сопредельных странах периода монголо-татарского владычества. Мухаммед Нахичевани (14 в.) составил книгу «Дастур аль-китаб» («Руководство для писца»), в которой приводятся сведения о социально-экономической жизни А. 13—14 вв.
В 14—15 вв. на Ближнем Востоке получает распространение религиозно-философское учение хуруфизм. Крупным представителем этого учения был азербайджанский поэт Имадеддин Несими. Ценный материал по истории и географии А. во 2-й половине 15 в. собран в сочинениях учёного-географа Абдуррашида Бакуви. Знатоком логики, литературы и восточной словесности был уроженец Тебриза Бедреддин Эмир Сеид Ахмед Ляляви. Автором популярного на Востоке труда по этике «Ахлаги-Джелали» был историк и философ Джалаладдин Мухаммед Давани.
В 16 в. в связи с некоторым оживлением экономической жизни происходит известный подъём в области науки и общественной мысли. Поэт М. Физули, в целом не выходя за рамки идеалистического мировоззрения, в своих произведениях высказал ряд прогрессивных идей в области философии, логики и политики; в своём этическом учении он выступал как противник средневекового аскетизма.
В 16 в. усилился интерес к истории и культурному наследию азербайджанского народа. Выдающиеся для этого времени исторические сочинения были созданы Гасанбеком Румлу и Искендером Мюнши (16 —17 вв.). Из обширного труда Румлу «Ахсанат ат-таварих» («Лучшая из историй») сохранилась лишь его часть, охватывающая период 1405—1578. Большую ценность по политической истории А., Ирана и др. сопредельных стран 16—17 вв. представляет труд Мюнши «Тарихи алем-арайи Аббаси» («История украсителя мира Аббаса»). Азербайджанский философ 17 в. Юсиф Мухаммеджан оглы Карабаги, большую часть своей жизни проведший в Самарканде и Бухаре, был известен как автор ряда трактатов по философии и праву.
С образованием на территории А. во 2-й половине 18 в. отдельных феодальных ханств появляются местные хроники. Учёные А. феодальной эпохи собрали ценный фактический материал по истории, географии, литературе и фольклору А. и сопредельных с ним стран. Значительной вехой в становлении исторической науки в А. следует считать появление с конца 18 в. хроник на азербайджанском языке (научные сочинения того времени писались в А. главным образом на языке фарси). Азербайджанский учёный-географ Гаджи Зейналабдин Ширвани в конце 18 — начале 19 вв. предпринял путешествие по странам Востока, результаты которого описал в сочинениях, содержащих ценные сведения по истории, этнографии, культуре народов Ближнего и Среднего Востока, Индии и др. стран.
Новый этап в развитии общественной мысли в А. наступил в 19 в. В результате присоединения А. к России ширятся его связи с русской и мировой наукой и культурой. В этот период в развитии общественных наук в А. происходит заметный качественный сдвиг. А. Бакиханов, впервые привлекший широкий круг источников для написания истории А.М. Казембек (профессор Казанского, а затем Петербургского университетов, виднейший русский востоковед), просветитель М. Топчибашев и др. развивают просветительские и демократические идеи. Поэт М.Ш. Вазех, сторонник свободы для народа, оказал влияние на идейное формирование крупнейшего мыслителя Азербайджана — М.Ф. Ахундова, давшего наиболее цельное изложение системы материалистической философии на Ближнем Востоке. Издатель первой азербайджанской газеты «Экинчи» («Пахарь»), демократ Г. Зардаби выступал против религиозных предрассудков, был сторонником эволюционизма.
В 19 в. на более высокую ступень развития поднялась и азербайджанская историография. Азербайджанские учёные А. Бакиханов, М. Ф. Ахундов и др. предпринимали попытки создать исторические сочинения исследовательского характера, обогащенные новым материалом и охватывающие значительно больший, в сравнении с прежними историческими трудами, территориальный ареал. Наиболее выдающимся трудом по истории Северного А. и Дагестана явился «Гюлистан-Ирам» («Райский цветник») А. Бакиханова.
В 60—80-х гг. 19 в. философия, политическая экономия, история выделяются из общественной мысли в качестве самостоятельных дисциплин с собственным предметом исследования. Разночинцы делают попытки ставить и решать практические вопросы с точки зрения политической экономии, которую М.Ф. Ахундов называл «наукой об управлении и политике», Г. Зардаби — «наукой о коммерции», Н. Везиров — «наукой об экономии времени». Основные экономические вопросы, рассматриваемые ими в тот период,— зависимость уровня прибыли от количества затраченного труда; колебание цен в связи с состоянием спроса и предложения на рынке; роль машины в повышении производительности труда; преимущества крупных предприятий перед мелкими; перелив средств производства и труда из одной отрасли хозяйства в другие и т. п. М. Ф. Ахундов уделял много внимания принципам распределения богатств, предлагая упразднить существовавшее отчисление 1/5 части доходов в пользу духовенства и потомков пророка и обложить все сословия налогом в пользу казны в размере 1/10 части, а сельское население — 1/20 части дохода.