В 10— начале 13 вв. земли, населённые таджиками, входили в состав государств, существовавших на территории Средней Азии (см. Газневиды , Караханидов государство , Гуриды , Каракитаев государство , Хорезм ). Несмотря на постоянные воины, происходил рост городов. В 10—12 вв. имелись рудники по добыче серебра, золота, железной руды и др. Полезные ископаемые и изделия из них вывозились в страны Востока. Развитие производительных сил вело к углублению противоречий феодального общества. Классовая борьба проявлялась в восстаниях и социальных движениях, часто принимавших религиозную окраску.
Вторжение монголо-татарских войск Чингисхана (1219—21) и его сыновей натолкнулось на героическое сопротивление народа (борьба жителей Ходжента, под руководством Тимур-Мелика , восстание в Бухаре в 1238 и др.). Монгольское завоевание сопровождалось истреблением населения, запустением городов и целых областей, уничтожением памятников материальной и духовной культуры. Монголо-татарское иго ухудшило и без того тяжёлое положение трудящихся. Хозяйство начало восстанавливаться лишь во 2-й половине 14 в. Феодальная знать выдвинула Тимура (1336—1405), который, подавив движение сербедаров , провёл серию грабительских войн против соседних стран и создал огромное государство со столицей в Самарканде. В его состав входили Мавераннахр, Хорезм, Афганистан, часть Ирана и др. Руками среднеазиатских и пленных ремесленников Тимур осуществил большое строительство. После смерти Тимура его государство фактически было разделено Тимуридами на два феодальных владения с центрами в Самарканде и Герате. Конце 15 — начале 16 вв. — время максимального для средневековой Средней Азии развития мелкого товарного производства, проникновения денежных отношений. При Тимуридах высокого уровня достигли искусство, наука, литература. В 16 в. территория Т. вошла в состав Шейбанидов государства со столицей Бухарой. После гибели Мухаммеда Шейбани независимыми уделами стали Хорезм, Балх, Бадахшан. Возникло Хивинское ханство . При новой династии — Аштарханидах не прекращалась междоусобная борьба, что привело к распаду государства. В середине 18 в. на территории Ферганы образовалось самостоятельное Кокандское ханство . В 17 — 1-й половине 19 вв. происходила концентрация земель в руках крупных (светских и духовных) феодалов и разорение мелких собственников, феодальная рента была смешанной (натуральная, денежная н отработочная). Особенно тяжёлым было положение крестьян-издольщиков. В 1708—1709 Убайдулла-хан провёл в Бухарском ханстве денежную реформу, вызвавшую широкое недовольство. Начались волнения, которые переросли в восстание против ханской власти. Феодальная раздробленность была серьёзным препятствием на пути экономического и политического развития таджикского народа и ослабляла его перед лицом внешней опасности. Пользуясь ослаблением центральной власти в Бухарском ханстве, частые набеги стали совершать кочевники.
Бухара была завоёвана Ираном в 1740 в правление Надир-шаха . После его смерти (1747) Бухарское ханство освободилось от зависимости; к власти пришла с 1753 династия Мангыт . В 1-й половине 19 в. территория Т. была разделена между Кокандским и Бухарским ханствами. Экономическую основу государств составляли земледелие, основанное главным образом на искусственном орошении, и скотоводство. В Т., как и в др. странах Востока, верховным собственником земли являлось феодальное государство, но существовала и частная собственность на землю. Имелись государственные земли (амлячные, шохи, султаны и пр.); земли крупных духовных феодалов — ишанов (милковые, или милки-хурр); земли, принадлежавшие религиозным учреждениям (вакуфные), закрепленные за населением, платившим за них поземельный налог харадж (хараджные) или десятину (ушр). Луга и пастбища считались общинными, но ими пользовалась преимущественно крупная кочевая аристократия, которая эксплуатировала рядовых скотоводов. Дехкане, владевшие землёй, обрабатывали её, передавали по наследству и даже продавали, хотя по шариату они не были собственниками земли, а скорее временными арендаторами. Самое низшее сословие в государстве составляли рабы. В больших городах существовали специальные базары для продажи рабов. Беспощадная эксплуатация, непосильные налоги, голод, тяжёлый феодальный гнёт неоднократно вызывали народными волнения (восстание в Бухаре 1758 и др.). В начале 19 в. восстания произошли в Ура-Тюбе, Ходженте и др. Большим влиянием в Т. пользовалось мусульманское духовенство, что отрицательно сказывалось на развитии культуры народа. Школа (мектеб ) всецело находилась в руках духовенства, в высших религиозных школах — медресе программа обучения была построена почти целиком на изучении богословской схоластики.