Растущее закрепощение и эксплуатация вызывали протест народных масс (восстание 1687, крестьянско-казацкие выступления в 90-х гг. 17 в., движение под руководством К. Булавина в 1707—08). Положение крестьян на правобережных и западно-украинских землях по-прежнему было тяжёлым. К 4—5-дневной барщине прибавлялись др. повинности в пользу шляхты, администрации, униатской церкви. Украинская культура и православная церковь подвергались преследованиям. Всё это обусловило здесь большой размах освободительного движения (народное восстание 1702—04 во главе с С. Ф. Палием , выступление отрядов повстанцев-гайдамаков в 30—40-х гг., движение опришек под предводительством О. В. Довбуша в Галиции в 30—40-х гг., народное выступления в Закарпатье в 1703— 1711).
Украинское казацкое войско участвовало в крымских (1687 и 1689) и азовских походах 1695—96 русских войск. Заключение мирного договора России с Турцией (1700) на время прекратило грабительские набеги турок и татар на У. Определённую роль сыграло украинское казацкое войско и в 1-м периоде Северной войны 1700—21 . В это время возник заговор части старшинской верхушки против России, возглавленный гетманом Мазепой. Он стремился возвратить Левобережную У. под власть Польши и заключил тайные договоры с Польшей и Швецией, направленные против России. Попытки генерального судьи В. Л. Кочубея и полковника И. И. Искры разоблачить предательство гетмана оказались безуспешными. С вторжением шведских войск на У. (октябрь 1708) на их сторону перешёл Мазепа с частью старшины и небольшим числом казаков (около 2—3 тыс.). Украинский народ остался верен союзу с Россией и начал народную войну против шведских захватчиков. Героически отразили все атаки шведских войск население Полтавы и небольшой гарнизон крепости под командованием полковника А. С. Келина (апрель— июнь 1709). Украинские казацкие полки участвовали в Полтавском сражении 1709 и преследовали шведов до Днепра. Победоносное окончание Северной войны избавило У. от угрозы захвата её иностранными захватчиками. Однако неудачный Прутский поход 1711 заставил Россию на время отказаться от попыток освобождения Правобережной У.
Реформы, проведённые правительством Петра I в России, оказали положительное влияние на У. (началась разведка полезных ископаемых, возникли в 1720—30-х гг. крупные мануфактуры в Ахтырке, Путивле, Почепе, Рясках и др. городах). Вместе с тем царское правительство проводило политику всё большего подчинения У. В связи с изменой Мазепы русские войска в 1709 разгромили Запорожскую Сечь. Бежавшие на территорию Крымского ханства запорожцы образовали там так называемую Алешковскую Сечь. Затем они просили и получили разрешение русского правительства вернуться и в 1734 основали Сечь Новую. В 1709 при гетмане была учреждена должность царского резидента, в 1722 создана Малороссийская коллегия , контролировавшая деятельность гетмана и старшины. После смерти гетмана И. И. Скоропадского (1722) выборы нового гетмана не были разрешены. Управлял У. временный (наказной) гетман П. Л. Полуботок . Обострение отношений с Турцией заставило царское правительство согласиться на избрание гетманом в 1727 Д. П. Апостола . После его смерти (1734) выборы вновь не были разрешены. Управление У. перешло к Правлению гетманского уряда, состоявшего из царских чиновников и старшины. Территория Левобережной У., находившаяся под его управлением, получила название Гетманщина . В 1750 гетманом У. был назначен К. Г. Разумовский . В 1764 царское правительство окончательно упразднило гетманство, и Левобережной У. вновь начала управлять Малороссийская коллегия, которую возглавлял фельдмаршал П. А. Румянцев-Задунайский . Царское правительство в 1775 ликвидировало Новую Сечь. Основную часть её земель оно раздало русским и украинским помещикам. В 1787 было образовано Черноморское казачье войско , переселенное в 1792—93 на Кубань. Группа старшины и казаков, недовольных ликвидацией Сечи, бежала из пределов Российской империи и переселилась в турецкие владения, образовав в низовье Дуная Сечь Задунайскую . В 1781 царское правительство ликвидировало на Левобережье административно-полковое устройство. На Левобережной, Слободской и Южной У. в 80-х гг. 18 в. были созданы Киевское, Черниговское, Новгород-Северское, Харьковское и Екатеринославское наместничества.
2-я четверть 18 в. отмечена дальнейшим закрепощением крестьянства У. Крестьянские переходы всё больше ограничивались.