С альпийским магматизмом связаны гидротермальные месторождения свинцово-цинковых руд (Трепча, Копаоник, Ново-Брдо, Шупля-Стена, Благодать, Леце, рудник Серебрянница и др.), Меди (Бор, Майданпед, Велики-Кривель и др.), сурьмы (Заяча), молибдена (Мачкатица). К известнякам приурочено ртутное месторождение Идрия. Средиземноморская провинция бокситов на территории Ю. протягивается вдоль Адриатического побережья. Известны также месторождения хромитов, железных и марганцевых руд, нефти и газа, бурых углей и лигнитов, руд вольфрама и никеля, асбеста, графита, фосфатов, каменной соли, строительных материалов.
Климат . На большей части страны климат умеренный, континентальный, близ побережья Адриатического моря на Ю. — субтропический, средиземноморский. Динарское нагорье препятствует проникновению тёплых воздушных масс со Средиземного моря во внутренние районы страны. На С. оно образует амфитеатр, в который свободно проникают холодные воздушные массы с С. и С.-В. Поэтому в северных и северо-восточных районах зима холоднее, чем в большинстве других стран Европы на тех же широтах. Средняя температура января на Среднедунайской равнине колеблется от 0 до —3 °С, в горах от —1 до —5 °С, на высоте около 2000 м до —8 °С. Во внутригорных долинах морозы иногда достигают —30 °С. На Адриатическом побережье зима умеренно тёплая, почти без морозов. Средняя температура января от 5 до 9 °С. Лето повсеместно тёплое, местами жаркое. Средняя температура июля на равнинах от 20 до 22 °С, в среднегорьях от 15 до 19 °С, на высоте около 2000 м лишь 10 °С. На Адриатическом побережье и на островах от 22 до 26 °С.
Общие закономерности распределения осадков — возрастание их годового кол-ва с высотой в горах и уменьшение с С.-3. на Ю.-В. На Адриатическом побережье выпадает от 400 до 1400 мм осадков в год, на приморских склонах Динарского нагорья 2500—3000 мм (близ Которской бухты в отдельные годы до 5000 мм — один из самых увлажнённых районов Европы), в межгорных долинах нагорья 700—1500 мм , на Среднедунайской равнине 500—800 мм . В прибрежных районах максимальное количество осадков выпадает весной и осенью, лето сухое; во внутренних горных районах распределение осадков в течение года достаточно равномерно, на Среднедунайской равнине наиболее влажные сезоны — весна и начало лета. Зимой в северной части побережья обычен нисходящий штормовой ветер бора, холодные местные ветры наблюдаются в Воеводине (кошава), Македонии (вардарец). Для прибрежных районов весной характерен тёплый ветер сирокко.
Внутренние воды. 69% территории Ю. принадлежит бассейну Чёрного моря, 21% — бассейну Адриатического моря и около 10% — бассейну Эгейского моря. Отдельные карстовые районы не имеют поверхностного стока. Самая большая река — Дунай протекает по территории Ю. в своём среднем течении. Основные притоки Дуная — Драва, Сава, Морава, Тиса (в Ю.— её нижнее течение). Наиболее значительная река бассейна Адриатического моря — Неретва, Эгейского м. — Вардар (в Ю.— его верхнее и среднее течение). Реки отличаются весенним половодьем (от таяния снегов) и отдельными летними дождевыми паводками. Дунай и его основные притоки судоходны. Ю. богата гидроэнергоресурсами. На Дунае, в ущелье Железные Ворота построена мощная ГЭС Джердап. Используются также гидроэнергоресурсы Неретвы, Дрины и других рек. Самые крупные озёра — Скадарское, Охридское и Преспа расположены в межгорных впадинах по южным и юго-западным границам страны. На Динарском нагорье распространены карстовые озёра, иногда образующие каскады (например, Плитвичские озёра), в отрогах Альп — ледниковые озёра (Блед и др.).
Почвы. В горах преобладают горные бурые лесные почвы, часто щебнистые, или грубоскелетные, в разной степени оподзолейные; в верхнем поясе гор — горно-луговые почвы. Обширные карстовые районы лишены почвенного покрова. В межгорных впадинах местами распространены чернозёмовидные почвы смолницы. Близ Адриатического побережья — участки коричневых почв. На Среднедунайской равнине преобладают чернозёмы в сочетании с аллювиальными луговыми почвами, в значительной степени распаханные.