Субтропические и тропические болота занимают огромные площади во впадине верх. Парагвая, вдоль его среднего течения, в Междуречье и в низинах при слиянии многих рек. Северо-западное и восточное (до 27° ю. ш.) побережья материка часто обрамлены мангровыми зарослями.
Наименее сохранился естественный растительный покров на межандийских плато и внутренних склонах Северных Анд, в Продольной долине Среднего Чили, на восточных склонах Бразильского плоскогорья и особенно в Пампе, полностью распаханной или используемой в качестве пастбищ; в этих же районах наиболее развита эрозия почв. В последние годы хищническая вырубка захватывает даже амазонскую гилею.
Животный мир. Вследствие особенностей палеогеографического развития материка не только флора, но и фауна настолько своеобразна, что Ю. А. (вместе с островами Вест-Индии и Центральной Америкой) выделяется в самостоятельное царство — Неогею с единственной Неотропической областью , которая в Ю. А. представлена двумя подобластями: Гвиано-Бразильской подобластью , или Бразильской, охватывающей большую, северную часть континента и Патагоно-Андийской подобластью , или Чилийской (южные районы равнины и Анды до Экуадора).
В неотропиках характерен ряд эндемичных групп животных: из млекопитающих отряд неполнозубых (семейства ленивцев, муравьедов и броненосцев), группа широконосых обезьян, ряд семейств грызунов, вампиры (из рукокрылых), ламы, целенолесты (из сумчатых), несколько отрядов птиц, а также некоторые пресмыкающиеся, земноводные, рыбы и беспозвоночные. Мало парнокопытных, почти нет насекомоядных, отсутствуют узконосые обезьяны и т. п. Наличие сумчатых, удавы боа и кораллус, двоякодышащие рыбы и др. указывают на древние связки Ю. А. с Мадагаскаром и Австралией. Наиболее богат животный мир влажных экваториальных и тропических лесов. На деревьях обитают многие животные с цепкими хвостами — цебусы, или цепкохвостые обезьяны (ревуны, капуцины, уакари, паукообразная и др.), карликовый и четырёхпалый муравьеды, опоссумы, цепкохвостые дикобразы, кинкажу, ленивцы; обильны мелкие обезьянки семейства игрунковых. Хорошо лазают по деревьям представители кошачьих — ягуар, оцелот. Много рукокрылых. Очень богата орнитофауна (эндемичные туканы, гоацин, гокко, гриф урубу, попугаи ара, амазона и др., многочисленные колибри — в Ю. А. их 319 видов), фауна пресмыкающихся — змей (например, удавы, ядовитые бушмейстер, или суруруку, аспиды, карарака), ящериц (игуаны, сцинки, ядозуб), древесных земноводных и особенно насекомых — фауна бабочек одна из самых богатых к в мире; жуков — 100 тыс. видов (в т. ч. светящийся кукухо и усач-титан, длина до 15 см ). С деревьями связаны и некоторые виды муравьев, например муравьи листорезы. Из паукообразных характерны пауки-птицееды. Из наземных животных — гигантский броненосец, большой муравьед, пекари, тапиры, носухи, кустарниковая собака, грызуны (например, самый крупный на Земле грызун водосвинка, или капибара, морские свинки). В водоёмах обитают ламантины, речной дельфин иния, эндемичные анаконда, кайманы, двоякодышащая рыба лепидосирена, огромная аранайма, хищная пиранья, электрический угорь (около 2000 видов рыб — 1 /3 пресноводной фауны мира).
В субэкваториальной и тропических саваннах и редколесьях преобладают наземные (животные: броненосцы, мелкие олени мазамы, из хищных — пума, саванновая лисица, гривистый волк — на С.; грызуны, страус нанду. На Ю. — в степях и полупустынях — наиболее характерны эндемичные грызуны (морские свинки, болотный бобр, или нутрия, пака, туко-туко, мара, вискаша, агути) и бегающие птицы (паламедеи, тинаму, сев. нанду и нанду Дарвина), а также кондор; из хищников — пампасская кошка и кульпео, вонючка сорильо, очень многочисленна пума, из парнокопытных — пампасский олень, почти истреблены гуанако (семейство верблюдовых), много броненосцев. В лесах Южных Анд особенно типичны небольшие олени пуду и уэмул, лисица кульпео, кошка колоколо, выдра уэльин, а в высокогорьях Центральных Анд — реликтовый очковый медведь и грызун чинчилья. Большое хозяйственное значение в Андах имеют домашние породы лам — лама и альпака (остатки стад диких видов — гуанако и викуньи охраняются). В СССР из Ю. А. интродуцирована нутрия.