Страшный удар по Православному Востоку был нанесен так называемыми "крестовыми походами" - религиозными военными авантюрами властолюбивых Римских пап. Эти западные вторжения под девизом "освобождения Святой Земли от мусульман" принесли несравненно больше вреда не мусульманам, а православным христианам. Впрочем, хищный Запад и не скрывал своих целей: на сейме в Вероне, предшествовавшем Первому "крестовому" походу, была решена "война против сарацин и греков", то есть против мусульман и православных.
Большинство в папских войсках составляли отнюдь не романтики "освобождения Гроба Господня", а различные авантюристы и уголовный сброд; в обозах за ними следовали скупщики награбленного и профессиональные блудницы. Власть "крестоносцев" в Иерусалиме оказалась недолгой, а Латинская империя, созданная ими на Ближнем Востоке, распалась на мелкие княжества. В 1204 году папские бандиты, вместо провозглашенного ими похода в Палестину, вероломно захватили и разрушили Константинополь, Православной Византии был нанесен такой удар, от которого она уже не могла оправиться. Сирийским православным тоже пришлось несладко в Латинском Антиохийском княжестве. Папские "рыцари креста" быстро превратились в "рыцарей наживы", обогащаясь на вывозе в Европу восточных предметов роскоши и наркотиков. Вдобавок рыцарские ордена заразились мрачными магическими культами; храмовники-тамплиеры превратились попросту в сатанистскую секту.
Одним из худших следствий папских военных авантюр было недоверие, на века посеянное между христианским и исламским мирами: в западных агрессорах, называвших себя "христианами", мусульмане увидели своих врагов.
В этот период Хвалисское (Хорезмийское) архиепископство оказалось в духовной изоляции. Ослабели связи с Патриархатами. Крымская митрополия, к которой относился православный Хорезм, была полуразрушена иудаистской Хазарией. Принявшие хорезмийское подданство гузы восприняли Православие, но, к несчастью, не по духу Божественной Любви, а по букве обрядности. Посетивший этот край в 1300 году Гий-хан писал о его жителях: "Они не имеют ни письмен, ни законов, отличаются свирепостью, но соблюдают обряды и церемонии греков". Конечно, никакие "обряды и церемонии" не могли заменить живой веры. И вот уже в середине ХIV века о хорезмийцах говорят, как о "людях без религии".
В Х веке туркмены создали собственное мощное государство. Столица гузских вождей-джабгу находилась в Янгикенте (ныне городище в среднем течении Сырдарьи); границы туркменской державы доходили до областей Шаша (Ташкента), Тараза (Джамбула) и до предгорий Урала. Эта держава имела высокоразвитое государственное устройство. Ближайшим советником джабгу был избранный "кударкин" (премьер-министр), при дворе постоянно действовал совет знатнейших беков и военачальников, для обсуждения особо важных вопросов созывалось народное собрание.
В это время тюрки начали играть все более заметную роль в мусульманском мире, халифат обладал сказочными богатствами, арабы от завоеваний перешли к неге и роскоши, и среди них все меньше находилось желающих вступать в военную службу. Гвардии мусульманских стран формировались уже из тюрок, они становились телохранителями халифов, занимали посты военачальников и видные государственные должности. Этим возвышением выходцев из родственных им народов воспользовалась туркменская династия Сельджукидов, подчинившая себе почти весь мусульманский Восток.
В конце Х века Сельджук, вождь туркменского племени канык, поднимает восстание против янгикентских джабгу. Повстанцы по имени своего предводителя начинают называть себя "сельджуками", как бы отделяя себя этим от всех остальных туркмен. В Маверроунахре сельджуки терпят поражение, но вторгаются в Хорасан и Хорезм, где находят себе новых сторонников. В 1038 году Сельджук провозглашен султаном в Нишапуре, а его брат Чагры-бек - в Мерве. Сельджук имел крещеного сына Михаила, вероятно, когда-то был крещен и сам, - но перешел в мусульманство и сделал Ислам знаменем своих завоевательных походов, которыми начинается создание новой гигантской империи. Султаны-Сельджукиды подчиняют себе Туркменистан, Хорезм, Азербайджан, Армению, Сирию, Маверроунахр, Ирак, Афганистан, Персию, предпринимают походы на Египет, доходят до Испании, овладевают столицей халифата - Багдадом. При Сельджукидах в мусульманской империи окончательно оформляется разграничение светской и духовной власти: султан оказывает халифу всяческий почет и признает его верховенство в религиозных вопросах, но государственные дела вершит без его участия.
К христианам сельджукские правители относились соответственно традициям халифата: не просто терпимо, но и покровительственно, помогая им и в строительстве храмов, и в нуждах монастырей. Особой благотворительностью такого рода отличался султан Мелек, самый могущественный из Сельджукидов, который был женат на православной царевне, дочери Византийского императора Романа Диогена. Мелек-султан распорядился восстановить историческую справедливость: вернуть несторианам храмовые здания, отнятые у них при Саманидах, даже те, которые уже были обращены в мечети.
Исконные земли туркмен оказываются на территории могучей империи Сельджукидов; в Туркменистане сельджукские вельможи возводят роскошные дворцы, караван-сараи, усыпальницы (среди них - один из прекраснейших памятников мусульманского зодчества, мавзолей султана Санджара). Все шире распространяется образованность, и все больше становится проповедников мусульманства, говорящих не на арабском, а на туркменском языке. Гузы, чье восприятие христианства было лишь поверхностным, массово принимают государственную религию султаната - Ислам.
Вопреки сообщениям источников римо-католических, проникнутых ненавистью ко всему мусульманскому, и византийских, чьи владения захватывали сельджуки, - наиболее осведомленные современники, в их числе и христиане, единодушно свидетельствуют о благодетельности правления султанов-Сельджукидов и их наместников. Сельджукские правители заботились о неимущих, занимались упорядочением ремесел и сельского хозяйства; об одном из таких наместников пишут - "запретил притеснения, принудительный труд и тяготы по отношению к подданным", о другом - "навел такой порядок, что по всей области никто не запирал двери домов, а орудия труда оставались спокойно в поле". Так что визирь Сельджукидов, выдающийся мыслитель Низам аль-Мульк составлял свою теорию просвещенной монархии не путем абстракций, а вглядываясь в реальные достижения султаната.
Великая историческая заслуга сельджуков в том, что они отстояли страны Востока от нашествия папских "крестоносцев": отстояли не только Ислам, но и Православные Патриархаты. Л. Н. Гумилев констатирует: "Наступление латинян на Православие было остановлено тюрками". После захвата Константинополя папскими бандитами именно сельджуки преградили им дальнейший путь в Малую Азию. Овез Гундогдыев пишет: "Сельджуки не только спасли Восток от разграбления, они спасли весь исламский мир и саму мусульманскую веру. Их заслуга состоит также в том, что они вместе с кыпчаками (половцами) защитили Православную Церковь, взяли православных под свою защиту".
Сельджуки стали этнической основой для формирования турецкого и азербайджанского (азери-тюркского) этносов, создали предпосылки для создания Турецкого султаната. Однако нужно сказать, что сельджуки забыли народ, из которого вышли, отгородились от остальных туркмен стеной высокомерия, начали даже измышлять легенды об особом "благородстве" своего происхождения. По свидетельству Абулгази-хана: "Сельджуки говорили, что они братья туркмен, но народу и племени пользы не принесли. До того времени, пока они не возвысились, они говорили, что принадлежат к туркменскому роду кынык. А когда они стали царить, они заявили, что вышли из рода Афрасиаба".
Туркмены не пожелали терпеть спесивое властвование своих бывших соотечественников. Начиная с середины ХII века восстания гузов сметают сельджукских наместников с земель Туркменистана. Гузы устанавливают свою власть в Маргиане, затем - в Хорасане. Однако сравнительно небольшие государства туркмен оказываются нестойкими, и вскоре правители Хорезма присоединяют Туркменистан к своим владениям.